seq1 = pF1KE6620.tfa, 981 bp
seq2 = pF1KE6620/gi568815588f_97484704.tfa (gi568815588f:97484704_97711656), 226953 bp

>pF1KE6620 981
>gi568815588f:97484704_97711656 (Chr10)

1-211  (100001-100211)   100% ->
212-340  (114072-114200)   100% ->
341-468  (114386-114513)   100% ->
469-603  (114977-115111)   100% ->
604-700  (115364-115460)   100% ->
701-834  (117154-117287)   100% ->
835-981  (126807-126953)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTGGGTCCCCAAGTCTGGTCTTCTGTGAGGCAGGGGCTAAGCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTGGGTCCCCAAGTCTGGTCTTCTGTGAGGCAGGGGCTAAGCAGGAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTGTCCAGGAATGTGGGGGTCTGGGCCTCAGGGGAGGGGAAGAAGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTGTCCAGGAATGTGGGGGTCTGGGCCTCAGGGGAGGGGAAGAAGGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACATTGCGGGTATCTACCCCCCTGTGACCACCCCCTTCACTGCCACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACATTGCGGGTATCTACCCCCCTGTGACCACCCCCTTCACTGCCACTGCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGTGGACTATGGGAAACTGGAGGAGAATCTGCACAAACTGGGCACCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGTGGACTATGGGAAACTGGAGGAGAATCTGCACAAACTGGGCACCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCCCTTCCGAG         GCTTCGTGGTCCAGGGCTCCAATGGCGAGT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CCCCTTCCGAGGTA...CAGGCTTCGTGGTCCAGGGCTCCAATGGCGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TTCCTTTCCTGACCAGCAGTGAGCGCCTCGAGGTGGTGAGCCGTGTGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114102 TTCCTTTCCTGACCAGCAGTGAGCGCCTCGAGGTGGTGAGCCGTGTGCGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CAGGCCATGCCCAAGAACAGGCTCCTGCTAGCTGGCTCCGGATGCGAGT 
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>
 114152 CAGGCCATGCCCAAGAACAGGCTCCTGCTAGCTGGCTCCGGATGCGAGTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    341         CCACTCAAGCCACAGTGGAGATGACCGTCAGCATGGCCCAGG
        >>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114202 TG...CAGCCACTCAAGCCACAGTGGAGATGACCGTCAGCATGGCCCAGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TCGGGGCTGACGCGGCCATGGTGGTGACCCCTTGCTACTATCGTGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114428 TCGGGGCTGACGCGGCCATGGTGGTGACCCCTTGCTACTATCGTGGCCGC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATGAGCAGTGCGGCCCTCATTCACCACTACACCAAG         GTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 114478 ATGAGCAGTGCGGCCCTCATTCACCACTACACCAAGGTG...CAGGTTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGATCTCTCTCCAATCCCTGTGGTGCTGTACAGTGTCCCAGCCAACACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114982 TGATCTCTCTCCAATCCCTGTGGTGCTGTACAGTGTCCCAGCCAACACAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGCTGGACCTGCCTGTGGATGCAGTGGTCACGCTTTCCCAGCACCCGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115032 GGCTGGACCTGCCTGTGGATGCAGTGGTCACGCTTTCCCAGCACCCGAAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ATTGTGGGCATGAAGGACAGCGGTGGTGAT         GTGACCAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 115082 ATTGTGGGCATGAAGGACAGCGGTGGTGATGTG...CAGGTGACCAGGAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TGGGCTGATTGTTCACAAGACCAGGAAGCAGGATTTTCAGGTGTTGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115375 TGGGCTGATTGTTCACAAGACCAGGAAGCAGGATTTTCAGGTGTTGGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 GATCGGCTGGCTTTCTGATGGCCAGCTATGCCTTGG         GAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 115425 GATCGGCTGGCTTTCTGATGGCCAGCTATGCCTTGGGTA...CAGGAGCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GTGGGGGGCGTCTGCGCCCTGGCCAATGTCCTGGGGGCTCAGGTGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117159 GTGGGGGGCGTCTGCGCCCTGGCCAATGTCCTGGGGGCTCAGGTGTGCCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 GCTGGAGCGACTGTGCTGCACGGGGCAATGGGAAGATGCCCAGAAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117209 GCTGGAGCGACTGTGCTGCACGGGGCAATGGGAAGATGCCCAGAAACTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AGCACCGCCTCATTGAGCCAAACGCTGCG         GTGACCCGGCGC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 117259 AGCACCGCCTCATTGAGCCAAACGCTGCGGTG...CAGGTGACCCGGCGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 TTTGGGATCCCAGGGCTGAAGAAAATCATGGACTGGTTTGGCTACTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126819 TTTGGGATCCCAGGGCTGAAGAAAATCATGGACTGGTTTGGCTACTATGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 AGGCCCCTGCCGCGCACCCTTGCAGGAGCTGAGCCCCGCTGAGGAGGAGG
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126869 AGGCCCCTGCCGCGCCCCCTTGCAGGAGCTGAGCCCCGCTGAGGAGGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .
    947 CACTGCGCATGGATTTCACCAGCAACGGCTGGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126919 CACTGCGCATGGATTTCACCAGCAACGGCTGGCTC