seq1 = pF1KE6618.tfa, 891 bp
seq2 = pF1KE6618/gi568815581f_63501084.tfa (gi568815581f:63501084_63707999), 206916 bp

>pF1KE6618 891
>gi568815581f:63501084_63707999 (Chr17)

1-280  (100001-100280)   100% ->
281-387  (103451-103557)   100% ->
388-515  (105230-105357)   100% ->
516-693  (106204-106381)   100% ->
694-891  (106719-106916)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCGGCTTGGGCTGCTGCCAGCCTAAGCAGGGCCGCTGCCCGATGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCGGCTTGGGCTGCTGCCAGCCTAAGCAGGGCCGCTGCCCGATGCTT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGCACGAGGCCCCGGGGTCAGGGCGGCTCCTCCGCGCGACCCCCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGCACGAGGCCCCGGGGTCAGGGCGGCTCCTCCGCGCGACCCCCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCTCCCACCCCGAGCCCCGGGGCTGCGGTGCCGCTCCGGGCAGGACGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCTCCCACCCCGAGCCCCGGGGCTGCGGTGCCGCTCCGGGCAGGACGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CACTTTACCGCGGCTGTCCCCGCCGGGCACAACAAGTGGTCCAAAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CACTTTACCGCGGCTGTCCCCGCCGGGCACAACAAGTGGTCCAAAGTCAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCACATCAAGGGTCCGAAGGACGTCGAAAGGAGTCGCATCTTCTCCAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCACATCAAGGGTCCGAAGGACGTCGAAAGGAGTCGCATCTTCTCCAAAC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCTGTTTGAACATCCGCCTGGCAGTGAAAG         AAGGAGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 100251 TCTGTTTGAACATCCGCCTGGCAGTGAAAGGTG...CAGAAGGAGGCCCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AACCCTGAGCACAACAGCAACCTGGCCAATATCTTAGAGGTGTGTCGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103462 AACCCTGAGCACAACAGCAACCTGGCCAATATCTTAGAGGTGTGTCGCAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CAAACATATGCCCAAGTCAACGATTGAGACAGCACTGAAAATGGAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 103512 CAAACATATGCCCAAGTCAACGATTGAGACAGCACTGAAAATGGAGGTG.

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    388      AAATCCAAGGACACTTATTTGCTGTATGAGGGTCGAGGCCCTGGT
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103562 ..CAGAAATCCAAGGACACTTATTTGCTGTATGAGGGTCGAGGCCCTGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GGCTCTTCTCTGCTCATCGAGGCATTATCTAACAGTAGCCACAAGTGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105275 GGCTCTTCTCTGCTCATCGAGGCATTATCTAACAGTAGCCACAAGTGCCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AGCAGACATTAGACATATCCTGAATAAGAATGG         AGGAGTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 105325 AGCAGACATTAGACATATCCTGAATAAGAATGGGTA...CAGAGGAGTGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGGCTGTAGGAGCTCGTCACTCTTTTGACAAAAAGGGGGTGATTGTGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106212 TGGCTGTAGGAGCTCGTCACTCTTTTGACAAAAAGGGGGTGATTGTGGTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GAAGTGGAGGACAGAGAGAAGAAGGCTGTGAACCTAGAGCGTGCCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106262 GAAGTGGAGGACAGAGAGAAGAAGGCTGTGAACCTAGAGCGTGCCCTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GATGGCAATCGAAGCAGGAGCTGAGGATGTCAAGGAAACTGAAGATGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106312 GATGGCAATCGAAGCAGGAGCTGAGGATGTCAAGGAAACTGAAGATGAAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AAGAAAGGAACGTTTTTAAA         TTTATTTGTGATGCCTCTTCA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 106362 AAGAAAGGAACGTTTTTAAAGTA...TAGTTTATTTGTGATGCCTCTTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CTGCACCAAGTGAGGAAGAAGCTGGACTCCCTGGGCCTGTGTTCTGTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106740 CTGCACCAAGTGAGGAAGAAGCTGGACTCCCTGGGCCTGTGTTCTGTGTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTGTGCACTAGAGTTCATCCCCAACTCAAAGGTGCAGCTGGCTGAGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106790 CTGTGCACTAGAGTTCATCCCCAACTCAAAGGTGCAGCTGGCTGAGCCCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACCTGGAACAGGCCGCACATCTCATTCAGGCTCTCAGCAACCACGAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106840 ACCTGGAACAGGCCGCACATCTCATTCAGGCTCTCAGCAACCACGAGGAT

    900     .    :    .    :    .
    865 GTGATTCACGTCTATGATAACATTGAA
        |||||||||||||||||||||||||||
 106890 GTGATTCACGTCTATGATAACATTGAA