seq1 = pF1KE6616.tfa, 1005 bp
seq2 = pF1KE6616/gi568815587r_62515704.tfa (gi568815587r:62515704_62721947), 206244 bp

>pF1KE6616 1005
>gi568815587r:62515704_62721947 (Chr11)

(complement)

1-82  (100001-100082)   100% ->
83-257  (101277-101451)   100% ->
258-618  (104601-104961)   100% ->
619-909  (105152-105442)   100% ->
910-1005  (106149-106244)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCTGAAGCTGAAGAACGTGTTTCTCGCCTACTTCCTGGTGTCGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCTGAAGCTGAAGAACGTGTTTCTCGCCTACTTCCTGGTGTCGAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCGGCCTCCTCTACGCGCTGGTACAGCTCG         GCCAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 100051 CGCCGGCCTCCTCTACGCGCTGGTACAGCTCGGTG...CAGGCCAGCCAT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GTGACTGCCTTCCTCCCCTGCGGGCAGCAGCCGAGCAGCTACGGCAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101286 GTGACTGCCTTCCTCCCCTGCGGGCAGCAGCCGAGCAGCTACGGCAGAAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GATCTGAGGATTTCCCAGCTGCAAGCGGAACTCCGACGGCCACCCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101336 GATCTGAGGATTTCCCAGCTGCAAGCGGAACTCCGACGGCCACCCCCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCTGCCCAGCCCCCTGAACCCGAGGCCCTGCCTACTATCTATGTTGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101386 CCCTGCCCAGCCCCCTGAACCCGAGGCCCTGCCTACTATCTATGTTGTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCCCCACCTATGCCAG         GCTGGTACAGAAGGCAGAGCTGGTA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101436 CCCCCACCTATGCCAGGTA...CAGGCTGGTACAGAAGGCAGAGCTGGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CGACTGTCCCAGACACTGAGCCTGGTGCCCCGGCTGCATTGGCTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104626 CGACTGTCCCAGACACTGAGCCTGGTGCCCCGGCTGCATTGGCTGCTGGT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GGAGGATGCTGAGGGTCCCACCCCGCTGGTCTCAGGGCTGCTGGCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104676 GGAGGATGCTGAGGGTCCCACCCCGCTGGTCTCAGGGCTGCTGGCTGCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGGCCTCCTCTTCACACACCTGGTGGTCCTCACGCCCAAAGCCCAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104726 CTGGCCTCCTCTTCACACACCTGGTGGTCCTCACGCCCAAAGCCCAGCGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTTCGGGAGGGCGAGCCTGGCTGGGTTCATCCCCGTGGTGTCGAGCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104776 CTTCGGGAGGGCGAGCCTGGCTGGGTTCATCCCCGTGGTGTCGAGCAGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GAACAAGGCCCTGGACTGGCTCCGGGGCAGAGGGGGTGCTGTGGGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104826 GAACAAGGCCCTGGACTGGCTCCGGGGCAGAGGGGGTGCTGTGGGTGGGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 AGAAGGACCCACCACCACCAGGGACCCAAGGAGTCGTCTACTTTGCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104876 AGAAGGACCCACCACCACCAGGGACCCAAGGAGTCGTCTACTTTGCTGAC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 GATGACAACACCTACAGCCGGGAGCTGTTTGAGGAG         ATGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 104926 GATGACAACACCTACAGCCGGGAGCTGTTTGAGGAGGTG...TAGATGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 CTGGACCCGTGGTGTCTCAGTGTGGCCTGTGGGGCTGGTGGGCGGCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105157 CTGGACCCGTGGTGTCTCAGTGTGGCCTGTGGGGCTGGTGGGCGGCCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 GATTCGAGGGCCCTCAGGTACAGGACGGCCGGGTAGTGGGCTTCCACACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105207 GATTCGAGGGCCCTCAGGTACAGGACGGCCGGGTAGTGGGCTTCCACACA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 GCATGGGAGCCCAGCAGGCCCTTCCCTGTGGATATGGCTGGATTTGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105257 GCATGGGAGCCCAGCAGGCCCTTCCCTGTGGATATGGCTGGATTTGCCGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    774 GGCCCTGCCCTTGCTGTTAGATAAGCCCAATGCCCAATTTGATTCCACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105307 GGCCCTGCCCTTGCTGTTAGATAAGCCCAATGCCCAATTTGATTCCACCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 CTCCCCGGGGCCACCTGGAGAGCAGTCTTCTGAGCCACCTTGTGGATCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105357 CTCCCCGGGGCCACCTGGAGAGCAGTCTTCTGAGCCACCTTGTGGATCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 AAGGACCTGGAGCCACGGGCTGCCAACTGCACTCGG         GTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 105407 AAGGACCTGGAGCCACGGGCTGCCAACTGCACTCGGGTA...CAGGTACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 GGTGTGGCATACTCGGACAGAGAAGCCCAAGATGAAGCAGGAGGAGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106154 GGTGTGGCATACTCGGACAGAGAAGCCCAAGATGAAGCAGGAGGAGCAGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :
    965 TGCAGCGGCAGGGCCGGGGCTCAGACCCAGCAATTGAGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106204 TGCAGCGGCAGGGCCGGGGCTCAGACCCAGCAATTGAGGTG