seq1 = pF1KE6611.tfa, 801 bp
seq2 = pF1KE6611/gi568815587f_60397319.tfa (gi568815587f:60397319_60607121), 209803 bp

>pF1KE6611 801
>gi568815587f:60397319_60607121 (Chr11)

1-276  (100001-100276)   100% ->
277-414  (103727-103864)   100% ->
415-471  (104665-104721)   100% ->
472-588  (106383-106499)   100% ->
589-699  (109410-109520)   99% ->
700-801  (109702-109803)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATGTCATCCAAGCCAACAAGCCATGCTGAAGTAAATGAAACCATACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATGTCATCCAAGCCAACAAGCCATGCTGAAGTAAATGAAACCATACC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAACCCTTACCCACCAAGCAGCTTTATGGCTCCTGGATTTCAACAGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAACCCTTACCCACCAAGCAGCTTTATGGCTCCTGGATTTCAACAGCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGGTTCAATCAACTTAGAAAACCAAGCTCAGGGTGCTCAGCGTGCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGGTTCAATCAACTTAGAAAACCAAGCTCAGGGTGCTCAGCGTGCTCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CCCTACGGCATCACATCTCCGGGAATCTTTGCTAGCAGTCAACCGGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CCCTACGGCATCACATCTCCGGGAATCTTTGCTAGCAGTCAACCGGGTCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGGAAATATACAAATGATAAATCCAAGTGTGGGAACAGCAGTAATGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGGAAATATACAAATGATAAATCCAAGTGTGGGAACAGCAGTAATGAACT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTAAAGAAGAAGCAAAGGCACTAGGG         GTGATCCAGATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 100251 TTAAAGAAGAAGCAAAGGCACTAGGGGTA...CAGGTGATCCAGATCATG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GTTGGATTGATGCACATTGGTTTTGGAATTGTTTTGTGTTTAATATCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103742 GTTGGATTGATGCACATTGGTTTTGGAATTGTTTTGTGTTTAATATCCTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CTCTTTTAGAGAAGTATTAGGTTTTGCCTCTACTGCTGTTATTGGTGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103792 CTCTTTTAGAGAAGTATTAGGTTTTGCCTCTACTGCTGTTATTGGTGGAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACCCATTCTGGGGTGGCCTTTCT         TTTATTATCTCTGGCTCT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 103842 ACCCATTCTGGGGTGGCCTTTCTGTG...CAGTTTATTATCTCTGGCTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CTCTCTGTGTCAGCATCCAAGGAGCTTTCCCGTTGTCTG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 104683 CTCTCTGTGTCAGCATCCAAGGAGCTTTCCCGTTGTCTGGTA...TAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GAAAGGCAGCCTGGGAATGAACATTGTTAGTTCTATCTTGGCCTTCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106385 GAAAGGCAGCCTGGGAATGAACATTGTTAGTTCTATCTTGGCCTTCATTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GAGTGATTCTGCTGCTGGTGGATATGTGCATCAATGGGGTAGCTGGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106435 GAGTGATTCTGCTGCTGGTGGATATGTGCATCAATGGGGTAGCTGGCCAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GACTACTGGGCCGTG         CTTTCTGGAAAAGGCATTTCAGCCAC
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 106485 GACTACTGGGCCGTGGTA...CAGCTTTCTGGAAAAGGCATTTCAGCCAC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCTGATGATCTTCTCCCTCTTGGAGTTCTTCGTAGCTTGTGCCACAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109436 GCTGATGATCTTCTCCCTCTTGGAGTTCTTCGTAGCTTGTGCCACAGCCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATTTTGCCAACCAAGCAAACACCACAACTAATATG         TCTGTC
        |||||||||||||||||||||||||||| ||||||>>>...>>>||||||
 109486 ATTTTGCCAACCAAGCAAACACCACAACCAATATGGTG...CAGTCTGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CTGGTTATTCCAAATATGTATGAAAGCAACCCTGTGACACCAGCGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109708 CTGGTTATTCCAAATATGTATGAAAGCAACCCTGTGACACCAGCGTCTTC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    756 TTCAGCTCCTCCCAGATGCAACAACTACTCAGCTAATGCCCCTAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109758 TTCAGCTCCTCCCAGATGCAACAACTACTCAGCTAATGCCCCTAAA