seq1 = pF1KE6590.tfa, 543 bp
seq2 = pF1KE6590/gi568815593f_150748124.tfa (gi568815593f:150748124_150948666), 200543 bp

>pF1KE6590 543
>gi568815593f:150748124_150948666 (Chr5)

1-543  (100001-100543)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAGCCATGAATGTTGAGAAAGCCTCAGCAGATGGGAACTTGCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAGCCATGAATGTTGAGAAAGCCTCAGCAGATGGGAACTTGCCAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTGATCTCTAACATCAAGGAGACTCTGAAGATAGTGTCCAGGACACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTGATCTCTAACATCAAGGAGACTCTGAAGATAGTGTCCAGGACACCAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TTAACATCACTATGGCAGGGGACTCTGGCAATGGGATGTCCACCTTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TTAACATCACTATGGCAGGGGACTCTGGCAATGGGATGTCCACCTTCATC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGTGCCCTTCGAAACACAGGACATGAGGGTAAGGCCTCACCTCCTACTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGTGCCCTTCGAAACACAGGACATGAGGGTAAGGCCTCACCTCCTACTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGGTAAAAGCTACCCAAAGATGTGCCTCCTATTTCTCTTCCCACTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGGTAAAAGCTACCCAAAGATGTGCCTCCTATTTCTCTTCCCACTTTT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAAATGTGGTGTTGTGGGACCTGCCTGGCACAGGGTCTGCCACCACAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CAAATGTGGTGTTGTGGGACCTGCCTGGCACAGGGTCTGCCACCACAACC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTGGAGAACTACCTGATGGAAATGCAGTTCAACCGGTATGACTTCATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTGGAGAACTACCTGATGGAAATGCAGTTCAACCGGTATGACTTCATCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GGTTGCATCTGCACAATTCAGCATGAATCATGTGATGCTTGCCAAAACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTTGCATCTGCACAATTCAGCATGAATCATGTGATGCTTGCCAAAACCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 CTGAGGACATGGGAAAGAAGTTCTACATTGTCTGGACCAAGCTAGACATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 CTGAGGACATGGGAAAGAAGTTCTACATTGTCTGGACCAAGCTAGACATG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GACCTCAGCACAGGTGCCCTCCCAGAAGTGCAGCTACTGCAGATCAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GACCTCAGCACAGGTGCCCTCCCAGAAGTGCAGCTACTGCAGATCAGAGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AAATGTCCTGGAAAATCTCCAGAAGGAGCGGGTATGTGAATAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AAATGTCCTGGAAAATCTCCAGAAGGAGCGGGTATGTGAATAC