seq1 = pF1KE6579.tfa, 432 bp
seq2 = pF1KE6579/gi568815586f_49223609.tfa (gi568815586f:49223609_49424249), 200641 bp

>pF1KE6579 432
>gi568815586f:49223609_49424249 (Chr12)

1-144  (100001-100144)   100% ->
145-337  (100237-100429)   100% ->
338-432  (100547-100641)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACCACCCGGCAAGCCACGAAGGATCCCCTCCTCCGGGGTGTATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACCACCCGGCAAGCCACGAAGGATCCCCTCCTCCGGGGTGTATCTCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TACCCCTAGCAAGATTCCGGTACGCTCTCAGAAACGCACGCCTTTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TACCCCTAGCAAGATTCCGGTACGCTCTCAGAAACGCACGCCTTTCCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGTTACATCGTGCGCCGTGGACCAGGAGAACCAAGATCCAAGG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 100101 CTGTTACATCGTGCGCCGTGGACCAGGAGAACCAAGATCCAAGGGTA...

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    145    AGATGGGTGCAGAAACCACCGCTCAATATTCAACGCCCCCTCGTTGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100234 TAGAGATGGGTGCAGAAACCACCGCTCAATATTCAACGCCCCCTCGTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TTCAGCAGGCCCCAGGCCGAAAGCCAGGCACCAGGCAGAGACATCACAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100284 TTCAGCAGGCCCCAGGCCGAAAGCCAGGCACCAGGCAGAGACATCACAAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GATTGGTGGGGATCAGTCAGCCTCGGAACCCCTTGGAAGAGCTCAGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100334 GATTGGTGGGGATCAGTCAGCCTCGGAACCCCTTGGAAGAGCTCAGGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AGCCCTAGGGGTCAAAATGTGGGGCCTGGGCCCCCTGCCCAGACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100384 AGCCCTAGGGGTCAAAATGTGGGGCCTGGGCCCCCTGCCCAGACAGGTA.

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    338      TCCTGGTCCCAGCTCCTGGAAAGCTCTTTGCTCTTAGAAGATCTC
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100434 ..TAGTCCTGGTCCCAGCTCCTGGAAAGCTCTTTGCTCTTAGAAGATCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCTTTCCTCCAGCAAAATGTCATCTCGCCAGGTGCCATGGCTTGTACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100592 CCTTTCCTCCAGCAAAATGTCATCTCGCCAGGTGCCATGGCTTGTACCTG