seq1 = pF1KE6573.tfa, 603 bp
seq2 = pF1KE6573/gi568815596r_86132624.tfa (gi568815596r:86132624_86382242), 249619 bp

>pF1KE6573 603
>gi568815596r:86132624_86382242 (Chr2)

(complement)

1-32  (44733-44764)   100% ->
33-105  (100001-100073)   100% ->
106-182  (118202-118278)   100% ->
183-303  (127429-127549)   99% ->
304-417  (130173-130286)   100% ->
418-596  (149441-149619)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGTCATGGATCATCTCCAGGCTGGTGGT         GCTTATATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
  44733 ATGGTGTCATGGATCATCTCCAGGCTGGTGGTGTA...CAGGCTTATATT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGGCACCCTTTACCCTGCGTATTATTCCTACAAGGCTGTGAAATCAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100010 TGGCACCCTTTACCCTGCGTATTATTCCTACAAGGCTGTGAAATCAAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACATTAAGGAATAT         GTCAAATGGATGATGTACTGGATTATA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100060 ACATTAAGGAATATGTA...CAGGTCAAATGGATGATGTACTGGATTATA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 TTTGCACTTTTCACCACAGCAGAGACATTCACAGACATCTTCCTTTGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118229 TTTGCACTTTTCACCACAGCAGAGACATTCACAGACATCTTCCTTTGTTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183          GTTTCCATTCTATTATGAACTAAAAATAGCATTTGTAGCCT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118279 GTA...CAGGTTTCCATTCTATTATGAACTAAAAATAGCATTTGTAGCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 GGCTGCTGTCTCCCTACACAAAAGGCTCCAGCCTCCTGTACAGGAAGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 127470 GGCTGCTGTCTCCCTACACAAAAGGCTCCAGCCTCCTGTACAGGAAGTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 GTACATCCCACACTATCTTCAAAAGAAAAG         GAAATCGATGA
        ||||||||||| ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 127520 GTACATCCCACGCTATCTTCAAAAGAAAAGGTA...CAGGAAATCGATGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 TTGTCTGGTCCAAGCAAAAGACCGAAGTTACGATGCCCTTGTGCACTTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130184 TTGTCTGGTCCAAGCAAAAGACCGAAGTTACGATGCCCTTGTGCACTTCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 GGAAGCGGGGCTTGAACGTGGCCGCCACAGCGGCTGTGATGGCTGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130234 GGAAGCGGGGCTTGAACGTGGCCGCCACAGCGGCTGTGATGGCTGCTTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAG         GGACAGGGTGCCTTATCGGAGAGACTGCGGAGCTTCAG
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130284 AAGGTA...CAGGGACAGGGTGCCTTATCGGAGAGACTGCGGAGCTTCAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CATGCAGGACCTCACCACCATCAGGGGAGACGGCGCCCCTGCTCCCTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149479 CATGCAGGACCTCACCACCATCAGGGGAGACGGCGCCCCTGCTCCCTCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GCCCCCCACCACCGGGGTCTGGGCGGGCCAGCGGCAAACACGGCCAGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149529 GCCCCCCACCACCGGGGTCTGGGCGGGCCAGCGGCAAACACGGCCAGCCT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :
    556 AAGATGTCCAGGAGTGCTTCTGAGAGCGCTAGCAGCTCAGG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149579 AAGATGTCCAGGAGTGCTTCTGAGAGCGCTAGCAGCTCAGG