seq1 = pF1KE6569.tfa, 639 bp
seq2 = pF1KE6569/gi568815581r_43655345.tfa (gi568815581r:43655345_43858741), 203397 bp

>pF1KE6569 639
>gi568815581r:43655345_43858741 (Chr17)

(complement)

1-220  (100001-100220)   100% ->
221-639  (102979-103397)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGCTCCCACTGGCCCTGTGTCTCGTCTGCCTGCTGGTACACACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGCTCCCACTGGCCCTGTGTCTCGTCTGCCTGCTGGTACACACAGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCGTGTAGTGGAGGGCCAGGGGTGGCAGGCGTTCAAGAATGATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCGTGTAGTGGAGGGCCAGGGGTGGCAGGCGTTCAAGAATGATGCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGGAAATCATCCCCGAGCTCGGAGAGTACCCCGAGCCTCCACCGGAGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGGAAATCATCCCCGAGCTCGGAGAGTACCCCGAGCCTCCACCGGAGCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGAACAACAAGACCATGAACCGGGCGGAGAACGGAGGGCGGCCTCCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGAACAACAAGACCATGAACCGGGCGGAGAACGGAGGGCGGCCTCCCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CCACCCCTTTGAGACCAAAG         ACGTGTCCGAGTACAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100201 CCACCCCTTTGAGACCAAAGGTA...CAGACGTGTCCGAGTACAGCTGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCGAGCTGCACTTCACCCGCTACGTGACCGATGGGCCGTGCCGCAGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103000 GCGAGCTGCACTTCACCCGCTACGTGACCGATGGGCCGTGCCGCAGCGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 AAGCCGGTCACCGAGCTGGTGTGCTCCGGCCAGTGCGGCCCGGCGCGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103050 AAGCCGGTCACCGAGCTGGTGTGCTCCGGCCAGTGCGGCCCGGCGCGCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GCTGCCCAACGCCATCGGCCGCGGCAAGTGGTGGCGACCTAGTGGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103100 GCTGCCCAACGCCATCGGCCGCGGCAAGTGGTGGCGACCTAGTGGGCCCG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 ACTTCCGCTGCATCCCCGACCGCTACCGCGCGCAGCGCGTGCAGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103150 ACTTCCGCTGCATCCCCGACCGCTACCGCGCGCAGCGCGTGCAGCTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TGTCCCGGTGGTGAGGCGCCGCGCGCGCGCAAGGTGCGCCTGGTGGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103200 TGTCCCGGTGGTGAGGCGCCGCGCGCGCGCAAGGTGCGCCTGGTGGCCTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GTGCAAGTGCAAGCGCCTCACCCGCTTCCACAACCAGTCGGAGCTCAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103250 GTGCAAGTGCAAGCGCCTCACCCGCTTCCACAACCAGTCGGAGCTCAAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ACTTCGGGACCGAGGCCGCTCGGCCGCAGAAGGGCCGGAAGCCGCGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103300 ACTTCGGGACCGAGGCCGCTCGGCCGCAGAAGGGCCGGAAGCCGCGGCCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    592 CGCGCCCGGAGCGCCAAAGCCAACCAGGCCGAGCTGGAGAACGCCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103350 CGCGCCCGGAGCGCCAAAGCCAACCAGGCCGAGCTGGAGAACGCCTAC