seq1 = pF1KE6561.tfa, 480 bp
seq2 = pF1KE6561/gi568815581r_15130920.tfa (gi568815581r:15130920_15360727), 229808 bp

>pF1KE6561 480
>gi568815581r:15130920_15360727 (Chr17)

(complement)

1-78  (100001-100078)   100% ->
79-178  (101535-101634)   100% ->
179-319  (121117-121257)   100% ->
320-480  (129648-129808)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCTCCTCCTGTTGCTGAGTATCATCGTCCTCCACGTCGCGGTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCTCCTCCTGTTGCTGAGTATCATCGTCCTCCACGTCGCGGTGCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGCTGTTCGTCTCCACGATCGTCAGC         CAATGGATCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 100051 GCTGCTGTTCGTCTCCACGATCGTCAGCGTG...TAGCAATGGATCGTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCAATGGACACGCAACTGATCTCTGGCAGAACTGTAGCACCTCTTCCTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101548 GCAATGGACACGCAACTGATCTCTGGCAGAACTGTAGCACCTCTTCCTCA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAAATGTCCACCACTGTTTCTCATCATCACCAAACG         AATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 101598 GGAAATGTCCACCACTGTTTCTCATCATCACCAAACGGTG...CAGAATG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 GCTGCAGTCTGTCCAGGCCACCATGATCCTGTCGATCATCTTCAGCATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121121 GCTGCAGTCTGTCCAGGCCACCATGATCCTGTCGATCATCTTCAGCATTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TGTCTCTGTTCCTGTTCTTCTGCCAACTCTTCACCCTCACCAAGGGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121171 TGTCTCTGTTCCTGTTCTTCTGCCAACTCTTCACCCTCACCAAGGGGGGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGGTTTTACATCACTGGAATCTTCCAAATTCTTGCTG         GTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 121221 AGGTTTTACATCACTGGAATCTTCCAAATTCTTGCTGGTA...CAGGTCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTGCGTGATGAGTGCTGCGGCCATCTACACGGTGAGGCACCCGGAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129652 GTGCGTGATGAGTGCTGCGGCCATCTACACGGTGAGGCACCCGGAGTGGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 ATCTCAACTCGGATTACTCCTACGGTTTCGCCTACATCCTGGCCTGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129702 ATCTCAACTCGGATTACTCCTACGGTTTCGCCTACATCCTGGCCTGGGTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCCTTCCCCCTGGCCCTTCTCAGCGGTGTCATCTATGTGATCTTGCGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129752 GCCTTCCCCCTGGCCCTTCTCAGCGGTGTCATCTATGTGATCTTGCGGAA

    500     .
    474 ACGCGAA
        |||||||
 129802 ACGCGAA