seq1 = pF1KE6560.tfa, 495 bp
seq2 = pF1KE6560/gi568815581f_8188789.tfa (gi568815581f:8188789_8389558), 200770 bp

>pF1KE6560 495
>gi568815581f:8188789_8389558 (Chr17)

1-77  (100001-100077)   100% ->
78-194  (100168-100284)   100% ->
195-495  (100470-100770)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCCCACGAGAGACTGCCCGCTGTTCGGGGGCGCCTTTTCCGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCCCACGAGAGACTGCCCGCTGTTCGGGGGCGCCTTTTCCGCCAT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTCCCCATGGGGGCCATTGACGTAAG         CGACCTCCGACCGG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100051 CCTCCCCATGGGGGCCATTGACGTAAGGTG...CAGCGACCTCCGACCGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TCCCGGACAATCAAGAAGTTTTCTGCCATCCCGTGACGGACCAGAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100182 TCCCGGACAATCAAGAAGTTTTCTGCCATCCCGTGACGGACCAGAGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATAGTGGAACTTCTCGAGCTGCAGGCCCACGTACGGGGCGAAGCGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100232 ATAGTGGAACTTCTCGAGCTGCAGGCCCACGTACGGGGCGAAGCGGCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCG         GTACCACTTTGAGGATGTTGGTGGCGTGCAGGGGGCTA
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100282 GCGGTG...CAGGTACCACTTTGAGGATGTTGGTGGCGTGCAGGGGGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGGCTGTCCATGTGGAGTCTGTTCAGCCTCTCAGTTTGGAGAACCTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100508 GGGCTGTCCATGTGGAGTCTGTTCAGCCTCTCAGTTTGGAGAACCTGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTGAGGGGCCGCTGTCAAGAAGCCTGGGTCCTCTCTGGCAAGCAGCAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100558 CTGAGGGGCCGCTGTCAAGAAGCCTGGGTCCTCTCTGGCAAGCAGCAGAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 AGCTAAGGAAAACCAGCAGGTGAGGGCCCGAGAGTGTGTAATGTCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100608 AGCTAAGGAAAACCAGCAGGTGAGGGCCCGAGAGTGTGTAATGTCCTGGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGGGCGGTAGCGGGGACGCAGAGATCCAGGTAAGCATCCTGACTCTGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100658 AGGGCGGTAGCGGGGACGCAGAGATCCAGGTAAGCATCCTGACTCTGATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCTTAGGTAGCAAAGGACGTGACACTTCATCAGGCCTTGCTGAGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100708 CCCTTAGGTAGCAAAGGACGTGACACTTCATCAGGCCTTGCTGAGGCTGC

    500     .    :
    483 CCCAGTACCAGAC
        |||||||||||||
 100758 CCCAGTACCAGAC