seq1 = pF1KE6546.tfa, 318 bp
seq2 = pF1KE6546/gi568815597f_38928725.tfa (gi568815597f:38928725_39134493), 205769 bp

>pF1KE6546 318
>gi568815597f:38928725_39134493 (Chr1)

1-216  (100001-100216)   100% ->
217-318  (105668-105769)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCTTTCTTGGACATCCAGAAAAGGTTCGGCCTTAACATAGATCGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCTTTCTTGGACATCCAGAAAAGGTTCGGCCTTAACATAGATCGATG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTGACAATCCAGAGTGGTGAACAGCCCTACAAGATGGCTGGTCGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTGACAATCCAGAGTGGTGAACAGCCCTACAAGATGGCTGGTCGATGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ATGCTTTTGAAAAAGAATGGATAGAATGTGCACATGGAATCGGTTATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ATGCTTTTGAAAAAGAATGGATAGAATGTGCACATGGAATCGGTTATACT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CGGGCAGAGAAAGAGTGCAAGATAGAATATGATGATTTCGTAGAGTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CGGGCAGAGAAAGAGTGCAAGATAGAATATGATGATTTCGTAGAGTGTTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTTCGGCAGAAAACG         ATGAGACGTGCAGGTACCATCAGGA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTTCGGCAGAAAACGGTA...CAGATGAGACGTGCAGGTACCATCAGGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 AGCAGCGGGATAAGCTGATAAAGGAAGGAAAGTACACCCCTCCACCTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105693 AGCAGCGGGATAAGCTGATAAAGGAAGGAAAGTACACCCCTCCACCTCAC

    300     .    :    .    :    .
    292 CACATTGGCAAGGGGGAGCCTCGGCCC
        |||||||||||||||||||||||||||
 105743 CACATTGGCAAGGGGGAGCCTCGGCCC