seq1 = pF1KE6543.tfa, 321 bp
seq2 = pF1KE6543/gi568815578r_37154209.tfa (gi568815578r:37154209_37356889), 202681 bp

>pF1KE6543 321
>gi568815578r:37154209_37356889 (Chr20)

(complement)

1-83  (100001-100083)   100% ->
84-188  (100392-100496)   100% ->
189-309  (102561-102681)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCACTCTGGGTGTTCTTCTTTGTGATCCTCACCCTCAGCAACAGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCACTCTGGGTGTTCTTCTTTGTGATCCTCACCCTCAGCAACAGCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCACTGCTCCCCACCTCCCCCTTTGACCCTCAG         GATGCGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100051 CCACTGCTCCCCACCTCCCCCTTTGACCCTCAGGTA...CAGGATGCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GGTATGCAGATGCCATCTTCACCAACAGCTACCGGAAGGTGCTGGGCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100400 GGTATGCAGATGCCATCTTCACCAACAGCTACCGGAAGGTGCTGGGCCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTGTCCGCCCGCAAGCTGCTCCAGGACATCATGAGCAGGCAGCAGGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100450 CTGTCCGCCCGCAAGCTGCTCCAGGACATCATGAGCAGGCAGCAGGGGTA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    189       AGAGAGCAACCAAGAGCGAGGAGCAAGGGCACGGCTTGGTCGTC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100500 ...CAGAGAGAGCAACCAAGAGCGAGGAGCAAGGGCACGGCTTGGTCGTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGGTAGACAGCATGTGGGCAGAACAAAAGCAAATGGAATTGGAGAGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102605 AGGTAGACAGCATGTGGGCAGAACAAAAGCAAATGGAATTGGAGAGCATC

    300     .    :    .    :    .
    283 CTGGTGGCCCTGCTGCAGAAGCACAGG
        |||||||||||||||||||||||||||
 102655 CTGGTGGCCCTGCTGCAGAAGCACAGG