seq1 = pF1KE6542.tfa, 294 bp
seq2 = pF1KE6542/gi568815597r_212735873.tfa (gi568815597r:212735873_212936149), 200277 bp

>pF1KE6542 294
>gi568815597r:212735873_212936149 (Chr1)

(complement)

1-277  (100001-100277)   100% ->
278-294  (105889-105905)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCATCTATAAACAGAACCATTGAAATAATGAAAAAACATGGAGTAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCATCTATAAACAGAACCATTGAAATAATGAAAAAACATGGAGTAAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAACAACATCTCCTGGAGGAGATAAACAAAAAGCGTGAATCCAACTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAACAACATCTCCTGGAGGAGATAAACAAAAAGCGTGAATCCAACTGCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGGTGGAACGAAGCAATCAAGTCAGCTTACTGAGAGTTCAAAAGAGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TGGTGGAACGAAGCAATCAAGTCAGCTTACTGAGAGTTCAAAAGAGGCAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTCCCGGATGCCTATCAGTCCTTTACTGATACCACAACCAAAGAGCCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTCCCGGATGCCTATCAGTCCTTTACTGATACCACAACCAAAGAGCCTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TCCCAACAGTGGCAGGAGCTCCTGGATCAAGCTGAGTCTCCTTGCTCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TCCCAACAGTGGCAGGAGCTCCTGGATCAAGCTGAGTCTCCTTGCTCACA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGAGAGAAAGCACTTTCCACCAAAAA         ATAATGCCATATTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100251 TGGAGAGAAAGCACTTTCCACCAAAAAGTA...CAGATAATGCCATATTT

    300 
    292 GGA
        |||
 105903 GGA