seq1 = pF1KE6531.tfa, 594 bp
seq2 = pF1KE6531/gi568815592r_169640188.tfa (gi568815592r:169640188_169851458), 211271 bp

>pF1KE6531 594
>gi568815592r:169640188_169851458 (Chr6)

(complement)

1-120  (100001-100120)   100% ->
121-327  (107185-107391)   100% ->
328-486  (108221-108379)   100% ->
487-594  (111164-111271)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAAGCGAGGCCGAGGCGTGAAGTCGAGCCCCATCCAGACCCCGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAAGCGAGGCCGAGGCGTGAAGTCGAGCCCCATCCAGACCCCGAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCAGACCCCTCAGCAGGCTCCGGTGACGCCTAGGAAAGAAAGGAGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCAGACCCCTCAGCAGGCTCCGGTGACGCCTAGGAAAGAAAGGAGGCCTA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCATGTTCGAGAAGGAGGCA         TATACACAGATTTTAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 GCATGTTCGAGAAGGAGGCAGTG...CAGTATACACAGATTTTAAGAGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AGACTGAGAGAGTCAATTCACAATGTTCAGTATGTGGAGCCTCCTTTTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107206 AGACTGAGAGAGTCAATTCACAATGTTCAGTATGTGGAGCCTCCTTTTGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGACTCAATTGCTGATATAGGTAAAGAATGGAAGAGTGCCCTGGCAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107256 TGACTCAATTGCTGATATAGGTAAAGAATGGAAGAGTGCCCTGGCAAAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TAAAGTTTGCTAATTCATATAGAATGGAGCCATTGAAGAAATTCCAAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107306 TAAAGTTTGCTAATTCATATAGAATGGAGCCATTGAAGAAATTCCAAGCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CATTCAGTAGAAACTAAAGTCCAGCAGATACTAACA         GAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 107356 CATTCAGTAGAAACTAAAGTCCAGCAGATACTAACAGTA...AAGGAAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 TCTTAAAGATGTCAAATATGATGATAAAGTATTCTCTCACTTGTCACTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108226 TCTTAAAGATGTCAAATATGATGATAAAGTATTCTCTCACTTGTCACTTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AATTGGCAGACCGCATACTGTTAGCAGTCAAAGAATTTGGGTACCACCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108276 AATTGGCAGACCGCATACTGTTAGCAGTCAAAGAATTTGGGTACCACCGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 TATAAGTTCATTATAAAAGTATTATTTATTCAAAAGACTGGCCAAGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108326 TATAAGTTCATTATAAAAGTATTATTTATTCAAAAGACTGGCCAAGCAAT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 AAAT         ATTGCCAGCAGATGGATCTGGGACATTGCATGGGACA
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108376 AAATGTA...CAGATTGCCAGCAGATGGATCTGGGACATTGCATGGGACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GCTGGGTCGCAGCTAAACACGAAGCAGAATCCTACGTGGCACTGGTCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 111201 GCTGGGTCGCAGCTAAACACGAAGCAGAATCCTACGTGGCACTGGTCTTG

    600     .    :    .    :
    574 GTGTTTGCCCTTTATTATGAA
        |||||||||||||||||||||
 111251 GTGTTTGCCCTTTATTATGAA