seq1 = pF1KE6529.tfa, 639 bp
seq2 = pF1KE6529/gi568815589r_5063916.tfa (gi568815589r:5063916_5285602), 221687 bp

>pF1KE6529 639
>gi568815589r:5063916_5285602 (Chr9)

(complement)

1-289  (100001-100289)   100% ->
290-639  (121338-121687)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCGCGGCTCCTCCGCTTGTCCCTGCTGTGGCTTGGACTCCTGCTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCGCGGCTCCTCCGCTTGTCCCTGCTGTGGCTTGGACTCCTGCTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TCGGTTTTCTCGTGAACTGAGCGACATCAGCAGTGCCAGGAAGCTGTGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TCGGTTTTCTCGTGAACTGAGCGACATCAGCAGTGCCAGGAAGCTGTGCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCAGGTACTTGGTGAAAGAAATAGAAAAACTCTGCGGCCATGCCAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCAGGTACTTGGTGAAAGAAATAGAAAAACTCTGCGGCCATGCCAACTGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGCCAGTTCCGTTTCGAGGAGGAAACCCCTTTCTCACGGTTGATTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGCCAGTTCCGTTTCGAGGAGGAAACCCCTTTCTCACGGTTGATTGCACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGCCTCGGAGAAGGTCGAAGCCTACAGCCCATACCAGTTCGAAAGCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGCCTCGGAGAAGGTCGAAGCCTACAGCCCATACCAGTTCGAAAGCCCGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAACCGCTTCCCCGGCCCGGGGAAGAGGCACAAACCCAG         TG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100251 AAACCGCTTCCCCGGCCCGGGGAAGAGGCACAAACCCAGGTA...CAGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TCTACTTCTTGGGAAGAAGCAGTAAACAGTTGGGAAATGCAGTCACTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121340 TCTACTTCTTGGGAAGAAGCAGTAAACAGTTGGGAAATGCAGTCACTACC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGAGTATAAGGATAAAAAGGGATATTCACCCCTTGGTAAGACAAGAGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121390 TGAGTATAAGGATAAAAAGGGATATTCACCCCTTGGTAAGACAAGAGAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 TTTCTTCATCACATAATATCAATGTATATATTCATGAGAATGCAAAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121440 TTTCTTCATCACATAATATCAATGTATATATTCATGAGAATGCAAAATTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 CAGAAGAAACGTAGAAACAAAATTAAAACCTTAAGCAATTTGTTTTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121490 CAGAAGAAACGTAGAAACAAAATTAAAACCTTAAGCAATTTGTTTTGGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 GCATCATCCCCAAAGAAAACGCAGAGGATATTCAGAAAAGTGTTGTCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121540 GCATCATCCCCAAAGAAAACGCAGAGGATATTCAGAAAAGTGTTGTCTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 CAGGATGTACAAAAGAAGAACTTAGCATTGCATGTCTTCCATATATTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121590 CAGGATGTACAAAAGAAGAACTTAGCATTGCATGTCTTCCATATATTGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    592 TTTAAAAGGCTAAAGGAAAAAAGATCATCACTTGTAACTAAGATATAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121640 TTTAAAAGGCTAAAGGAAAAAAGATCATCACTTGTAACTAAGATATAC