seq1 = pF1KE6527.tfa, 522 bp
seq2 = pF1KE6527/gi568815596r_208021676.tfa (gi568815596r:208021676_208224356), 202681 bp

>pF1KE6527 522
>gi568815596r:208021676_208224356 (Chr2)

(complement)

8-252  (100001-100245)   99% ->
253-522  (102412-102681)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      8 AGATCACCCTCTACGAGGACCGGGGCTTCCAGGGCCGCCACTACGAATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 100001 AGATCACCCTCTACGAGGACCGGGGCTTCCAGGGCCGCCACTATGAATGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     58 AGCAGCGACCACCCCAACCTGCAGCCCTACTTGAGCCGCTGCAACTCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGCAGCGACCACCCCAACCTGCAGCCCTACTTGAGCCGCTGCAACTCGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    108 GCGCGTGGACAGCGGCTGCTGGATGCTCTATGAGCAGCCCAACTACTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCGCGTGGACAGCGGCTGCTGGATGCTCTATGAGCAGCCCAACTACTCGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    158 GCCTCCAGTACTTCCTGCGCCGCGGCGACTATGCCGACCACCAGCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GCCTCCAGTACTTCCTGCGCCGCGGCGACTATGCCGACCACCAGCAGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    208 ATGGGCCTCAGCGACTCGGTCCGCTCCTGCCGCCTCATCCCCCAC     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 100201 ATGGGCCTCAGCGACTCGGTCCGCTCCTGCCGCCTCATCCCCCACGTG..

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    253     TCTGGCTCTCACAGGATCAGACTCTATGAGAGGGAGGACTACAGAG
        .>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
 100251 .CAGTCTGGCTCTCACAGGATCAGACTCTATGAGAGAGAGGACTACAGAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    299 GCCAGATGATAGAGTTCACTGAGGACTGCTCCTGTCTTCAGGACCGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102458 GCCAGATGATAGAGTTCACTGAGGACTGCTCCTGTCTTCAGGACCGCTTC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    349 CGCTTCAATGAAATCCACTCCCTCAACGTGCTGGAGGGCTCCTGGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102508 CGCTTCAATGAAATCCACTCCCTCAACGTGCTGGAGGGCTCCTGGGTCCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    399 CTACGAGCTGTCCAACTACCGAGGACGGCAGTACCTGCTGATGCCAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102558 CTACGAGCTGTCCAACTACCGAGGACGGCAGTACCTGCTGATGCCAGGGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    449 ACTATAGGCGCTACCAGGACTGGGGGGCCACGAATGCCAGAGTGGGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102608 ACTATAGGCGCTACCAGGACTGGGGGGCCACGAATGCCAGAGTGGGCTCT

    500     .    :    .    :
    499 CTGAGGAGAGTCATAGATTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||
 102658 CTGAGGAGAGTCATAGATTTCTCC