seq1 = pF1KE6524.tfa, 390 bp
seq2 = pF1KE6524/gi568815594f_75456083.tfa (gi568815594f:75456083_75664436), 208354 bp

>pF1KE6524 390
>gi568815594f:75456083_75664436 (Chr4)

1-67  (100001-100067)   100% ->
68-390  (108032-108354)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCTCGCAGACACTGCTTCTCCTACTGGTTACTGGTATGCTGGTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCTCGCAGACACTGCTTCTCCTACTGGTTACTGGTATGCTGGTTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGTAACTGTGGCAGAAG         GACAAGAAGAGGTATTTACGCCTC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTAACTGTGGCAGAAGGTA...CAGGACAAGAAGAGGTATTTACGCCTC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CTGGAGATTCACAAAATAATGCGGACGCTACCGACTGCCAGATCTTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108056 CTGGAGATTCACAAAATAATGCGGACGCTACCGACTGCCAGATCTTTACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CTCACCCCTCCACCTGCCCCGAGGAGTCCGGTCACAAGGGCCCAGCCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108106 CTCACCCCTCCACCTGCCCCGAGGAGTCCGGTCACAAGGGCCCAGCCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CACAAAGACACCCAGGTGTCCCTTCCATTTTTTTCCACGAAGGCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108156 CACAAAGACACCCAGGTGTCCCTTCCATTTTTTTCCACGAAGGCCCAGAA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCCATTTTAGGTTTCCAAACAGACCTTTCGTCCCTTCAAGGTGTAACCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108206 TCCATTTTAGGTTTCCAAACAGACCTTTCGTCCCTTCAAGGTGTAACCAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CGTTTTCCATTCCAGCCATTTTATTGGCCACACCGTTACCTTACTTATAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108256 CGTTTTCCATTCCAGCCATTTTATTGGCCACACCGTTACCTTACTTATAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .
    342 GTATTTCCCCAGAAGAAGACTCCAGAGAGGAAGCTCATCTGAGGAAAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108306 GTATTTCCCCAGAAGAAGACTCCAGAGAGGAAGCTCATCTGAGGAAAGC