seq1 = pF1KE6522.tfa, 255 bp
seq2 = pF1KE6522/gi568815580f_11881670.tfa (gi568815580f:11881670_12099189), 217520 bp

>pF1KE6522 255
>gi568815580f:11881670_12099189 (Chr18)

1-96  (100001-100096)   100% ->
97-230  (117385-117518)   100% ->
231-255  (126664-126688)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGCCGAGCGGCGAGGACCAGGCGGCGCTGGCGGCCGGCCCCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGCCGAGCGGCGAGGACCAGGCGGCGCTGGCGGCCGGCCCCTGGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGTGCTTCCAGGCGGCCGTGCAGCTGGCGCTGCGGGCAGGACAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 100051 GGAGTGCTTCCAGGCGGCCGTGCAGCTGGCGCTGCGGGCAGGACAGGTG.

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     97      ATCATCAGAAAAGCCCTTACTGAGGAAAAACGTGTCTCAACAAAA
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ..CAGATCATCAGAAAAGCCCTTACTGAGGAAAAACGTGTCTCAACAAAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ACATCAGCTGCAGATCTTGTGACAGAAACAGATCACCTTGTGGAAGATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117430 ACATCAGCTGCAGATCTTGTGACAGAAACAGATCACCTTGTGGAAGATTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 AATTATTTCTGAGTTGCGAGAGAGGTTTCCTTCACACAG         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 117480 AATTATTTCTGAGTTGCGAGAGAGGTTTCCTTCACACAGGTA...CAGGT

    250     .    :    .    :
    233 CTCCTTTTTCTCTAGTACACATG
        |||||||||||||||||||||||
 126666 CTCCTTTTTCTCTAGTACACATG