seq1 = pF1KE6514.tfa, 441 bp
seq2 = pF1KE6514/gi568815587f_60234896.tfa (gi568815587f:60234896_60439952), 205057 bp

>pF1KE6514 441
>gi568815587f:60234896_60439952 (Chr11)

1-147  (100001-100147)   100% ->
148-354  (102846-103052)   100% ->
355-441  (104971-105057)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACATCACAACCTATTTCCAATGAGACCATCATAATGCTCCCATCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACATCACAACCTATTTCCAATGAGACCATCATAATGCTCCCATCAAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGTCATCAACTTCTCCCAAGCAGAGAAACCCGAACCCACCAACCAGGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGTCATCAACTTCTCCCAAGCAGAGAAACCCGAACCCACCAACCAGGGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGGATAGCCTGAAGAAACGTCTACAGGCAAAAGTCAAAGTTATTGGG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 100101 AGGATAGCCTGAAGAAACGTCTACAGGCAAAAGTCAAAGTTATTGGGGTA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    148       GTGCATAGCAGCCTGGCTGGAAGCATTCTGAGTGCTCTGTCTGC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ...CAGGTGCATAGCAGCCTGGCTGGAAGCATTCTGAGTGCTCTGTCTGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCTGGTGGGTTTCATTCTCCTGTCTGTCAACCCGGCTGCATTAAATCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102890 CCTGGTGGGTTTCATTCTCCTGTCTGTCAACCCGGCTGCATTAAATCCTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CCTCATTGCAGTGTAAGTTGGACGAAAAGGATATACCAACCAGACTTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102940 CCTCATTGCAGTGTAAGTTGGACGAAAAGGATATACCAACCAGACTTCTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 CTTTCTTATGATTATCATTCACCTTACACCATGGACTGCCATAGAGCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102990 CTTTCTTATGATTATCATTCACCTTACACCATGGACTGCCATAGAGCCAA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGCCAGTCTGGCT         GGAACTCTGTCTCTGATGCTGGTTTCTA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 103040 AGCCAGTCTGGCTGTA...CAGGGAACTCTGTCTCTGATGCTGGTTTCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGTGTTGGAGTTCTGCCTAGCTGTGCTCACTGCTGTGCTGCAGTGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104999 CTGTGTTGGAGTTCTGCCTAGCTGTGCTCACTGCTGTGCTGCAGTGGAAA

    450     .
    433 CAGACTGTC
        |||||||||
 105049 CAGACTGTC