seq1 = pF1KE6512.tfa, 489 bp
seq2 = pF1KE6512/gi568815587f_77002840.tfa (gi568815587f:77002840_77203328), 200489 bp

>pF1KE6512 489
>gi568815587f:77002840_77203328 (Chr11)

1-489  (100001-100489)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCGGAGGACAGGCCGCAGCAGCCGCAGCTGGACATGCCGCTGGTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCGGAGGACAGGCCGCAGCAGCCGCAGCTGGACATGCCGCTGGTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGACCAGGGCCTGACCAGGCAGATGCGGCTACGCGTGGAGAGCCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGACCAGGGCCTGACCAGGCAGATGCGGCTACGCGTGGAGAGCCTGAAGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AGCGCGGGGAGAAGCGCCAGGATGGGGAGAAGCTGCTGCAGCCAGCGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 AGCGCGGGGAGAAGCGCCAGGATGGGGAGAAGCTGCTGCAGCCAGCGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TCTGTGTACCGCCTCAACTTCACCCAGCAGCAGCGGCTACAGTTCGAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TCTGTGTACCGCCTCAACTTCACCCAGCAGCAGCGGCTACAGTTCGAGCG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTGGAATGTCGTGCTGGACAAGCCGGGCAAGGTCACCATCACAGGCACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTGGAATGTCGTGCTGGACAAGCCGGGCAAGGTCACCATCACAGGCACCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGCAGAACTGGACGCCTGACCTCACCAACCTCATGACACGCCAGCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGCAGAACTGGACGCCTGACCTCACCAACCTCATGACACGCCAGCTGCTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACCCCACTGCCATCTTCTGGCGCAAGGAGGACTCGGATGCCATAGATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACCCCACTGCCATCTTCTGGCGCAAGGAGGACTCGGATGCCATAGATTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GAATGAGGCCGACGCCCTGGAGTTTGGGGAGCGCCTGTCGGACCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GAATGAGGCCGACGCCCTGGAGTTTGGGGAGCGCCTGTCGGACCTGGCCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGATCCGCAAGGTCATGTACTTCCTCGTCACCTTTGGCGAGGGTGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGATCCGCAAGGTCATGTACTTCCTCGTCACCTTTGGCGAGGGTGTGGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .
    451 CCCGCCAACCTCAAGGCCTCCGTGGTTTTTAACCAGCTC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCCGCCAACCTCAAGGCCTCCGTGGTTTTTAACCAGCTC