seq1 = pF1KE6506.tfa, 312 bp
seq2 = pF1KE6506/gi568815597r_153514888.tfa (gi568815597r:153514888_153715383), 200496 bp

>pF1KE6506 312
>gi568815597r:153514888_153715383 (Chr1)

(complement)

1-30  (99526-99555)   100% ->
31-177  (100003-100149)   100% ->
178-312  (100362-100496)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGACAGTGTCGGTCAGCCAACGCAGAG         GATGCTCAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
  99526 ATGGGACAGTGTCGGTCAGCCAACGCAGAGGTG...CAGGATGCTCAGGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 ATTCAGTGATGTGGAGAGGGCCATTGAGACCCTCATCAAGAACTTTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100014 ATTCAGTGATGTGGAGAGGGCCATTGAGACCCTCATCAAGAACTTTCACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 AGTACTCCGTGGAGGGTGGGAAGGAGACGCTGACCCCTTCTGAGCTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100064 AGTACTCCGTGGAGGGTGGGAAGGAGACGCTGACCCCTTCTGAGCTACGG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GACCTGGTCACCCAGCAGCTGCCCCATCTCATGCCG         AGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 100114 GACCTGGTCACCCAGCAGCTGCCCCATCTCATGCCGGTA...CAGAGCAA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTGTGGCCTGGAAGAGAAAATTGCCAACCTGGGCAGCTGCAATGACTCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100367 CTGTGGCCTGGAAGAGAAAATTGCCAACCTGGGCAGCTGCAATGACTCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AACTGGAGTTCAGGAGTTTCTGGGAGCTGATTGGAGAAGCGGCCAAGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100417 AACTGGAGTTCAGGAGTTTCTGGGAGCTGATTGGAGAAGCGGCCAAGAGT

    300     .    :    .    :    .    :
    283 GTGAAGCTGGAGAGGCCTGTCCGGGGGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||
 100467 GTGAAGCTGGAGAGGCCTGTCCGGGGGCAC