seq1 = pF1KE6501.tfa, 408 bp
seq2 = pF1KE6501/gi568815592r_31037954.tfa (gi568815592r:31037954_31239026), 201073 bp

>pF1KE6501 408
>gi568815592r:31037954_31239026 (Chr6)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-408  (100721-101073)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATCCTCAACTGGAAGCTCCTGGGGATCCTGGTCCTTTGCCTGCACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATCCTCAACTGGAAGCTCCTGGGGATCCTGGTCCTTTGCCTGCACAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGAG         GCATCTCAGGCAGCGAGGGCCACCCCTCTCACCCAC
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGAGGTG...CAGGCATCTCAGGCAGCGAGGGCCACCCCTCTCACCCAC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCGCAGAGGACCGAGAGGAGGCAGGCTCCCCAACATTGCCTCAGGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100757 CCGCAGAGGACCGAGAGGAGGCAGGCTCCCCAACATTGCCTCAGGGCCCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCAGTCCCCGGTGACCCTTGGCCAGGGGCACCCCCTCTCTTTGAAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100807 CCAGTCCCCGGTGACCCTTGGCCAGGGGCACCCCCTCTCTTTGAAGATCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TCCGCCTACCCGCCCCAGTCGTCCCTGGAGAGACCTGCCTGAAACTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100857 TCCGCCTACCCGCCCCAGTCGTCCCTGGAGAGACCTGCCTGAAACTGGAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TCTGGCTCCCTGAACCGCCTAGAACGGATCCTCCTCAACCTCCCCGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100907 TCTGGCTCCCTGAACCGCCTAGAACGGATCCTCCTCAACCTCCCCGGCCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GACGACCCTTGGCCGGCAGGACCCCAGCCCCCAGAAAACCCCTGGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100957 GACGACCCTTGGCCGGCAGGACCCCAGCCCCCAGAAAACCCCTGGCCTCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 TGCCCCTGAGGTGGACAACCGACCTCAGGAGGAGCCAGACCTAGACCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101007 TGCCCCTGAGGTGGACAACCGACCTCAGGAGGAGCCAGACCTAGACCCAC

    400     .    :    .
    392 CCCGGGAAGAGTACAGA
        |||||||||||||||||
 101057 CCCGGGAAGAGTACAGA