seq1 = pF1KE6495.tfa, 1374 bp
seq2 = pF1KE6495/gi568815583f_64976816.tfa (gi568815583f:64976816_65178189), 201374 bp

>pF1KE6495 1374
>gi568815583f:64976816_65178189 (Chr15)

1-1374  (100001-101374)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCACGGGGTCCACAGACCCTGGTGCAGGTGTGGGTGGGCGGCCAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCACGGGGTCCACAGACCCTGGTGCAGGTGTGGGTGGGCGGCCAGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTTCCAAGCCGACCGCGCCCTGCTGGTGGAGCACTGTGGCTTCTTCCGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTTCCAAGCCGACCGCGCCCTGCTGGTGGAGCACTGTGGCTTCTTCCGAG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTCTTCCGCTCCGGCATGCGGGAGACCCGCGCAGCAGAGGTGCGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 GCCTCTTCCGCTCCGGCATGCGGGAGACCCGCGCAGCAGAGGTGCGCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCGTTCTGAGCGCGGGAGGTTTCCGCGCCACGCTGCAGGTGCTGCGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCGTTCTGAGCGCGGGAGGTTTCCGCGCCACGCTGCAGGTGCTGCGCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CGACCGGCCGGCGCTGGCGGCGGAGGACGAGCTGCTGCAGGTCGTGGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
 100201 CGACCGGCCGGCGCTGGCGGCGGAGGACGAGCTGCTGCAGGCCGTGGAGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GCGCCGCCTTCCTCCAGGCGCCGGCGCTGGCTCGCTTTCTGGAGCACAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GCGCCGCCTTCCTCCAGGCGCCGGCGCTGGCTCGCTTTCTGGAGCACAAC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCACGTCGGACAACTGCGCATTGCTGTGCGACGCGGCCGCCGCCTTCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCACGTCGGACAACTGCGCATTGCTGTGCGACGCGGCCGCCGCCTTCGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CCTGCGCGACGTGTTCCACAGTGCCGCTCTCTTCATCTGCGACGGCGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
 100351 CCTGCGCGACGTGTTCCACAGTGCCGCGCTCTTCATCTGCGACGGCGAGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 GCGAGCTGGCGGCCGAACTGGCGCTGCCTGAGGCCCGCGCCTACGTGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 GCGAGCTGGCGGCCGAACTGGCGCTGCCTGAGGCCCGCGCCTACGTGGCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCCTGCGGCCCAGCAGCTACGCGGCCGTGAGCACGCACACGCCCGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCCTGCGGCCCAGCAGCTACGCGGCCGTGAGCACGCACACGCCCGCGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CGGCTTCCTGGAGGACGCCTCGCGCACGCTGTGTTACCTGGACGAGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CGGCTTCCTGGAGGACGCCTCGCGCACGCTGTGTTACCTGGACGAGGAAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGGACGCGTGGCGCACGCTGGCTGCGCTGCCCCTGGAGGCCAGCACGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGGACGCGTGGCGCACGCTGGCTGCGCTGCCCCTGGAGGCCAGCACGTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTGGCCGGGGTGGCCACGCTGGGCAACAAGCTTTACATCGTGGGGGGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTGGCCGGGGTGGCCACGCTGGGCAACAAGCTTTACATCGTGGGGGGCGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GCGCGGCGCCAGCAAGGAGGTGGTAGAGCTGGGCTTCTGCTACGACCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GCGCGGCGCCAGCAAGGAGGTGGTAGAGCTGGGCTTCTGCTACGACCCCG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACGGCGGCACGTGGCACGAGTTCCCCAGCCCGCACCAGCCGCGCTATGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACGGCGGCACGTGGCACGAGTTCCCCAGCCCGCACCAGCCGCGCTATGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ACAGCGCTGGCCGGCTTCGACGGCCGCCTCTACGCCATCGGCGGCGAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
 100751 ACAGCGCTGGCCGGCTTCGACGGCCGCCTCTACGCCATCGGCGGCGAATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCAGAGGACGCCCATCAGCTCCGTGGAGCGCTACGACCCAGCCGCGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCAGAGGACGCCCATCAGCTCCGTGGAGCGCTACGACCCAGCCGCGGGCT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GCTGGAGTTTCGTGGCCGACCTGCCGCAGCCGGCCGCCGGCGTGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GCTGGAGTTTCGTGGCCGACCTGCCGCAGCCGGCCGCCGGCGTGCCCTGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GCCCAGGCTTGTGGCCGTCTCTTCGTGTGCCTGTGGCGGCCGGCCGACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GCCCAGGCTTGTGGCCGTCTCTTCGTGTGCCTGTGGCGGCCGGCCGACAC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CACCGCCGTGGTGGAGTACGCAGTGCGGACCGACGCGTGGCTGCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CACCGCCGTGGTGGAGTACGCAGTGCGGACCGACGCGTGGCTGCCAGTGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 CCGAGCTGCGGCGTCCGCAGAGCTATGGCCACTGCATGGTGGCCCACCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CCGAGCTGCGGCGTCCGCAGAGCTATGGCCACTGCATGGTGGCCCACCGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GACAGCCTCTATGTGGTGCGCAACGGACCTTCCGACGACTTCCTGCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GACAGCCTCTATGTGGTGCGCAACGGACCTTCCGACGACTTCCTGCACTG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 CGCCATCGACTGTCTCAACCTGGCCACGGGCCAGTGGACGGCGCTGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 CGCCATCGACTGTCTCAACCTGGCCACGGGCCAGTGGACGGCGCTGCCCG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 GCCAGTTCGTCAACAGCAAGGGAGCGCTCTTCACGGCCGTGGTGCGCGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
 101151 GCCAGTTCGTCAACAGCAAGGGAGCGCTCTTCACGGCCGTGGTGCGCGGT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 GACACCGTCTATACGGTCAACCGCATGTTCACGCTGCTCTACGCCATCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 GACACCGTCTATACGGTCAACCGCATGTTCACGCTGCTCTACGCCATCGA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 GGGCGGCACCTGGCGGCTGCTCAGGGAGAAAGCCGGCTTCCCGCGGCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 GGGCGGCACCTGGCGGCTGCTCAGGGAGAAAGCCGGCTTCCCGCGGCCCG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 GCTCCTTGCAGACCTTTCTCCTAAGGCTGCCTCCTGGCGCTCCTGGGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 GCTCCTTGCAGACCTTTCTCCTAAGGCTGCCTCCTGGCGCTCCTGGGCCT

   1350     .    :    .    :
   1351 GTGACTTCGACAACGGCAGAACTG
        ||||||||||||||||||||||||
 101351 GTGACTTCGACAACGGCAGAACTG