seq1 = pF1KE6493.tfa, 1830 bp
seq2 = pF1KE6493/gi568815586r_101057282.tfa (gi568815586r:101057282_101309848), 252567 bp

>pF1KE6493 1830
>gi568815586r:101057282_101309848 (Chr12)

(complement)

1-351  (100001-100351)   100% ->
352-417  (105284-105349)   100% ->
418-469  (107634-107685)   100% ->
470-537  (114687-114754)   100% ->
538-692  (116070-116224)   100% ->
693-833  (119241-119381)   100% ->
834-963  (122334-122463)   100% ->
964-1052  (125627-125715)   100% ->
1053-1165  (126934-127046)   100% ->
1166-1233  (129753-129820)   100% ->
1234-1320  (141667-141753)   100% ->
1321-1526  (143150-143355)   100% ->
1527-1630  (147772-147875)   100% ->
1631-1710  (151521-151600)   98% ->
1711-1830  (152448-152567)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGACACGCCACGGGGCATCGGCACCTTCGTGGTGTGGGACTACGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGACACGCCACGGGGCATCGGCACCTTCGTGGTGTGGGACTACGTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTCGCGGGCATGCTGGTCATCTCGGCCGCCATCGGCATCTACTACGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTTCGCGGGCATGCTGGTCATCTCGGCCGCCATCGGCATCTACTACGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGCTGGGGGCGGCCAGCAGACCTCCAAGGACTTCCTGATGGGCGGCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGCTGGGGGCGGCCAGCAGACCTCCAAGGACTTCCTGATGGGCGGCCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 AGAATGACCGCAGTGCCCGTGGCGCTGTCCCTCACCGCTAGCTTCATGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 AGAATGACCGCAGTGCCCGTGGCGCTGTCCCTCACCGCTAGCTTCATGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 AGCCGTCACTGTCCTGGGCACCCCCTCCGAGGTCTACCGTTTTGGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 AGCCGTCACTGTCCTGGGCACCCCCTCCGAGGTCTACCGTTTTGGGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TTTTTAGCATCTTTGCCTTCACCTACTTCTTTGTGGTGGTCATCAGCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TTTTTAGCATCTTTGCCTTCACCTACTTCTTTGTGGTGGTCATCAGCGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GAGGTCTTCCTCCCGGTGTTCTACAAACTGGGAATTACCAGCACCTACGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GAGGTCTTCCTCCCGGTGTTCTACAAACTGGGAATTACCAGCACCTACGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 G         TATTTAGAACTTCGATTTAACAAATGTGTTCGTCTCTGTG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GGTA...CAGTATTTAGAACTTCGATTTAACAAATGTGTTCGTCTCTGTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 GAACAGTCCTCTTCATTGTTCAAACA         ATTCTGTATACTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 105324 GAACAGTCCTCTTCATTGTTCAAACAGTA...TAGATTCTGTATACTGGA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 ATTGTTATTTATGCCCCTGCCCTGGCTTTGAATCAAG         TCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 107649 ATTGTTATTTATGCCCCTGCCCTGGCTTTGAATCAAGGTA...CAGTCAC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 AGGATTTGATCTGTGGGGCGCGGTAGTGGCAACGGGGGTGGTCTGCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114691 AGGATTTGATCTGTGGGGCGCGGTAGTGGCAACGGGGGTGGTCTGCACAT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCTACTGCACACTG         GGTGGTCTTAAAGCAGTTATCTGGACA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 114741 TCTACTGCACACTGGTA...AAGGGTGGTCTTAAAGCAGTTATCTGGACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GATGTTTTTCAAGTTGGGATCATGGTGGCTGGATTTGCATCCGTGATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116097 GATGTTTTTCAAGTTGGGATCATGGTGGCTGGATTTGCATCCGTGATTAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 ACAGGCTGTGGTGATGCAAGGTGGAATCAGCACTATTTTAAATGATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116147 ACAGGCTGTGGTGATGCAAGGTGGAATCAGCACTATTTTAAATGATGCCT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGATGGTGGAAGATTAAATTTCTGGAA         TTTTAATCCTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 116197 ATGATGGTGGAAGATTAAATTTCTGGAAGTA...TAGTTTTAATCCTAAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 CCTTTGCAAAGACACACCTTCTGGACAATTATTATAGGAGGGACCTTCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119254 CCTTTGCAAAGACACACCTTCTGGACAATTATTATAGGAGGGACCTTCAC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 ATGGACCAGCATCTACGGTGTCAACCAATCCCAGGTGCAGAGATATATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119304 ATGGACCAGCATCTACGGTGTCAACCAATCCCAGGTGCAGAGATATATTT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CTTGTAAAAGCAGATTCCAGGCAAAACT         GTCTCTCTACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 119354 CTTGTAAAAGCAGATTCCAGGCAAAACTGTA...TAGGTCTCTCTACATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 AATCTTGTGGGACTCTGGGCAATCCTCACATGCTCAGTGTTTTGTGGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122347 AATCTTGTGGGACTCTGGGCAATCCTCACATGCTCAGTGTTTTGTGGGCT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    897 CGCCCTATATTCCAGGTACCATGACTGTGATCCTTGGACAGCCAAGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 122397 CGCCCTATATTCCAGGTACCATGACTGTGATCCTTGGACAGCCAAGAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGTCTGCACCAGACCAG         CTCATGCCTTATTTGGTACTGGAC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 122447 TGTCTGCACCAGACCAGGTT...CAGCTCATGCCTTATTTGGTACTGGAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    988 ATTCTGCAAGATTATCCAGGACTTCCTGGACTTTTTGTGGCCTGTGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125651 ATTCTGCAAGATTATCCAGGACTTCCTGGACTTTTTGTGGCCTGTGCTTA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1038 CAGTGGGACATTAAG         CACAGTGTCCTCCAGTATTAATGCCT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 125701 CAGTGGGACATTAAGGTA...CAGCACAGTGTCCTCCAGTATTAATGCCT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TAGCAGCAGTAACTGTGGAAGATCTAATCAAACCTTACTTCAGATCGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126960 TAGCAGCAGTAACTGTGGAAGATCTAATCAAACCTTACTTCAGATCGCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 TCAGAAAGGTCTCTGTCTTGGATTTCCCAAGGAATGA         GTGT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 127010 TCAGAAAGGTCTCTGTCTTGGATTTCCCAAGGAATGAGTA...TAGGTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 GGTGTATGGAGCCCTGTGTATTGGAATGGCTGCGCTGGCGTCACTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 129757 GGTGTATGGAGCCCTGTGTATTGGAATGGCTGCGCTGGCGTCACTTATGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GAGCTTTGTTGCAG         GCAGCACTCAGCGTATTTGGTATGGTT
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 129807 GAGCTTTGTTGCAGGTG...TAGGCAGCACTCAGCGTATTTGGTATGGTT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 GGTGGACCACTTATGGGCCTGTTCGCTTTGGGCATTTTGGTTCCCTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141694 GGTGGACCACTTATGGGCCTGTTCGCTTTGGGCATTTTGGTTCCCTTTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CAACTCAATT         GGAGCACTTGTTGGTCTGATGGCTGGATTTG
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 141744 CAACTCAATTGTA...CAGGGAGCACTTGTTGGTCTGATGGCTGGATTTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CCATTTCTCTATGGGTTGGAATTGGAGCTCAAATATATCCTCCACTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143181 CCATTTCTCTATGGGTTGGAATTGGAGCTCAAATATATCCTCCACTTCCT

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 GAGAGAACATTGCCATTGCACCTTGATATCCAAGGCTGTAACAGCACCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143231 GAGAGAACATTGCCATTGCACCTTGATATCCAAGGCTGTAACAGCACCTA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 CAATGAGACAAATTTGATGACAACCACAGAAATGCCATTTACTACTAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 143281 CAATGAGACAAATTTGATGACAACCACAGAAATGCCATTTACTACTAGTG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1502 TTTTTCAAATATACAATGTTCAAAG         GACTCCACTGATGGAT
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 143331 TTTTTCAAATATACAATGTTCAAAGGTA...TAGGACTCCACTGATGGAT

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 AACTGGTATTCTTTATCATATCTGTACTTCAGCACTGTTGGAACTTTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147788 AACTGGTATTCTTTATCATATCTGTACTTCAGCACTGTTGGAACTTTGGT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 AACATTATTAGTGGGGATACTTGTCAGTTTATCAACAG         GAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 147838 AACATTATTAGTGGGGATACTTGTCAGTTTATCAACAGGTA...CAGGAG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 GAAGAAAACAGAACTTAGACCCCAGATATATACTAACCAAAGAGGACTTT
        |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 151524 GAAGAAAACAGAACTTAGACCCCAGATACATACTAACCAAAGAGGACTTT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 TTATCCAATTTTGATATTTTTAAGAAA         AAGAAGCATGTTTT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 151574 TTATCCAATTTTGATATTTTTAAGAAAGTG...TAGAAGAAGCATGTTTT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1725 GAGCTATAAATCACATCCAGTGGAAGATGGTGGAACTGATAATCCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152462 GAGCTATAAATCACATCCAGTGGAAGATGGTGGAACTGATAATCCTGCTT

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1775 TCAACCACATTGAATTGAACTCAGATCAGAGTGGCAAGAGCAATGGGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152512 TCAACCACATTGAATTGAACTCAGATCAGAGTGGCAAGAGCAATGGGACT

   1950     .
   1825 CGTTTG
        ||||||
 152562 CGTTTG