seq1 = pF1KE6492.tfa, 1833 bp
seq2 = pF1KE6492/gi568815582f_24769901.tfa (gi568815582f:24769901_25011530), 241630 bp

>pF1KE6492 1833
>gi568815582f:24769901_25011530 (Chr16)

1-15  (92758-92772)   100% ->
16-120  (100001-100105)   100% ->
121-180  (102260-102319)   100% ->
181-285  (105727-105831)   100% ->
286-391  (107358-107463)   100% ->
392-472  (114151-114231)   100% ->
473-678  (120969-121174)   100% ->
679-814  (128074-128209)   100% ->
815-922  (136757-136864)   99% ->
923-1073  (137125-137275)   100% ->
1074-1242  (138063-138231)   99% ->
1243-1458  (138981-139196)   100% ->
1459-1630  (140406-140577)   100% ->
1631-1833  (141428-141630)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTGTGGTGGCCA         GTGGGTGCATCCTTGTTTGCCAGCAA
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
  92758 ATGGTGTGGTGGCCAGTA...CAGGTGGGTGCATCCTTGTTTGCCAGCAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 TGTTGGAAGTGGACATTTCATTGGCCTGGCAGGGTCAGGTGCTGCTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100027 TGTTGGAAGTGGACATTTCATTGGCCTGGCAGGGTCAGGTGCTGCTACGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 GCATTTCTGTATCAGCTTATGAACTTAAT         GGCTTGTTTTCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 100077 GCATTTCTGTATCAGCTTATGAACTTAATGTA...CAGGGCTTGTTTTCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    133 GTGCTGATGTTGGCCTGGATCTTCCTACCCATCTACATTGCTGGTCAG  
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>
 102272 GTGCTGATGTTGGCCTGGATCTTCCTACCCATCTACATTGCTGGTCAGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    181        GTCACCACGATGCCAGAATACCTACGGAAGCGCTTCGGTGGCA
        >...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102322 G...CAGGTCACCACGATGCCAGAATACCTACGGAAGCGCTTCGGTGGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    224 TCAGAATCCCCATCATCCTGGCTGTACTCTACCTATTTATCTACATCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105770 TCAGAATCCCCATCATCCTGGCTGTACTCTACCTATTTATCTACATCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 ACCAAGATCTCG         GTAGACATGTATGCAGGTGCCATCTTCAT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 105820 ACCAAGATCTCGGTA...CAGGTAGACATGTATGCAGGTGCCATCTTCAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CCAGCAGTCTTTGCACCTGGATCTGTACCTGGCCATAGTTGGGCTACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107387 CCAGCAGTCTTTGCACCTGGATCTGTACCTGGCCATAGTTGGGCTACTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    365 CCATCACTGCTGTATACACGGTTGCTG         GTGGCCTGGCTGCT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 107437 CCATCACTGCTGTATACACGGTTGCTGGTA...CAGGTGGCCTGGCTGCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    406 GTGATCTACACGGATGCCCTGCAGACGCTGATCATGCTTATAGGAGCGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114165 GTGATCTACACGGATGCCCTGCAGACGCTGATCATGCTTATAGGAGCGCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 CACCTTGATGGGCTACA         GTTTCGCCGCGGTTGGTGGGATGG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 114215 CACCTTGATGGGCTACAGTA...TAGGTTTCGCCGCGGTTGGTGGGATGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    497 AAGGACTGAAGGAGAAGTACTTCTTGGCCCTGGCTAGCAACCGGAGTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120993 AAGGACTGAAGGAGAAGTACTTCTTGGCCCTGGCTAGCAACCGGAGTGAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AACAGCAGCTGCGGGCTGCCCCGGGAAGATGCCTTCCATATTTTCCGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121043 AACAGCAGCTGCGGGCTGCCCCGGGAAGATGCCTTCCATATTTTCCGAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 TCCGCTGACATCTGATCTCCCGTGGCCGGGGGTCCTATTTGGAATGTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 121093 TCCGCTGACATCTGATCTCCCGTGGCCGGGGGTCCTATTTGGAATGTCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCCCATCCCTCTGGTACTGGTGCACGGATCAG         GTGATTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 121143 TCCCATCCCTCTGGTACTGGTGCACGGATCAGGTA...CAGGTGATTGTC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    688 CAGCGGACTCTGGCTGCCAAGAACCTGTCCCATGCCAAAGGAGGTGCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128083 CAGCGGACTCTGGCTGCCAAGAACCTGTCCCATGCCAAAGGAGGTGCTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GATGGCTGCATACCTGAAGGTGCTGCCCCTCTTCATAATGGTGTTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128133 GATGGCTGCATACCTGAAGGTGCTGCCCCTCTTCATAATGGTGTTCCCTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 GGATGGTCAGCCGCATCCTCTTCCCAG         ATCAAGTGGCCTGT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 128183 GGATGGTCAGCCGCATCCTCTTCCCAGGTG...TAGATCAAGTGGCCTGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 GCAGATCCAGAGATCTGCCAGAAGATCTGCAGCAACCCCTCAGGCTGTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136771 GCAGATCCAGAGATCTGCCAGAAGATCTGCAGCAACCCCTCAGGCTGTTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGACATTGCGTATCCCAAACTCGTGCTGGAACTCCTGCCCACAG      
        |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 136821 GGACATCGCGTATCCCAAACTCGTGCTGGAACTCCTGCCCACAGGTA...

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    923    GGCTCCGTGGGCTGATGATGGCTGTGATGGTGGCGGCTCTCATGTCC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137122 CAGGGCTCCGTGGGCTGATGATGGCTGTGATGGTGGCGGCTCTCATGTCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 TCCCTCACCTCCATCTTTAACAGTGCCAGCACCATCTTCACCATGGACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137172 TCCCTCACCTCCATCTTTAACAGTGCCAGCACCATCTTCACCATGGACCT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 CTGGAATCACCTCCGGCCTCGGGCATCTGAGAAGGAGCTCATGATTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137222 CTGGAATCACCTCCGGCCTCGGGCATCTGAGAAGGAGCTCATGATTGTGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 GCAG         GGTGTTTGTGCTGCTGCTGGTCCTGGTCTCCATCCTC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137272 GCAGGTA...CAGGGTGTTTGTGCTGCTGCTGGTCCTGGTCTCCATCCTC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 TGGATCCCTGTGGTCCAGGCCAGCCAGGGCGGCCAGCTCTTCATCTATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138100 TGGATCCCTGTGGTCCAGGCCAGCCAGGGCGGCCAGCTCTTCATCTATAT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 CCGGTCCATCAGCTCCTACCTGCAGCCGCCTGTGGCGGTGGTCTTCATCA
        || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138150 CCAGTCCATCAGCTCCTACCTGCAGCCGCCTGTGGCGGTGGTCTTCATCA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 TGGGATGTTTCTGGAAGAGGACCAATGAAAAG         GGTGCCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 138200 TGGGATGTTTCTGGAAGAGGACCAATGAAAAGGTA...CAGGGTGCCTTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 TGGGGCCTGATCTCGGGCCTGCTCCTGGGCTTGGTTAGGCTGGTCCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138990 TGGGGCCTGATCTCGGGCCTGCTCCTGGGCTTGGTTAGGCTGGTCCTGGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 CTTTATTTACGTGCAGCCTCGATGCGACCAGCCAGATGAGCGCCCGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139040 CTTTATTTACGTGCAGCCTCGATGCGACCAGCCAGATGAGCGCCCGGTCC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 TGGTGAAGAGCATTCACTACCTCTACTTCTCCATGATCCTGTCCACGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139090 TGGTGAAGAGCATTCACTACCTCTACTTCTCCATGATCCTGTCCACGGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1402 ACCCTCATCACTGTCTCCACCGTGAGCTGGTTCACAGAGCCACCCTCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139140 ACCCTCATCACTGTCTCCACCGTGAGCTGGTTCACAGAGCCACCCTCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1452 GGAGATG         GTCAGCCACCTGACCTGGTTTACTCGTCACGACC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139190 GGAGATGGTA...TAGGTCAGCCACCTGACCTGGTTTACTCGTCACGACC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1493 CCGTGGTCCAGAAGGAACAAGCACCACCAGCAGCTCCCTTGTCTCTTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140440 CCGTGGTCCAGAAGGAACAAGCACCACCAGCAGCTCCCTTGTCTCTTACC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1543 CTCTCTCAGAACGGGATGCCAGAGGCCAGCAGCAGCAGCAGCGTCCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 140490 CTCTCTCAGAACGGGATGCCAGAGGCCAGCAGCAGCAGCAGCGTCCAGTT

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1593 CGAGATGGTTCAAGAAAACACGTCTAAAACCCACAGCT         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 140540 CGAGATGGTTCAAGAAAACACGTCTAAAACCCACAGCTGTG...TAGGTG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1634 ACATGACCCCAAAGCAGTCCAAAGTGGTGAAGGCCATCCTGTGGCTCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141431 ACATGACCCCAAAGCAGTCCAAAGTGGTGAAGGCCATCCTGTGGCTCTGT

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1684 GGAATACAGGAGAAGGGCAAGGAAGAGCTCCCGGCCAGAGCAGAAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141481 GGAATACAGGAGAAGGGCAAGGAAGAGCTCCCGGCCAGAGCAGAAGCCAT

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1734 CATAGTTTCCCTGGAAGAAAACCCCTTGGTGAAGACCCTCCTGGACGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141531 CATAGTTTCCCTGGAAGAAAACCCCTTGGTGAAGACCCTCCTGGACGTCA

   1900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1784 ACCTCATTTTCTGCGTGAGCTGCGCCATCTTTATCTGGGGCTATTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 141581 ACCTCATTTTCTGCGTGAGCTGCGCCATCTTTATCTGGGGCTATTTTGCT