seq1 = pF1KE6476.tfa, 1437 bp
seq2 = pF1KE6476/gi568815583r_89372738.tfa (gi568815583r:89372738_89596544), 223807 bp

>pF1KE6476 1437
>gi568815583r:89372738_89596544 (Chr15)

(complement)

1-184  (100001-100184)   100% ->
185-371  (109560-109746)   100% ->
372-522  (113328-113478)   100% ->
523-670  (116137-116284)   100% ->
671-837  (117057-117223)   100% ->
838-975  (118571-118708)   100% ->
976-1112  (118892-119028)   99% ->
1113-1237  (119339-119463)   100% ->
1238-1311  (119717-119790)   100% ->
1312-1437  (123682-123807)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTGGAACACCAACCTCCGCTGGCGGCTGCCGCTCACCTGCCTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTGGAACACCAACCTCCGCTGGCGGCTGCCGCTCACCTGCCTGCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCTGCAGGTGATTATGGTGATTCTCTTCGGGGTGTTCGTGCGCTACGACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCTGCAGGTGATTATGGTGATTCTCTTCGGGGTGTTCGTGCGCTACGACT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TCGAGGCCGACGCCCACTGGTGGTCAGAGAGGACGCACAAGAACTTGAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TCGAGGCCGACGCCCACTGGTGGTCAGAGAGGACGCACAAGAACTTGAGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACATGGAGAACGAATTCTACTATCGCTACCCAA         GCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 100151 GACATGGAGAACGAATTCTACTATCGCTACCCAAGTA...CAGGCTTCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GGACGTGCACGTGATGGTCTTCGTGGGCTTCGGCTTCCTCATGACTTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109567 GGACGTGCACGTGATGGTCTTCGTGGGCTTCGGCTTCCTCATGACTTTCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 TGCAGCGCTACGGCTTCAGCGCCGTGGGCTTCAACTTCCTGTTGGCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109617 TGCAGCGCTACGGCTTCAGCGCCGTGGGCTTCAACTTCCTGTTGGCAGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 TTCGGCATCCAGTGGGCGCTGCTCATGCAGGGCTGGTTCCACTTCTTACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109667 TTCGGCATCCAGTGGGCGCTGCTCATGCAGGGCTGGTTCCACTTCTTACA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 AGACCGCTACATCGTCGTGGGCGTGGAGAA         CCTCATCAACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 109717 AGACCGCTACATCGTCGTGGGCGTGGAGAAGTG...CAGCCTCATCAACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CTGACTTCTGCGTGGCCTCTGTCTGCGTGGCCTTTGGGGCAGTTCTGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113339 CTGACTTCTGCGTGGCCTCTGTCTGCGTGGCCTTTGGGGCAGTTCTGGGT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 AAAGTCAGCCCCATTCAGCTGCTCATCATGACTTTCTTCCAAGTGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113389 AAAGTCAGCCCCATTCAGCTGCTCATCATGACTTTCTTCCAAGTGACCCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTTCGCTGTGAATGAGTTCATTCTCCTTAACCTGCTAAAG         G
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 113439 CTTCGCTGTGAATGAGTTCATTCTCCTTAACCTGCTAAAGGTG...CAGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TGAAGGATGCAGGAGGCTCCATGACCATCCACACATTTGGCGCCTACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116138 TGAAGGATGCAGGAGGCTCCATGACCATCCACACATTTGGCGCCTACTTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GGGCTCACAGTGACCCGGATCCTCTACCGACGCAACCTAGAGCAGAGCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116188 GGGCTCACAGTGACCCGGATCCTCTACCGACGCAACCTAGAGCAGAGCAA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 GGAGAGACAGAATTCTGTGTACCAGTCGGACCTCTTTGCCATGATTG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 116238 GGAGAGACAGAATTCTGTGTACCAGTCGGACCTCTTTGCCATGATTGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    671       GCACCCTCTTCCTGTGGATGTACTGGCCCAGCTTCAACTCAGCC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116288 ...CAGGCACCCTCTTCCTGTGGATGTACTGGCCCAGCTTCAACTCAGCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 ATATCCTACCATGGGGACAGCCAGCACCGAGCCGCCATCAACACCTACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117101 ATATCCTACCATGGGGACAGCCAGCACCGAGCCGCCATCAACACCTACTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CTCCTTGGCAGCCTGCGTGCTTACCTCGGTGGCAATATCCAGTGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117151 CTCCTTGGCAGCCTGCGTGCTTACCTCGGTGGCAATATCCAGTGCCCTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 ACAAGAAGGGCAAGCTGGACATG         GTGCACATCCAGAATGCC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 117201 ACAAGAAGGGCAAGCTGGACATGGTG...CAGGTGCACATCCAGAATGCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ACGCTCGCAGGAGGGGTGGCCGTGGGTACCGCTGCTGAGATGATGCTCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118589 ACGCTCGCAGGAGGGGTGGCCGTGGGTACCGCTGCTGAGATGATGCTCAT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 GCCTTACGGTGCCCTCATCATCGGCTTCGTCTGCGGCATCATCTCCACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118639 GCCTTACGGTGCCCTCATCATCGGCTTCGTCTGCGGCATCATCTCCACCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TGGGTTTTGTATACCTGACC         CCATTCCTGGAGTCCCGGCTG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 118689 TGGGTTTTGTATACCTGACCGTA...CAGCCATTCCTGGAGTCCCGGCTG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CACATCCAGGACACATGCGGCATTAACAATCTGCATGGCATTCCTGGCAT
        ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
 118913 CACATCCAGGACACATGTGGCATTAACAATCTGCATGGCATTCCTGGCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CATAGGCGGCATCGTGGGTGCTGTGACAGCGGCCTCCGCCAGCCTTGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118963 CATAGGCGGCATCGTGGGTGCTGTGACAGCGGCCTCCGCCAGCCTTGAAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 TCTATGGAAAAGAAGG         GCTTGTCCATTCCTTTGACTTTCAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 119013 TCTATGGAAAAGAAGGGTA...CAGGCTTGTCCATTCCTTTGACTTTCAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GGTTTCAACGGGGACTGGACCGCAAGAACACAGGGAAAGTTCCAGATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119364 GGTTTCAACGGGGACTGGACCGCAAGAACACAGGGAAAGTTCCAGATTTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 TGGTCTCTTGGTGACCCTGGCCATGGCCCTGATGGGTGGCATCATTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119414 TGGTCTCTTGGTGACCCTGGCCATGGCCCTGATGGGTGGCATCATTGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238          GGCTCATTTTGAGATTACCATTCTGGGGACAACCTTCAGAT
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119464 GTG...TAGGGCTCATTTTGAGATTACCATTCTGGGGACAACCTTCAGAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 GAGAACTGCTTTGAGGATGCGGTCTACTGGGAG         ATGCCTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 119758 GAGAACTGCTTTGAGGATGCGGTCTACTGGGAGGTG...TAGATGCCTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 AGGGAACAGCACTGTCTACATCCCTGAGGACCCCACCTTCAAGCCCTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123690 AGGGAACAGCACTGTCTACATCCCTGAGGACCCCACCTTCAAGCCCTCAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 GACCCTCAGTACCCTCAGTACCCATGGTGTCCCCACTACCCATGGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123740 GACCCTCAGTACCCTCAGTACCCATGGTGTCCCCACTACCCATGGCTTCC

   1500     .    :    .
   1420 TCGGTACCCTTGGTACCC
        ||||||||||||||||||
 123790 TCGGTACCCTTGGTACCC