seq1 = pF1KE6474.tfa, 1410 bp
seq2 = pF1KE6474/gi568815590r_86114416.tfa (gi568815590r:86114416_86330277), 215862 bp

>pF1KE6474 1410
>gi568815590r:86114416_86330277 (Chr8)

(complement)

1-685  (100001-100685)   100% ->
686-817  (107175-107306)   99% ->
818-1179  (112447-112808)   100% ->
1180-1410  (115632-115862)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGATAGAGGGGAGAAAATACAGCTCAAGAGAGTGTTTGGATATTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGATAGAGGGGAGAAAATACAGCTCAAGAGAGTGTTTGGATATTGGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCACAAGTTTTTTGCTTATTAATATCATTGGTGCAGGAATTTTTGTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGGCACAAGTTTTTTGCTTATTAATATCATTGGTGCAGGAATTTTTGTGT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCCCAAAGGTGTGTTGGCATACTCTTGCATGAACGTGGGAGTCTCCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCCCAAAGGTGTGTTGGCATACTCTTGCATGAACGTGGGAGTCTCCCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCGTTTGGGCTGGCTGTGCCATACTGGCCATGACATCAACTCTTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGCGTTTGGGCTGGCTGTGCCATACTGGCCATGACATCAACTCTTTGCTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TGCAGAGATAAGTATAAGCTTCCCATGCAGTGGAGCTCAATACTATTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TGCAGAGATAAGTATAAGCTTCCCATGCAGTGGAGCTCAATACTATTTTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAAGAGATACTTTGGCTCCACGGTTGCTTTTTTGAATCTCTGGACATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAAGAGATACTTTGGCTCCACGGTTGCTTTTTTGAATCTCTGGACATCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTGTTTCTGGGGTCAGGGGTAGTTGCTGGCCAAGCTCTGCTCCTTGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTGTTTCTGGGGTCAGGGGTAGTTGCTGGCCAAGCTCTGCTCCTTGCTGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GTACAGCATCCAGCCTTTTTTTCCCAGCTGCTCTGTCCCAAAGCTGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GTACAGCATCCAGCCTTTTTTTCCCAGCTGCTCTGTCCCAAAGCTGCCTA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGAAATGTCTGGCATTGGCCATGTTGTGGATTGTAGGAATTCTGACTTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGAAATGTCTGGCATTGGCCATGTTGTGGATTGTAGGAATTCTGACTTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CGTGGTGTGAAAGAAGTGACTTGGCTTCAGATAGCTAGCTCAGTGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CGTGGTGTGAAAGAAGTGACTTGGCTTCAGATAGCTAGCTCAGTGCTGAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 AGTGTCCATACTTAGCTTCATTTCCCTAACTGGAGTAGTGTTCCTGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 AGTGTCCATACTTAGCTTCATTTCCCTAACTGGAGTAGTGTTCCTGATAA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GAGGGAAAAAGGAGAATGTAGAACGATTTCAGAATGCTTTTGATGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GAGGGAAAAAGGAGAATGTAGAACGATTTCAGAATGCTTTTGATGCTGAA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CTTCCAGATATCTCTCACCTTATACAAGCCATCTTCCAAGGATATTTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CTTCCAGATATCTCTCACCTTATACAAGCCATCTTCCAAGGATATTTTGC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 ATATTCAGGCGGGGCATGCTTTACACTTATAGCAG         GGGAGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 100651 ATATTCAGGCGGGGCATGCTTTACACTTATAGCAGGTA...TAGGGGAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 TGAAGAAGCCCAGAACAACAATTCCCAAATGCATATTTACTGCGTTACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107181 TGAAGAAGCCCAGAACAACAATTCCCAAATGCATATTTACTGCGTTACCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CTGATGACTGTAGTTTATTTACTGGTTAACATTTCCTATCTGACTGTTCT
        ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107231 CTGGTGACTGTAGTTTATTTACTGGTTAACATTTCCTATCTGACTGTTCT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 GACACCCAGGGAAATTCTCTCTTCAG         ATGCTGTAGCTATCA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 107281 GACACCCAGGGAAATTCTCTCTTCAGGTT...CAGATGCTGTAGCTATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CATGGGCTGATCGAGCTTTTCCCTCATTAGCATGGATTATGCCTTTTGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112462 CATGGGCTGATCGAGCTTTTCCCTCATTAGCATGGATTATGCCTTTTGCT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 ATTTCTACCTCATTATTTAGCAACCTTCTGATTTCTATATTTAAATCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112512 ATTTCTACCTCATTATTTAGCAACCTTCTGATTTCTATATTTAAATCATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 GAGACCAATATATCTTGCAAGCCAAGAGGGCCAGCTGCCTTTGCTATTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112562 GAGACCAATATATCTTGCAAGCCAAGAGGGCCAGCTGCCTTTGCTATTTA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 ATACACTTAATAGTCACTCTTCTCCATTTACAGCTGTGCTACTACTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112612 ATACACTTAATAGTCACTCTTCTCCATTTACAGCTGTGCTACTACTTGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 ACTTTGGGATCCCTTGCAATTATCTTAACAAGTCTAATTGATTTGATAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112662 ACTTTGGGATCCCTTGCAATTATCTTAACAAGTCTAATTGATTTGATAAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CTATATTTTTTTCACGGGTTCATTATGGTCTATATTATTAATGATAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112712 CTATATTTTTTTCACGGGTTCATTATGGTCTATATTATTAATGATAGGAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 TACTAAGGCGGAGATACCAGGAACCCAATCTATCTATACCTTATAAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 112762 TACTAAGGCGGAGATACCAGGAACCCAATCTATCTATACCTTATAAGGTA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1180       GTGTTTTTGTCATTTCCATTAGCAACAATAGTCATCGACGTGGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112812 ...CAGGTGTTTTTGTCATTTCCATTAGCAACAATAGTCATCGACGTGGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CTTGGTTGTGATACCATTGGTAAAGTCTCCAAATGTGCATTATGTCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115676 CTTGGTTGTGATACCATTGGTAAAGTCTCCAAATGTGCATTATGTCTACG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TGCTTCTGTTAGTTCTCAGCGGATTACTATTTTACATACCTTTAATACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115726 TGCTTCTGTTAGTTCTCAGCGGATTACTATTTTACATACCTTTAATACAT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 TTTAAAATAAGATTGGCTTGGTTTGAGAAGATGACTTGCTATTTACAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115776 TTTAAAATAAGATTGGCTTGGTTTGAGAAGATGACTTGCTATTTACAATT

   1400     .    :    .    :    .    :    .
   1374 ACTATTTAATATTTGCCTCCCTGATGTGTCTGAGGAA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 115826 ACTATTTAATATTTGCCTCCCTGATGTGTCTGAGGAA