seq1 = pF1KE6471.tfa, 1422 bp
seq2 = pF1KE6471/gi568815596r_102618423.tfa (gi568815596r:102618423_102836810), 218388 bp

>pF1KE6471 1422
>gi568815596r:102618423_102836810 (Chr2)

(complement)

1-165  (100001-100165)   100% ->
166-253  (104402-104489)   100% ->
254-297  (105743-105786)   100% ->
298-427  (109837-109966)   100% ->
428-637  (112902-113111)   100% ->
638-1422  (117604-118388)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGCTTGGGGGTCACTGGGACATGAACTCGGCCCCGAGGCTGGTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGCTTGGGGGTCACTGGGACATGAACTCGGCCCCGAGGCTGGTCTC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGAGACCGCAGAGCGGAAACAGGAGCAGAAGACAGGAACCGAGGCGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGAGACCGCAGAGCGGAAACAGGAGCAGAAGACAGGAACCGAGGCGGAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTGCCGACTCCGGTGCCGTCGGAGCCCGCCGCTTCCTGCTCTGTCTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTGCCGACTCCGGTGCCGTCGGAGCCCGCCGCTTCCTGCTCTGTCTCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TTGGTGGGCTTCTTG         GATTTGTTTGGTGTCAGCATGGTTGT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100151 TTGGTGGGCTTCTTGGTG...TAGGATTTGTTTGGTGTCAGCATGGTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 GCCTTTATTGAGCCTTCATGTCAAGTCCCTTGGAGCAAGTCCAACAGTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104428 GCCTTTATTGAGCCTTCATGTCAAGTCCCTTGGAGCAAGTCCAACAGTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTGGAATAGTAG         GCTCCTCCTATGGCATTTTGCAACTCTTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 104478 CTGGAATAGTAGGTG...CAGGCTCCTCCTATGGCATTTTGCAACTCTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCTAGCACATTGGTG         GGCTGCTGGAGCGATGTAGTGGGAAG
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 105772 TCTAGCACATTGGTGGTA...CAGGGCTGCTGGAGCGATGTAGTGGGAAG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 ACGGTCTTCCTTGCTGGCATGCATTCTACTCAGTGCTCTGGGCTATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109863 ACGGTCTTCCTTGCTGGCATGCATTCTACTCAGTGCTCTGGGCTATCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTCTCGGAGCAGCCACCAATGTGTTTCTGTTTGTCCTGGCTAGAGTCCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109913 TTCTCGGAGCAGCCACCAATGTGTTTCTGTTTGTCCTGGCTAGAGTCCCG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCAG         GTATTTTTAAACACACTCTCTCCATCTCAAGGGCTCT
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 109963 GCAGGTG...CAGGTATTTTTAAACACACTCTCTCCATCTCAAGGGCTCT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 ACTTTCTGATGTGGTTCCAGAGAAGGAACGGCCGCTTGTAATCGGACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112939 ACTTTCTGATGTGGTTCCAGAGAAGGAACGGCCGCTTGTAATCGGACACT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TCAACACAGCCTCCGGTGTGGGCTTCATCTTGGGCCCCGTGGTCGGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112989 TCAACACAGCCTCCGGTGTGGGCTTCATCTTGGGCCCCGTGGTCGGTGGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 TATCTCACTGAATTAGAGGATGGGTTTTATCTCACAGCCTTCATCTGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113039 TATCTCACTGAATTAGAGGATGGGTTTTATCTCACAGCCTTCATCTGCTT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 TTTGGTCTTCATTCTCAATGCTG         GTCTCGTTTGGTTCTTTC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 113089 TTTGGTCTTCATTCTCAATGCTGGTA...CAGGTCTCGTTTGGTTCTTTC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CATGGAGGGAAGCAAAACCGGGCAGTACAGAGAAGGGCCTGCCATTGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117622 CATGGAGGGAAGCAAAACCGGGCAGTACAGAGAAGGGCCTGCCATTGCGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 AAGACCCATGTGCTGTTGGGAAGGAGCCATGACACAGTGCAGGAGGCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117672 AAGACCCATGTGCTGTTGGGAAGGAGCCATGACACAGTGCAGGAGGCAGC

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 CACCAGCCGCAGAGCCAGGGCCAGCAAGAAGACTGCCCAGCCCTGGGTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117722 CACCAGCCGCAGAGCCAGGGCCAGCAAGAAGACTGCCCAGCCCTGGGTCG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 AAGTAGTGTTGGCCTTGCGGAACATGAAGAACCTGCTGTTTTCCGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117772 AAGTAGTGTTGGCCTTGCGGAACATGAAGAACCTGCTGTTTTCCGAAATG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 TGGGACATATTTCTGGTGCGCTTGCTGATGGCCATGGCAGTCATGCTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117822 TGGGACATATTTCTGGTGCGCTTGCTGATGGCCATGGCAGTCATGCTGTA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CTACAGTAACTTTGTCCTGGCCCTGGAGGAGCGCTTTGGGGTGCGGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117872 CTACAGTAACTTTGTCCTGGCCCTGGAGGAGCGCTTTGGGGTGCGGCCCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGGTGACAGGCTACCTCATCAGTTACAGCAGCATGCTGGGGGCCGTGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117922 AGGTGACAGGCTACCTCATCAGTTACAGCAGCATGCTGGGGGCCGTGGCC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1006 GGCCTTGCCCTGGGGCCAATCCTACGGCTGTACAAGCACAACTCGCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117972 GGCCTTGCCCTGGGGCCAATCCTACGGCTGTACAAGCACAACTCGCAGGC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1056 ACTGCTGCTGCATTCCAGCATACTCACCTGCACACTGCTGCTGCTCTACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118022 ACTGCTGCTGCATTCCAGCATACTCACCTGCACACTGCTGCTGCTCTACT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1106 CCTTGGCCCCCACCATGGGTGCAGTTGTCCTCTCCTCCACTCTCCTGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118072 CCTTGGCCCCCACCATGGGTGCAGTTGTCCTCTCCTCCACTCTCCTGTCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1156 TTCTCCACTGCCATTGGCAGGACGTGCATCACGGACCTCCAGCTGACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118122 TTCTCCACTGCCATTGGCAGGACGTGCATCACGGACCTCCAGCTGACTGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1206 GGGCGGGGCCCAGGCCAGCGGCACCCTTATTGGCGTGGGGCAGTCTGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118172 GGGCGGGGCCCAGGCCAGCGGCACCCTTATTGGCGTGGGGCAGTCTGTGA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1256 CTGCAGTGGGCCGCATCATCGCCCCTCTCCTCTCGGGGGTTGCCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118222 CTGCAGTGGGCCGCATCATCGCCCCTCTCCTCTCGGGGGTTGCCCAGGAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 GTCAGCCCTTGCGGCCCCCCCAGCCTGGGTGCTGTGTTAGCCTTAGTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||
 118272 GTCAGCCCTTGCGGCCCCCCCAGCCTGGGCGCTGTGTTAGCCTTAGTGGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 CATTTTCATAATGTCTCTAAACAAGCGACACTCTAGTGGTGATGGGAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118322 CATTTTCATAATGTCTCTAAACAAGCGACACTCTAGTGGTGATGGGAATA

   1450     .    :    .
   1406 GTAAATTAAAAAGTGAG
        |||||||||||||||||
 118372 GTAAATTAAAAAGTGAG