seq1 = pF1KE6468.tfa, 1776 bp
seq2 = pF1KE6468/gi568815595r_45658981.tfa (gi568815595r:45658981_45896419), 237439 bp

>pF1KE6468 1776
>gi568815595r:45658981_45896419 (Chr3)

(complement)

1-121  (100001-100121)   100% ->
122-262  (114197-114337)   100% ->
263-354  (116320-116411)   100% ->
355-582  (120432-120659)   99% ->
583-693  (123805-123915)   100% ->
694-935  (124962-125203)   100% ->
936-1098  (126049-126211)   100% ->
1099-1303  (130679-130883)   99% ->
1304-1463  (133348-133507)   100% ->
1464-1629  (136398-136563)   100% ->
1630-1776  (137293-137439)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGAAAGCGCGGCCGCTGTGGGCCAACTCGCTACAGTTCGTGTTCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGAAAGCGCGGCCGCTGTGGGCCAACTCGCTACAGTTCGTGTTCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CTGCATCTCGTACGCCGTGGGCCTGGGCAACGTGTGGCGATTCCCGTACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CTGCATCTCGTACGCCGTGGGCCTGGGCAACGTGTGGCGATTCCCGTACC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TGTGCCAGATGTACGGCGGAG         GTAGTTTCCTGGTCCCCTAC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 100101 TGTGCCAGATGTACGGCGGAGGTG...CAGGTAGTTTCCTGGTCCCCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCATCATGCTTATCGTGGAGGGAATGCCGCTCTTGTACCTGGAACTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114217 ATCATCATGCTTATCGTGGAGGGAATGCCGCTCTTGTACCTGGAACTGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTGGGGCAGCGCATGCGGCAGGGCAGCATCGGCGCCTGGAGGACCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114267 TGTGGGGCAGCGCATGCGGCAGGGCAGCATCGGCGCCTGGAGGACCATCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCCCGTACCTCAGTGGTGTCG         GGGTCGCCAGCGTGGTGGTC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 114317 GCCCGTACCTCAGTGGTGTCGGTA...CAGGGGTCGCCAGCGTGGTGGTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TCTTTCTTCCTCTCCATGTACTACAACGTCATCAACGCCTGGGCCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116340 TCTTTCTTCCTCTCCATGTACTACAACGTCATCAACGCCTGGGCCTTCTG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GTACCTCTTCCACTCCTTCCAG         GATCCCCTGCCGTGGTCTG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 116390 GTACCTCTTCCACTCCTTCCAGGTG...CAGGATCCCCTGCCGTGGTCTG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTGCCCACTGAATGGTAACCACACGGGCTACGATGAGGAGTGCGAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 120451 TCTGCCCACTGAATGGTAACCACACGGGCTACGATGAGGAGTGTGAGAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GCGTCCTCCACACAGTACTTCTGGTACAGGAAAACCCTCAATATCTCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120501 GCGTCCTCCACACAGTACTTCTGGTACAGGAAAACCCTCAATATCTCGCC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 GTCCCTCCAGGAGAACGGGGGTGTGCAGTGGGAGCCGGCGCTGTGCCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120551 GTCCCTCCAGGAGAACGGGGGTGTGCAGTGGGAGCCGGCGCTGTGCCTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 TCCTGGCCTGGCTGGTGGTGTACCTGTGCATCCTGCGTGGCACCGAGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120601 TCCTGGCCTGGCTGGTGGTGTACCTGTGCATCCTGCGTGGCACCGAGTCC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 ACTGGCAAG         GTGGTGTATTTCACGGCGTCACTGCCCTATTG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 120651 ACTGGCAAGGTG...CAGGTGGTGTATTTCACGGCGTCACTGCCCTATTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 CGTGCTCATCATCTACCTCATCAGGGGCCTCACGCTCCACGGAGCCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123837 CGTGCTCATCATCTACCTCATCAGGGGCCTCACGCTCCACGGAGCCACCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 ATGGCCTCATGTACATGTTCACTCCCAAG         ATAGAGCAGCTG
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 123887 ATGGCCTCATGTACATGTTCACTCCCAAGGTA...CAGATAGAGCAGCTG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 GCCAACCCCAAGGCCTGGATCAATGCAGCCACCCAGATCTTCTTCTCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124974 GCCAACCCCAAGGCCTGGATCAATGCAGCCACCCAGATCTTCTTCTCACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGGCCTGGGCTTCGGCAGCCTGATCGCCTTCGCCAGCTACAATGAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125024 TGGCCTGGGCTTCGGCAGCCTGATCGCCTTCGCCAGCTACAATGAGCCAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 CCAACAACTGCCAGAAGCACGCCATCATCGTGTCCCTCATCAACAGCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125074 CCAACAACTGCCAGAAGCACGCCATCATCGTGTCCCTCATCAACAGCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 ACCTCCATATTTGCCAGCATTGTCACCTTCTCCATCTATGGCTTCAAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 125124 ACCTCCATATTTGCCAGCATTGTCACCTTCTCCATCTATGGCTTCAAGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 CACCTTCAATTATGAAAACTGCTTGAAGAA         GGTGAGTCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||
 125174 CACCTTCAATTATGAAAACTGCTTGAAGAAGTA...CAGGGTGAGTCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    947 TGCTGACCAACACTTTTGACCTTGAAGATGGCTTTTTGACAGCCAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126060 TGCTGACCAACACTTTTGACCTTGAAGATGGCTTTTTGACAGCCAGCAAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 CTGGAGCAGGTGAAGGGCTACCTCGCATCTGCCTACCCAAGCAAATACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126110 CTGGAGCAGGTGAAGGGCTACCTCGCATCTGCCTACCCAAGCAAATACAG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CGAGATGTTCCCGCAAATCAAAAACTGCAGCTTGGAATCGGAGCTAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126160 CGAGATGTTCCCGCAAATCAAAAACTGCAGCTTGGAATCGGAGCTAGACA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 CG         GCCGTCCAGGGCACTGGCCTGGCATTCATCGTCTATACA
        ||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
 126210 CGGTA...CAGGCCGTCCAGGGCACTGGCCTGGCATTCATCGTCTACACA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1138 GAGGCCATTAAAAACATGGAGGTGTCCCAGCTGTGGTCGGTGCTCTACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130718 GAGGCCATTAAAAACATGGAGGTGTCCCAGCTGTGGTCGGTGCTCTACTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 CTTCATGCTGCTGATGCTGGGCATTGGGAGCATGCTGGGGAACACAGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130768 CTTCATGCTGCTGATGCTGGGCATTGGGAGCATGCTGGGGAACACAGCGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 CCATCCTCACCCCTCTGACAGACAGCAAGATCATCTCCAGCCACCTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130818 CCATCCTCACCCCTCTGACAGACAGCAAGATCATCTCCAGCCACCTGCCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1288 AAGGAGGCCATCTCAG         GTCTGGTGTGCCTTGTCAACTGTGC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 130868 AAGGAGGCCATCTCAGGTC...CAGGTCTGGTGTGCCTTGTCAACTGTGC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CATTGGCATGGTGTTCACGATGGAGGCTGGGAACTACTGGTTTGACATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133373 CATTGGCATGGTGTTCACGATGGAGGCTGGGAACTACTGGTTTGACATAT

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TCAACGACTACGCGGCCACACTGTCCCTGCTGCTCATCGTGCTGGTGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133423 TCAACGACTACGCGGCCACACTGTCCCTGCTGCTCATCGTGCTGGTGGAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 ACGATTGCCGTGTGCTACGTGTACGGGCTGAGGAG         ATTTGA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 133473 ACGATTGCCGTGTGCTACGTGTACGGGCTGAGGAGGTG...TAGATTTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 AAGTGACCTTAAGGCCATGACCGGCCGAGCTGTGAGCTGGTACTGGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136404 AAGTGACCTTAAGGCCATGACCGGCCGAGCTGTGAGCTGGTACTGGAAGG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 TGATGTGGGCTGGCGTAAGCCCACTGCTGATTGTCAGCCTCTTTGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136454 TGATGTGGGCTGGCGTAAGCCCACTGCTGATTGTCAGCCTCTTTGTCTTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 TACCTGAGCGACTACATCCTCACGGGGACCCTGAAGTATCAAGCCTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136504 TACCTGAGCGACTACATCCTCACGGGGACCCTGAAGTATCAAGCCTGGGA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 CGCCTCCCAG         GGCCAGCTCGTGACCAAAGATTACCCGGCCT
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 136554 CGCCTCCCAGGTA...CAGGGCCAGCTCGTGACCAAAGATTACCCGGCCT

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1661 ATGCACTGGCTGTCATCGGGCTGCTTGTGGCCTCCTCCACCATGTGCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137324 ATGCACTGGCTGTCATCGGGCTGCTTGTGGCCTCCTCCACCATGTGCATC

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1711 CCCCTGGCGGCCCTGGGGACTTTTGTTCAGCGTCGCCTCAAGAGGGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137374 CCCCTGGCGGCCCTGGGGACTTTTGTTCAGCGTCGCCTCAAGAGGGGAGA

   1850     .    :    .
   1761 CGCAGACCCCGTGGCC
        ||||||||||||||||
 137424 CGCAGACCCCGTGGCC