seq1 = pF1KE6462.tfa, 1482 bp
seq2 = pF1KE6462/gi568815591r_140235415.tfa (gi568815591r:140235415_140482526), 247112 bp

>pF1KE6462 1482
>gi568815591r:140235415_140482526 (Chr7)

(complement)

1-89  (100001-100089)   100% ->
90-198  (102137-102245)   100% ->
199-291  (112845-112937)   100% ->
292-375  (118036-118119)   100% ->
376-521  (123742-123887)   100% ->
522-618  (126763-126859)   100% ->
619-703  (130381-130465)   100% ->
704-882  (131076-131254)   100% ->
883-1024  (133760-133901)   100% ->
1025-1126  (136557-136658)   100% ->
1127-1174  (137264-137311)   100% ->
1175-1326  (138964-139115)   100% ->
1327-1392  (145178-145243)   100% ->
1393-1482  (147023-147112)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCTGGCCAAATGTTTTTCAAAGAGGGTCTCTGCTGTCCCAGTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCTGGCCAAATGTTTTTCAAAGAGGGTCTCTGCTGTCCCAGTTCAG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCATCATCATGTTGTAGTGTTCCTGCTCACTTTCTTCAG         TT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 100051 CCATCATCATGTTGTAGTGTTCCTGCTCACTTTCTTCAGGTA...TAGTT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ATTCGTTGCTCCATGCTTCACGAAAAACATTTAGCAATGTCAAAGTCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102139 ATTCGTTGCTCCATGCTTCACGAAAAACATTTAGCAATGTCAAAGTCAGT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 ATCTCTGAGCAGTGGACCCCAAGTGCTTTTAACACGTCAGTTGAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102189 ATCTCTGAGCAGTGGACCCCAAGTGCTTTTAACACGTCAGTTGAGCTGCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 TGTGGAG         ATCTGGAGCAGCAACCATTTGTTCCCCAGTGCAG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102239 TGTGGAGGTA...TAGATCTGGAGCAGCAACCATTTGTTCCCCAGTGCAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 AGAAAGCGACTCTTTTCCTCGGCACACTGGATACCATTTTCCTCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112879 AGAAAGCGACTCTTTTCCTCGGCACACTGGATACCATTTTCCTCTTCTCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 TATGCTGTG         GGCCTATTCATCAGTGGCATCGTTGGGGATCG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 112929 TATGCTGTGGTA...TAGGGCCTATTCATCAGTGGCATCGTTGGGGATCG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GTTGAATTTGCGATGGGTTCTGTCTTTTGGCATGTGCTCTTCTGCATTAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118068 GTTGAATTTGCGATGGGTTCTGTCTTTTGGCATGTGCTCTTCTGCATTAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TG         GTGTTTGTCTTTGGTGCGCTCACAGAATGGCTGCGTTTC
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 118118 TGGTA...AAGGTGTTTGTCTTTGGTGCGCTCACAGAATGGCTGCGTTTC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 TACAACAAATGGCTGTACTGCTGCCTGTGGATTGTGAACGGCCTGCTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123781 TACAACAAATGGCTGTACTGCTGCCTGTGGATTGTGAACGGCCTGCTGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GTCCACTGGTTGGCCCTGTGTGGTTGCTGTTATGGGCAACTGGTTTGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123831 GTCCACTGGTTGGCCCTGTGTGGTTGCTGTTATGGGCAACTGGTTTGGGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AAGCCGG         ACGAGGAGTTGTTTTTGGTCTCTGGAGTGCCTGT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 123881 AAGCCGGGTA...TAGACGAGGAGTTGTTTTTGGTCTCTGGAGTGCCTGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCTTCGGTGGGCAACATTTTGGGAGCGTGCCTAGCTTCTTCTGTTCTTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126797 GCTTCGGTGGGCAACATTTTGGGAGCGTGCCTAGCTTCTTCTGTTCTTCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GTATGGTTATGAG         TATGCCTTTCTGGTGACGGCGTCTGTGC
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 126847 GTATGGTTATGAGGTA...CAGTATGCCTTTCTGGTGACGGCGTCTGTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 AGTTTGCTGGTGGGATCGTTATCTTCTTTGGACTCCTGGTGTCACCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130409 AGTTTGCTGGTGGGATCGTTATCTTCTTTGGACTCCTGGTGTCACCAGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 GAAATTG         GTCTCTCGGGTATTGAGGCAGAAGAAAACTTTGA
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130459 GAAATTGGTG...TAGGTCTCTCGGGTATTGAGGCAGAAGAAAACTTTGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGAAGACTCACACAGGCCATTAATTAATGGTGGTGAAAATGAAGACGAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131110 AGAAGACTCACACAGGCCATTAATTAATGGTGGTGAAAATGAAGACGAAT

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 ATGAGCCGAATTATTCAATCCAAGATGATAGTTCTGTTGCCCAAGTCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131160 ATGAGCCGAATTATTCAATCCAAGATGATAGTTCTGTTGCCCAAGTCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 GCGATAAGCTTCTACCAGGCATGTTGCCTTCCTGGAGTCATACCG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 131210 GCGATAAGCTTCTACCAGGCATGTTGCCTTCCTGGAGTCATACCGGTA..

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883     TACTCACTGGCCTACGCCTGCTTGAAGTTAGTGAATTACTCCTTCT
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 131260 .TAGTACTCACTGGCCTACGCCTGCTTGAAGTTAGTGAATTACTCCTTCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TCTTCTGGCTCCCCTTTTATCTGAGTAACAACTTCGGCTGGAAGGAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133806 TCTTCTGGCTCCCCTTTTATCTGAGTAACAACTTCGGCTGGAAGGAGGCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAAGCCGACAAGCTGTCCATTTGGTACGACGTTGGAGGGATCATAG    
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>.
 133856 GAAGCCGACAAGCTGTCCATTTGGTACGACGTTGGAGGGATCATAGGTA.

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1025      GTGGAACTTTGCAAGGCTTCATCTCTGATGTACTACAGAAGAGAG
        ..>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 133906 ..AAGGTGGAACTTTGCAAGGCTTCATCTCTGATGTACTACAGAAGAGAG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CGCCGGTTCTTGCCCTGAGTCTGCTTCTGGCAGTTGGGTCCCTCATCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136602 CGCCGGTTCTTGCCCTGAGTCTGCTTCTGGCAGTTGGGTCCCTCATCGGG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 TATAGTC         GTTCTCCAAATGATAAGTCCATCAATGCCCTTCT
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 136652 TATAGTCGTG...CAGGTTCTCCAAATGATAAGTCCATCAATGCCCTTCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GATGACTGTTACAG         GATTTTTTATTGGTGGACCTTCTAATA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 137298 GATGACTGTTACAGGTA...CAGGATTTTTTATTGGTGGACCTTCTAATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1202 TGATTAGTTCTGCTATTTCTGCGGACTTGGGTCGCCAGGAGCTCATCCAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 138991 TGATTAGTTCTGCTATTTCTGCGGACTTGGGTCGCCAGGAGCTCATCCAA

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1252 AGGAGCAGTGAAGCTTTGGCCACTGTCACAGGAATTGTGGATGGTTCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 139041 AGGAGCAGTGAAGCTTTGGCCACTGTCACAGGAATTGTGGATGGTTCGGG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1302 GAGCATTGGAGCTGCAGTGGGCCAG         TATTTAGTGTCTCTGA
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 139091 GAGCATTGGAGCTGCAGTGGGCCAGGTG...CAGTATTTAGTGTCTCTGA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1343 TCCGGGACAAGCTAGGATGGATGTGGGTTTTCTACTTTTTCATTCTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145194 TCCGGGACAAGCTAGGATGGATGTGGGTTTTCTACTTTTTCATTCTCATG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1393          ACAAGTTGTACAATTGTGTTTATCTCGCCATTAATAGTGAG
        >>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145244 GTA...CAGACAAGTTGTACAATTGTGTTTATCTCGCCATTAATAGTGAG

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .
   1434 GGAAATATTCTCTCTCGTGCTAAGGAGACAGGCTCACATATTGAGGGAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 147064 GGAAATATTCTCTCTCGTGCTAAGGAGACAGGCTCACATATTGAGGGAG