seq1 = pF1KE6461.tfa, 1425 bp
seq2 = pF1KE6461/gi568815589r_112779765.tfa (gi568815589r:112779765_112990681), 210917 bp

>pF1KE6461 1425
>gi568815589r:112779765_112990681 (Chr9)

(complement)

1-1129  (100001-101129)   99% ->
1130-1213  (103269-103352)   100% ->
1214-1370  (104066-104222)   100% ->
1371-1425  (110863-110917)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGCCCCGAGGTCACCTGCCCGCGGAGGGGCCACCTGCCTCGCTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGCCCCGAGGTCACCTGCCCGCGGAGGGGCCACCTGCCTCGCTTCCA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCGAGGACCTGGGTTGAGCCCGTGATGGCCTCGTCCCAGGTGGCTGCCT
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCGAGGACCTGGGTTGAGCCCGTGGTGGCCTCGTCCCAGGTGGCTGCCT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCCTCTACGATGCGGGGCTACTCCTCGTGGTGAAGGCGTCCTACGGAACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCCTCTACGATGCGGGGCTACTCCTCGTGGTGAAGGCGTCCTACGGAACC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGAGGCTCCTCCAACCACAGTGCCAGCCCATCGCCCCGGGGGGCTCTAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGAGGCTCCTCCAACCACAGTGCCAGCCCATCGCCCCGGGGGGCTCTAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GGACCAACAGCAGAGAGCCATCTCCAATTTCTACATTATCTACAACCTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GGACCAACAGCAGAGAGCCATCTCCAATTTCTACATTATCTACAACCTTG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TGGTGGGCCTGTCCCCCCTGCTGTCCGCCTACGGGCTGGGATGGCTCAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TGGTGGGCCTGTCCCCCCTGCTGTCCGCCTACGGGCTGGGATGGCTCAGC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GACCGCTACCACCGAAAGATCTCCATCTGCATGTCGCTGCTGGGCTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GACCGCTACCACCGAAAGATCTCCATCTGCATGTCGCTGCTGGGCTTCCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTCTCCCGCCTCGGGCTGCTGCTCAAGGTGCTGCTGGACTGGCCAGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTCTCCCGCCTCGGGCTGCTGCTCAAGGTGCTGCTGGACTGGCCAGTGG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGTGCTGTACGGGGCGGCGGCGCTGAACGGGCTATTCGGCGGCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGTGCTGTACGGGGCGGCGGCGCTGAACGGGCTATTCGGCGGCTTCTCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 GCCTTCTGGTCCGGGGTCATGGCGCTGGGATCGCTGGGCTCCTCCGAGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 GCCTTCTGGTCCGGGGTCATGGCGCTGGGATCGCTGGGCTCCTCCGAGGG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCGCCGCTCTGTGCGCCTCATCCTCATTGACCTGATGCTGGGCTTGGCGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCGCCGCTCTGTGCGCCTCATCCTCATTGACCTGATGCTGGGCTTGGCGG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGTTCTGCGGGAGCATGGCTTCCGGGCATCTCTTCAAGCAGATGGCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGTTCTGCGGGAGCATGGCTTCCGGGCATCTCTTCAAGCAGATGGCTGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CACTCTGGGCAGGGCCTGATACTGACGGCCTGCAGCGTGAGCTGTGCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CACTCTGGGCAGGGCCTGATACTGACGGCCTGCAGCGTGAGCTGTGCCTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GTTTGCCCTGCTCTACAGCCTTTTGGTGCTAAAGGTCCCTGAGTCGGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GTTTGCCCTGCTCTACAGCCTTTTGGTGCTAAAGGTCCCTGAGTCGGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 CCAAACCCAGCCAGGAGCTCCCCGCCGTGGATACCGTGTCTGGCACGGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 CCAAACCCAGCCAGGAGCTCCCCGCCGTGGATACCGTGTCTGGCACGGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 GGCACATACCGCACTCTGGATCCTGATCAGTTGGACCAACAGTATGCAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 GGCACATACCGCACTCTGGATCCTGATCAGTTGGACCAACAGTATGCAGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GGGGCACCCTCCATCTCCTGGAAAAGCAAAACCCCATAAAACCACCATTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GGGGCACCCTCCATCTCCTGGAAAAGCAAAACCCCATAAAACCACCATTG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CCTTGCTCTTTGTGGGTGCTATCATATATGACCTGGCGGTGGTGGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CCTTGCTCTTTGTGGGTGCTATCATATATGACCTGGCGGTGGTGGGCACA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 GTGGACGTGATCCCTCTTTTTGTGCTGAGGGAGCCTCTCGGTTGGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 GTGGACGTGATCCCTCTTTTTGTGCTGAGGGAGCCTCTCGGTTGGAACCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AGTGCAGGTGGGCTATGGTATGGCTGCAGGGTACACCATCTTCATCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AGTGCAGGTGGGCTATGGTATGGCTGCAGGGTACACCATCTTCATCACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCTTCCTGGGTGTCCTGGTCTTCTCCCGCTGCTTTCGGGACACCACCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCTTCCTGGGTGTCCTGGTCTTCTCCCGCTGCTTTCGGGACACCACCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 ATCATGATTGGGATGGTCTCCTTTGGGTCAGGAGCCCTCCTCTTGGCTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 ATCATGATTGGGATGGTCTCCTTTGGGTCAGGAGCCCTCCTCTTGGCTTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGTGAAAGAGACATACATGTTCTATATTG         CTCGAGCCGTCA
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 101101 TGTGAAAGAGACATACATGTTCTATATTGGTG...CAGCTCGAGCCGTCA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1142 TGCTGTTTGCTCTCATCCCCGTCACAACCATCCGATCAGCTATGTCCAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103281 TGCTGTTTGCTCTCATCCCCGTCACAACCATCCGATCAGCTATGTCCAAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1192 CTCATAAAGGGCTCCTCTTATG         GAAAGGTGTTCGTCATACT
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 103331 CTCATAAAGGGCTCCTCTTATGGTG...CAGGAAAGGTGTTCGTCATACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1233 GCAGCTGTCCTTGGCTCTGACCGGCGTGGTGACATCCACCTTGTACAACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104085 GCAGCTGTCCTTGGCTCTGACCGGCGTGGTGACATCCACCTTGTACAACA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1283 AGATCTACCAGCTCACCATGGACATGTTTGTGGGCTCCTGCTTTGCTCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104135 AGATCTACCAGCTCACCATGGACATGTTTGTGGGCTCCTGCTTTGCTCTC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1333 TCCTCCTTTCTCTCCTTCCTGGCCATCATTCCAATTAG         CAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 104185 TCCTCCTTTCTCTCCTTCCTGGCCATCATTCCAATTAGGTA...CAGCAT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CGTGGCCTATAAACAAGTCCCATTGTCACCATATGGAGACATCATAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110866 CGTGGCCTATAAACAAGTCCCATTGTCACCATATGGAGACATCATAGAGA

   1450 
   1424 AA
        ||
 110916 AA