seq1 = pF1KE6451.tfa, 1512 bp
seq2 = pF1KE6451/gi568815576r_37978391.tfa (gi568815576r:37978391_38182803), 204413 bp

>pF1KE6451 1512
>gi568815576r:37978391_38182803 (Chr22)

(complement)

1-214  (99931-100144)   100% ->
215-358  (100772-100915)   100% ->
359-1198  (101125-101964)   100% ->
1199-1512  (104100-104413)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGCGCTGGCGGCCCCCGGCGGGGCGAGGGCCCCCCAGACGGCGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99931 ATGGGCGCTGGCGGCCCCCGGCGGGGCGAGGGCCCCCCAGACGGCGGCTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGGCTGGGTGGTGCTGGGCGCCTGCTTTGTGGTCACCGGCTTCGCCTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
  99981 GGGCTGGGTGGTGCTGGGCGCCTGCTTTGTGGTCACCGGCTTCGCCTACG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCTTCCCCAAAGCCGTGAGCGTCTTCTTCCGCGCGCTCATGCGCGACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100031 GCTTCCCCAAAGCCGTGAGCGTCTTCTTCCGCGCGCTCATGCGCGACTTC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GACGCCGGCTACAGCGACACGGCCTGGGTGTCCTCCATCATGCTAGCCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100081 GACGCCGGCTACAGCGACACGGCCTGGGTGTCCTCCATCATGCTAGCCAT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTCTACGGCACGG         GCCCCGTGTCCAGCATCCTCGTGACCC
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 100131 GCTCTACGGCACGGGTC...CAGGCCCCGTGTCCAGCATCCTCGTGACCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 GCTTTGGCTGTCGCCCGGTGATGCTGGCGGGTGGGCTGCTGGCTTCCGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100799 GCTTTGGCTGTCGCCCGGTGATGCTGGCGGGTGGGCTGCTGGCTTCCGCG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GGCATGATCCTAGCTTCCTTTGCCACGCGCCTCCTGGAGCTCTACCTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100849 GGCATGATCCTAGCTTCCTTTGCCACGCGCCTCCTGGAGCTCTACCTGAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 CGCTGGGGTGCTCACAG         GCCTGGGCCTGGCCCTCAACTTCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100899 CGCTGGGGTGCTCACAGGTG...CAGGCCTGGGCCTGGCCCTCAACTTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 AGCCGTCGCTCATCATGCTGGGGCTGTACTTCGAGCGGCGGCGGCCTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101149 AGCCGTCGCTCATCATGCTGGGGCTGTACTTCGAGCGGCGGCGGCCTCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 GCCAACGGGCTGGCGGCGGCGGGCAGCCCCGTGTTCCTGTCCGCGCTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101199 GCCAACGGGCTGGCGGCGGCGGGCAGCCCCGTGTTCCTGTCCGCGCTGTC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 GCCGCTCGGCCAGCAGCTGCTGGAGCGCTTCGGCTGGCGCGGCGGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101249 GCCGCTCGGCCAGCAGCTGCTGGAGCGCTTCGGCTGGCGCGGCGGCTTCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TGCTGCTCGGCGGGCTCCTGCTGCACTGCTGCGCCTGCGGGGCTGTCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101299 TGCTGCTCGGCGGGCTCCTGCTGCACTGCTGCGCCTGCGGGGCTGTCATG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AGGCCGCCGCCCGGGCCGGGCCCGCGACCGCGCAGGGACAGCGCCGGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101349 AGGCCGCCGCCCGGGCCGGGCCCGCGACCGCGCAGGGACAGCGCCGGCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCGCGCCGGGGACGCTCCGGGCGAGGCGGAGGCTGACGGTGCGGGGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101399 CCGCGCCGGGGACGCTCCGGGCGAGGCGGAGGCTGACGGTGCGGGGCTGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 AGCTGCGCGAGGCATCCCCCAGGGTCCGGCCCCGCCGGCGCCTGCTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101449 AGCTGCGCGAGGCATCCCCCAGGGTCCGGCCCCGCCGGCGCCTGCTGGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 TTGGCAGTGTGCACCGACCGCGCCTTCGCCGTGTACGCCGTCACCAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101499 TTGGCAGTGTGCACCGACCGCGCCTTCGCCGTGTACGCCGTCACCAAGTT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 CCTGATGGCGCTCGGGCTCTTCGTCCCCGCCATCCTGCTGGTGAACTACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101549 CCTGATGGCGCTCGGGCTCTTCGTCCCCGCCATCCTGCTGGTGAACTACG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    833 CCAAGGACGCGGGCGTGCCCGACACCGACGCCGCCTTCCTGCTGTCCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101599 CCAAGGACGCGGGCGTGCCCGACACCGACGCCGCCTTCCTGCTGTCCATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 GTGGGCTTCGTGGACATCGTGGCGCGCCCGGCGTGCGGCGCCCTGGCGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101649 GTGGGCTTCGTGGACATCGTGGCGCGCCCGGCGTGCGGCGCCCTGGCGGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CCTGGCGCGTCTGCGGCCGCACGTCCCGTATCTGTTCAGCCTGGCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101699 CCTGGCGCGTCTGCGGCCGCACGTCCCGTATCTGTTCAGCCTGGCCCTGC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 TGGCCAATGGGCTCACAGACCTGAGCAGCGCACGCGCGCGCTCCTACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101749 TGGCCAATGGGCTCACAGACCTGAGCAGCGCACGCGCGCGCTCCTACGGC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 GCCCTCGTCGCCTTCTGCGTCGCCTTCGGCCTCTCCTACGGCATGGTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101799 GCCCTCGTCGCCTTCTGCGTCGCCTTCGGCCTCTCCTACGGCATGGTGGG

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CGCGCTGCAGTTCGAGGTGCTCATGGCGGCTGTGGGCGCGCCCCGCTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101849 CGCGCTGCAGTTCGAGGTGCTCATGGCGGCTGTGGGCGCGCCCCGCTTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 CCAGTGCGCTGGGCCTGGTGTTGCTCGTGGAGGCCGCGGCTGTGCTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101899 CCAGTGCGCTGGGCCTGGTGTTGCTCGTGGAGGCCGCGGCTGTGCTCATC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1183 GGACCGCCCTCTGCCG         GCCGCCTGGTGGATGTGTTGAAGAA
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 101949 GGACCGCCCTCTGCCGGTG...CAGGCCGCCTGGTGGATGTGTTGAAGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CTATGAGATCATCTTCTACCTGGCCGGCTCTGAGGTGGCCCTGGCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104125 CTATGAGATCATCTTCTACCTGGCCGGCTCTGAGGTGGCCCTGGCTGGGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 TCTTCATGGCTGTCGCCACCAACTGCTGCCTGCGTTGTGCTAAAGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104175 TCTTCATGGCTGTCGCCACCAACTGCTGCCTGCGTTGTGCTAAAGCTGCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 CCGTCAGGCCCAGGCACTGAGGGCGGAGCCAGTGACACTGAGGACGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104225 CCGTCAGGCCCAGGCACTGAGGGCGGAGCCAGTGACACTGAGGACGCTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 GGCTGAAGGGGACTCTGAGCCCCTGCCTGTTGTTGCAGAGGAACCCGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104275 GGCTGAAGGGGACTCTGAGCCCCTGCCTGTTGTTGCAGAGGAACCCGGCA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 ACCTGGAGGCCCTGGAGGTGCTCAGCGCCCGGGGCGAGCCCACAGAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104325 ACCTGGAGGCCCTGGAGGTGCTCAGCGCCCGGGGCGAGCCCACAGAACCA

   1500     .    :    .    :    .    :    .
   1474 GAAATAGAGGCGAGGCCGAGGCTGGCTGCCGAGTCTGTA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104375 GAAATAGAGGCGAGGCCGAGGCTGGCTGCCGAGTCTGTA