seq1 = pF1KE6450.tfa, 1581 bp
seq2 = pF1KE6450/gi568815594r_69489387.tfa (gi568815594r:69489387_69747644), 258258 bp

>pF1KE6450 1581
>gi568815594r:69489387_69747644 (Chr4)

(complement)

1-715  (100001-100715)   99% ->
716-864  (148251-148399)   100% ->
865-996  (151264-151395)   100% ->
997-1084  (152396-152483)   100% ->
1085-1304  (152949-153168)   100% ->
1305-1581  (157994-158270)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTAAACAACCTTCTGCTGTTCTCCCTTCAGATAAGTCTCATAGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTAAACAACCTTCTGCTGTTCTCCCTTCAGATAAGTCTCATAGGAAC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CACTCTTGGTGGGAATGTTTTGATTTGGCCAATGGAAGGTAGTCATTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CACTCTTGGTGGGAATGTTTTGATTTGGCCAATGGAAGGTAGTCATTGGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAAATGTTAAGATAATTATAGATGAGCTCATTAAAAAGGAGCATAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAAATGTTAAGATAATTATAGATGAGCTCATTAAAAAGGAGCATAATGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 ACTGTCCTAGTTGCCTCTGGTGCACTTTTCATCACACCAACCTCTAACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 ACTGTCCTAGTTGCCTCTGGTGCACTTTTCATCACACCAACCTCTAACCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 ATCTCTGACATTTGAAATATATAGGGTGCCCTTTGGCAAAGAAAGAATAG
        ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
 100201 ATCTCTGACATTTGAAATATATAAGGTGCCCTTTGGCAAAGAAAGAATAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 AAGGAGTAATTAAGGACTTCGTTTTGACATGGCTGGAAAATAGACCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 AAGGAGTAATTAAGGACTTCGTTTTGACATGGCTGGAAAATAGACCATCT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CCTTCAACCATTTGGAGATTCTATCAGGAGATGGCCAAAGTAATCAAGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CCTTCAACCATTTGGAGATTCTATCAGGAGATGGCCAAAGTAATCAAGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 CTTCCACATGGTGTCTCAGGAGATCTGTGATGGCGTTCTTAAAAACCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 CTTCCACATGGTGTCTCAGGAGATCTGTGATGGCGTTCTTAAAAACCAAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCTGATGGCAAAGCTAAAGAAAAGCAAGTTTGAAGTCCTGGTGTCTGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCTGATGGCAAAGCTAAAGAAAAGCAAGTTTGAAGTCCTGGTGTCTGAT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 CCAGTATTTCCTTGTGGCGATATAGTAGCTTTAAAACTTGGAATTCCATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 CCAGTATTTCCTTGTGGCGATATAGTAGCTTTAAAACTTGGAATTCCATT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TATGTACTCCTTGAGGTTTTCTCCAGCCTCAACAGTGGAAAAGCACTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TATGTACTCCTTGAGGTTTTCTCCAGCCTCAACAGTGGAAAAGCACTGTG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGAAGGTACCATACCCTCCTTCCTATGTTCCTGCTGTTTTATCAGAACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGAAGGTACCATACCCTCCTTCCTATGTTCCTGCTGTTTTATCAGAACTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 ACCGACCAAATGTCTTTCACTGACAGAATAAGAAATTTCATCTCCTACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 ACCGACCAAATGTCTTTCACTGACAGAATAAGAAATTTCATCTCCTACCA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CCTACAGGACTACATGTTTGAAACTCTTTGGAAATCATGGGATTCATACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CCTACAGGACTACATGTTTGAAACTCTTTGGAAATCATGGGATTCATACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATAGTAAAGCTTTAG         GAAGACCCACTACGTTATGTGAGACT
        |||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||
 100701 ATAGTAAAGCTTTAGGTA...CAGGAAGACCCACTACGTTATGTGAGACT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 ATGGGGAAAGCTGAAATTTGGTTAATCCGAACATATTGGGATTTTGAATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148277 ATGGGGAAAGCTGAAATTTGGTTAATCCGAACATATTGGGATTTTGAATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TCCTCGTCCATACTTACCTAATTTTGAGTTTGTTGGAGGATTGCACTGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148327 TCCTCGTCCATACTTACCTAATTTTGAGTTTGTTGGAGGATTGCACTGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AACCTGCCAAACCTTTACCTAAG         GAAATGGAAGAATTTATC
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 148377 AACCTGCCAAACCTTTACCTAAGGTA...CAGGAAATGGAAGAATTTATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    883 CAGAGCTCAGGTAAAAATGGTGTTGTGGTGTTTTCTCTGGGATCAATGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151282 CAGAGCTCAGGTAAAAATGGTGTTGTGGTGTTTTCTCTGGGATCAATGGT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    933 CAAAAACCTTACAGAAGAAAAGGCCAATCTTATTGCCTCAGCCCTTGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151332 CAAAAACCTTACAGAAGAAAAGGCCAATCTTATTGCCTCAGCCCTTGCCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    983 AGATTCCACAGAAG         GTTTTATGGAGATACAAAGGAAAGAAA
        ||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||
 151382 AGATTCCACAGAAGGTC...CAGGTTTTATGGAGATACAAAGGAAAGAAA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 CCAGCCACATTAGGAAACAATACTCAGCTCTTTGATTGGATACCCCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152423 CCAGCCACATTAGGAAACAATACTCAGCTCTTTGATTGGATACCCCAGAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 TGATCTTCTTG         GACATCCCAAAACCAAAGCTTTTATCACTC
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 152473 TGATCTTCTTGGTA...TAGGACATCCCAAAACCAAAGCTTTTATCACTC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1115 ATGGTGGAACTAATGGGATCTACGAAGCTATTTACCACGGAGTCCCTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152979 ATGGTGGAACTAATGGGATCTACGAAGCTATTTACCACGGAGTCCCTATG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1165 GTGGGAGTTCCCATGTTTGCTGATCAGCCTGATAACATTGCTCACATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153029 GTGGGAGTTCCCATGTTTGCTGATCAGCCTGATAACATTGCTCACATGAA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1215 GGCCAAAGGAGCAGCTGTGGAAGTGAACCTAAACACAATGACAAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 153079 GGCCAAAGGAGCAGCTGTGGAAGTGAACCTAAACACAATGACAAGTGTGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1265 ATTTGCTTAGCGCTTTGAGAACAGTCATTAATGAACCTTC         T
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|
 153129 ATTTGCTTAGCGCTTTGAGAACAGTCATTAATGAACCTTCGTA...TAGT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1306 TATAAAGAGAATGCTATGAGGTTATCAAGAATTCACCATGATCAACCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157995 TATAAAGAGAATGCTATGAGGTTATCAAGAATTCACCATGATCAACCTGT

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1356 AAAGCCCCTGGATCGAGCAGTCTTCTGGATCGAGTTTGTCATGCGCCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158045 AAAGCCCCTGGATCGAGCAGTCTTCTGGATCGAGTTTGTCATGCGCCACA

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1406 AAGGAGCCAAGCACCTTCGGGTTGCAGCCCATGACCTCACCTGGTTCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158095 AAGGAGCCAAGCACCTTCGGGTTGCAGCCCATGACCTCACCTGGTTCCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1456 TACCACTCTTTGGATGTAATTGGGTTCTTGCTGGTCTGTGTGACAACGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158145 TACCACTCTTTGGATGTAATTGGGTTCTTGCTGGTCTGTGTGACAACGGC

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1506 TATATTTTTGGTCATACAATGTTGTTTGTTTTCCTGTCAAAAATTTGGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158195 TATATTTTTGGTCATACAATGTTGTTTGTTTTCCTGTCAAAAATTTGGTA

   1600     .    :    .    :    .
   1556 AGATAGGAAAGAAGAAAAAAAGAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||
 158245 AGATAGGAAAGAAGAAAAAAAGAGAA