seq1 = pF1KE6448.tfa, 1623 bp
seq2 = pF1KE6448/gi568815596r_27277548.tfa (gi568815596r:27277548_27480526), 202979 bp

>pF1KE6448 1623
>gi568815596r:27277548_27480526 (Chr2)

(complement)

1-55  (100001-100055)   100% ->
56-211  (100279-100434)   100% ->
212-799  (101473-102060)   100% ->
800-1623  (102156-102979)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCCCCGAAGGAAGCAAAGCCACCCGCAGCCCGTGAAATGCGAGGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCCCCGAAGGAAGCAAAGCCACCCGCAGCCCGTGAAATGCGAGGGGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAAAG         TGGATACTGAAGACTCCCTCGACGAAGGACCCGGGG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAAAGGTC...CAGTGGATACTGAAGACTCCCTCGACGAAGGACCCGGGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 CCCTGGTATTGGAGAGTGATTTGCTACTAGGCCAGGATCTGGAGTTTGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100315 CCCTGGTATTGGAGAGTGATTTGCTACTAGGCCAGGATCTGGAGTTTGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAGGAAGAGGAAGAGGAGGAAGGCGACGGCAACAGTGACCAGCTCATGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100365 GAGGAAGAGGAAGAGGAGGAAGGCGACGGCAACAGTGACCAGCTCATGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTTCGAGAGAGACTCGGAAG         GAGACTCTCTGGGGGCCAGGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100415 CTTCGAGAGAGACTCGGAAGGTG...CAGGAGACTCTCTGGGGGCCAGGC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGGGCTTCCCTATGGGCTGAGCGACGATGAGTCTGGGGGCGGCCGGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101494 CTGGGCTTCCCTATGGGCTGAGCGACGATGAGTCTGGGGGCGGCCGGGCA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 CTAAGTGCGGAGAGTGAAGTTGAGGAGCCAGCCAGGGGTCCAGGGGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101544 CTAAGTGCGGAGAGTGAAGTTGAGGAGCCAGCCAGGGGTCCAGGGGAGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CAGGGGTGAGAGGCCAGGCCCAGCCTGCCAGCTGTGTGGGGGGCCGACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101594 CAGGGGTGAGAGGCCAGGCCCAGCCTGCCAGCTGTGTGGGGGGCCGACAG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 GTGAGGGGCCGTGTTGTGGGGCAGGAGGGCCGGGTGGGGGGCCCCTGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101644 GTGAGGGGCCGTGTTGTGGGGCAGGAGGGCCGGGTGGGGGGCCCCTGCTG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    433 CCCCCACGGCTACTGTACTCATGCCGCCTCTGCACCTTCGTGTCCCACTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101694 CCCCCACGGCTACTGTACTCATGCCGCCTCTGCACCTTCGTGTCCCACTA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    483 CTCGAGCCACCTGAAGCGGCACATGCAGACACACAGCGGAGAGAAGCCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101744 CTCGAGCCACCTGAAGCGGCACATGCAGACACACAGCGGAGAGAAGCCGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TCCGCTGTGGCCGCTGCCCCTACGCCTCAGCCCAGCTCGTCAACCTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101794 TCCGCTGTGGCCGCTGCCCCTACGCCTCAGCCCAGCTCGTCAACCTGACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 CGACATACCCGCACCCACACTGGCGAGAAGCCCTACCGCTGTCCCCACTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101844 CGACATACCCGCACCCACACTGGCGAGAAGCCCTACCGCTGTCCCCACTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    633 CCCCTTTGCCTGCAGCAGCCTGGGCAACCTGAGGCGGCATCAGCGTACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101894 CCCCTTTGCCTGCAGCAGCCTGGGCAACCTGAGGCGGCATCAGCGTACCC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    683 ACGCAGGGCCCCCCACTCCTCCCTGCCCGACCTGTGGCTTCCGCTGCTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101944 ACGCAGGGCCCCCCACTCCTCCCTGCCCGACCTGTGGCTTCCGCTGCTGT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    733 ACTCCACGACCAGCCCGGCCTCCCAGTCCCACAGAGCAGGAGGGGGCGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101994 ACTCCACGACCAGCCCGGCCTCCCAGTCCCACAGAGCAGGAGGGGGCGGT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    783 GCCCCGGCGACCTGAAG         ATGCTCTGCTCCTTCCAGATTTGA
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102044 GCCCCGGCGACCTGAAGGTA...CAGATGCTCTGCTCCTTCCAGATTTGA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    824 GCCTCCATGTGCCACCAGGTGGTGCCAGTTTCCTGCCAGACTGTGGGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102180 GCCTCCATGTGCCACCAGGTGGTGCCAGTTTCCTGCCAGACTGTGGGCAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    874 CTGCGGGGTGAAGGGGAGGGCCTCTGCGGGACTGGATCAGAACCACTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102230 CTGCGGGGTGAAGGGGAGGGCCTCTGCGGGACTGGATCAGAACCACTGCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    924 AGAGCTGCTATTCCCTTGGACCTGCCGGGGCTGTGGACAAGAGCTGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102280 AGAGCTGCTATTCCCTTGGACCTGCCGGGGCTGTGGACAAGAGCTGGAGG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    974 AGGGTGAGGGTAGTCGGCTGGGAGCTGCCATGTGTGGGCGCTGCATGCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102330 AGGGTGAGGGTAGTCGGCTGGGAGCTGCCATGTGTGGGCGCTGCATGCGA

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1024 GGAGAGGCTGGAGGGGGTGCCAGTGGGGGGCCCCAGGGCCCCAGTGACAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102380 GGAGAGGCTGGAGGGGGTGCCAGTGGGGGGCCCCAGGGCCCCAGTGACAA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1074 AGGCTTTGCCTGTAGCCTCTGCCCCTTTGCCACTCACTATCCCAACCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102430 AGGCTTTGCCTGTAGCCTCTGCCCCTTTGCCACTCACTATCCCAACCACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1124 TGGCCCGGCACATGAAGACACACAGTGGTGAGAAGCCCTTCCGCTGCGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102480 TGGCCCGGCACATGAAGACACACAGTGGTGAGAAGCCCTTCCGCTGCGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 CGCTGTCCTTATGCCTCTGCTCATCTGGATAACCTGAAACGGCACCAGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102530 CGCTGTCCTTATGCCTCTGCTCATCTGGATAACCTGAAACGGCACCAGCG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 CGTCCATACAGGAGAGAAGCCCTACAAGTGCCCCCTCTGCCCTTATGCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102580 CGTCCATACAGGAGAGAAGCCCTACAAGTGCCCCCTCTGCCCTTATGCCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 GTGGCAATCTGGCCAACCTCAAGCGTCATGGTCGCATCCACTCTGGTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102630 GTGGCAATCTGGCCAACCTCAAGCGTCATGGTCGCATCCACTCTGGTGAC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1324 AAACCTTTTCGGTGTAGCCTTTGCAACTACAGCTGCAACCAGAGCATGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102680 AAACCTTTTCGGTGTAGCCTTTGCAACTACAGCTGCAACCAGAGCATGAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1374 CCTCAAACGTCACATGCTGCGGCACACAGGCGAGAAGCCCTTCCGCTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102730 CCTCAAACGTCACATGCTGCGGCACACAGGCGAGAAGCCCTTCCGCTGTG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1424 CCACCTGCGCCTATACCACGGGCCACTGGGACAACTACAAGCGCCACCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102780 CCACCTGCGCCTATACCACGGGCCACTGGGACAACTACAAGCGCCACCAG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1474 AAGGTGCATGGCCACGGTGGGGCAGGAGGGCCTGGTCTCTCTGCCTCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102830 AAGGTGCATGGCCACGGTGGGGCAGGAGGGCCTGGTCTCTCTGCCTCTGA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1524 GGGCTGGGCCCCACCTCATAGCCCACCCTCTGTTTTGAGCTCTCGGGGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102880 GGGCTGGGCCCCACCTCATAGCCCACCCTCTGTTTTGAGCTCTCGGGGCC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1574 CACCAGCCCTGGGGACTGCTGGCAGCCGGGCTGTCCACACAGACTCATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102930 CACCAGCCCTGGGGACTGCTGGCAGCCGGGCTGTCCACACAGACTCATCC