seq1 = pF1KE6445.tfa, 1563 bp
seq2 = pF1KE6445/gi568815591r_22845592.tfa (gi568815591r:22845592_23091111), 245520 bp

>pF1KE6445 1563
>gi568815591r:22845592_23091111 (Chr7)

(complement)

1-51  (100001-100051)   100% ->
52-153  (107067-107168)   100% ->
154-333  (112664-112843)   100% ->
334-414  (113691-113771)   100% ->
415-530  (114304-114419)   100% ->
531-626  (114807-114902)   100% ->
627-743  (126581-126697)   100% ->
744-831  (129790-129877)   100% ->
832-991  (130697-130856)   100% ->
992-1563  (144949-145520)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTTTACTTCAGAGAAAGGGGTTGTGGAGGAATGGTTGTCAGAGTTTAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTTTACTTCAGAGAAAGGGGTTGTGGAGGAATGGTTGTCAGAGTTTAA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 G         ACATTACCAGAAACATCTTTACCAAATTATGCCACAAATT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGTA...TAGACATTACCAGAAACATCTTTACCAAATTATGCCACAAATT

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGAAAGACAAGAGTTCTTTAGTTTCATCTCTCTATAAAGTTATCCAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107107 TGAAAGACAAGAGTTCTTTAGTTTCATCTCTCTATAAAGTTATCCAGGAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CCACAAAGTGAG         TTGCTAGAACCTGTCTGTCACCAGCTCTT
        ||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||
 107157 CCACAAAGTGAGGTA...TAGTTGCTAGAACCTGTCTGTCACCAGCTCTT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGAATTCTATCGCAGTGGAGAGGAGCAGTTGCTTCAATTTACGCTGCAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112693 TGAATTCTATCGCAGTGGAGAGGAGCAGTTGCTTCAATTTACGCTGCAAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TTCTCCCAGAACTAATTTGGTGCTACCTTGCAGTCTCAGCCAGCAGAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112743 TTCTCCCAGAACTAATTTGGTGCTACCTTGCAGTCTCAGCCAGCAGAAAT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GTGCATAGCAGTGGATGCATTGAAGCTCTTCTTCTAGGGGTTTACAATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112793 GTGCATAGCAGTGGATGCATTGAAGCTCTTCTTCTAGGGGTTTACAATTT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 G         GAAATAGTTGACAAACAGGGACATACCAAAGTATTGAGTT
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112843 GGTT...TAGGAAATAGTTGACAAACAGGGACATACCAAAGTATTGAGTT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TTACGATTCCATCTTTATCCAAACCATCTGTATACCATGAA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 113731 TTACGATTCCATCTTTATCCAAACCATCTGTATACCATGAAGTA...TAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 CCTTCCAGCATTGGGTCCATGGCTCTGACTGAGAGTGCACTATCCCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114304 CCTTCCAGCATTGGGTCCATGGCTCTGACTGAGAGTGCACTATCCCAGCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 TGGTTTGTCAAAAGTGGTATACAGTGGACCTCATCCTCAAAGGGAGATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114354 TGGTTTGTCAAAAGTGGTATACAGTGGACCTCATCCTCAAAGGGAGATGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 TGACAGCACAGAATCG         GTTTGAAGTGTTGACATTCCTTTTG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 114404 TGACAGCACAGAATCGGTA...TAGGTTTGAAGTGTTGACATTCCTTTTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTGTGTTACAATGCTGCCTTAACTTACATGCCCAGTGTTTCTCTTCAGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114832 TTGTGTTACAATGCTGCCTTAACTTACATGCCCAGTGTTTCTCTTCAGTC

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 ACTGTGTCAAATTTGTTCAAG         AATCTGTGTTTGTGGATATC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 114882 ACTGTGTCAAATTTGTTCAAGGTA...TAGAATCTGTGTTTGTGGATATC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 CTCGACAACATGTAAGAAAATATAAAGGTATAAGTAGCAGGATACCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126601 CTCGACAACATGTAAGAAAATATAAAGGTATAAGTAGCAGGATACCAGTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 TCTTCAGGATTCATGGTGCAAATGTTAACAGGGATTTATTTTGCCTT   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 126651 TCTTCAGGATTCATGGTGCAAATGTTAACAGGGATTTATTTTGCCTTGTA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    744       TTATAATGGAGAATGGGATCTAGCTCAAAAAGCACTGGATGATA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 126701 ...TAGTTATAATGGAGAATGGGATCTAGCTCAAAAAGCACTGGATGATA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TTATATACAGAGCCCAGCTAGAATTATATCCAGAGCCATTGCTG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 129834 TTATATACAGAGCCCAGCTAGAATTATATCCAGAGCCATTGCTGGTA...

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    832    GTTGCTAATGCAATAAAGGCTTCATTGCCTCATGGTCCCATGAAATC
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130694 TAGGTTGCTAATGCAATAAAGGCTTCATTGCCTCATGGTCCCATGAAATC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 TAATAAGGAAGGTACAAGGTGTATTCAAGTTGAAATCACACCAACTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130744 TAATAAGGAAGGTACAAGGTGTATTCAAGTTGAAATCACACCAACTTCCT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 CTCGAATATCAAGAAATGCAGTAACCAGCATGTCAATAAGGGGTCATAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 130794 CTCGAATATCAAGAAATGCAGTAACCAGCATGTCAATAAGGGGTCATAGG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 TGGAAAAGACATG         GAAATACAGAATTAACAGGTCAAGAAGA
        |||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||
 130844 TGGAAAAGACATGGTA...TAGGAAATACAGAATTAACAGGTCAAGAAGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 ACTGATGGAGATATCTGAAGTTGACGAGGGATTTTATTCCAGGGCTGCGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 144977 ACTGATGGAGATATCTGAAGTTGACGAGGGATTTTATTCCAGGGCTGCGT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 CTAGTACCAGCCAGTCGGGTTTATCAAACAGTAGTCACAATTGTAGTAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145027 CTAGTACCAGCCAGTCGGGTTTATCAAACAGTAGTCACAATTGTAGTAAC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 AAGCCAAGTATAGGAAAGAACCACAGACGGTCAGGAGGAAGCAAAACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145077 AAGCCAAGTATAGGAAAGAACCACAGACGGTCAGGAGGAAGCAAAACTGG

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 AGGAAAAGAAAAAGAAACTACAGGGGAATCTTGCAAAGATCACTTTGCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145127 AGGAAAAGAAAAAGAAACTACAGGGGAATCTTGCAAAGATCACTTTGCTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 GAAAACAAACTCAGAGAGCCCAAAGTGAGAATCTTGAGCTTCTCTCTTTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145177 GAAAACAAACTCAGAGAGCCCAAAGTGAGAATCTTGAGCTTCTCTCTTTG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 AAGAGACTTACTTTAACAACCAGCCAATCCCTACCTAAGCCTAGTAGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145227 AAGAGACTTACTTTAACAACCAGCCAATCCCTACCTAAGCCTAGTAGCCA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1320 TGGTTTGGCTAAGACCGCAGCGACTGTATTTAGTAAATCCTTTGAACAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145277 TGGTTTGGCTAAGACCGCAGCGACTGTATTTAGTAAATCCTTTGAACAAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1370 TCAGTGGTGTCACGGTCCCACATAACCCGTCATCTGCTGTTGGTTGTGGG
        ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145327 TCAGTGGTGTCACAGTCCCACATAACCCGTCATCTGCTGTTGGTTGTGGG

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1420 GCTGGGACAGATGCCAATAGGTTTTCCGCTTGTAGTCTCCAAGAAGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145377 GCTGGGACAGATGCCAATAGGTTTTCCGCTTGTAGTCTCCAAGAAGAAAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1470 GCTTATTTACGTTTCAGAAAGAACTGAACTTCCAATGAAGCATCAATCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145427 GCTTATTTACGTTTCAGAAAGAACTGAACTTCCAATGAAGCATCAATCAG

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 GTCAGCAGAGACCTCCTAGTATTAGCATTACTCTGTCCACAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 145477 GTCAGCAGAGACCTCCTAGTATTAGCATTACTCTGTCCACAGAT