seq1 = pF1KE6440.tfa, 1725 bp
seq2 = pF1KE6440/gi568815591r_36413255.tfa (gi568815591r:36413255_36824148), 410894 bp

>pF1KE6440 1725
>gi568815591r:36413255_36824148 (Chr7)

(complement)

1-127  (100001-100127)   99% ->
128-223  (137355-137450)   100% ->
224-290  (150140-150206)   100% ->
291-390  (164884-164983)   100% ->
391-450  (186239-186298)   100% ->
451-521  (192043-192113)   100% ->
522-582  (200899-200959)   100% ->
583-653  (202369-202439)   100% ->
654-702  (203320-203368)   100% ->
703-751  (205804-205852)   100% ->
752-846  (207675-207769)   100% ->
847-938  (229719-229810)   100% ->
939-1021  (247493-247575)   100% ->
1022-1058  (274674-274710)   100% ->
1059-1133  (275463-275537)   100% ->
1134-1306  (283658-283830)   100% ->
1307-1365  (291805-291863)   100% ->
1366-1425  (291943-292002)   100% ->
1426-1522  (293635-293731)   100% ->
1523-1599  (302034-302110)   100% ->
1600-1725  (310769-310894)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGCAGTCCCCCTGGAAAATCCTTACGGTGGCGCCTCTATTCTTGCTCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTCTCTTCAGTCCTCAGCCTCTCCAGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCA
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GTCTCTTCAGTCCTCGGCCTCTCCAGCCAACGATGACCAGTCCAGGCCCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTAG         GGTGTGTGCTGGTG
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100101 GCCTCTCGAATGGGCACACCTGTGTAGGTA...CAGGGTGTGTGCTGGTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTGTCTGTAATAGAACAGCTTGCTCAAGTTCACAACTCGACGGTCCAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 137369 GTGTCTGTAATAGAACAGCTTGCTCAAGTTCACAACTCGACGGTCCAGGC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTCGATGGAGAGACTGTGCAGCTACCTGCCTG         AAAAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 137419 CTCGATGGAGAGACTGTGCAGCTACCTGCCTGGTA...TAGAAAAACTGT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 TCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150149 TCTTGAAAACCACCTGCTATTTAGTCATTGACAAGTTTGGATCAGACATC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 ATAAAACT         GCTTAGCGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATG
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 150199 ATAAAACTGTG...CAGGCTTAGCGCAGATATGAATGCTGATGTGGTATG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 TCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164917 TCACACTCTGGAGTTTTGTAAACAGAACACTGGCCAACCATTGTGTCATC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 TCTACCCTCTTCCCAAG         GAGACATGGAAATTTACACTACAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 164967 TCTACCCTCTTCCCAAGGTG...TAGGAGACATGGAAATTTACACTACAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 AAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCGATTCTG         AAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 186263 AAGGCAAGACAAATTGTCAAGAAGTCCCCGATTCTGGTA...CAGAAATA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    456 TTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 192048 TTCTAGAAGTGGTTCTGACATTTGTTCACTCCCGGTTTTGGCCAAGATCT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 GCCAGAAAATTAAATT         AGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTC
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 192098 GCCAGAAAATTAAATTGTA...TAGAGCTATGGAACAGTCTGTGCCATTC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    547 AAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCA         ACACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 200924 AAAGATGTGGATTCAGACAAATACAGCGTTTTCCCAGTA...CAGACACT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    588 GCGGGGCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 202374 GCGGGGCTATCACTGGCGGGGGAGAGACTGTAATGACAGCGACGAGTCAG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    638 TGTACCCAGGTAGAAG         GCCGAACAACTGGGATGTCCATCAG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
 202424 TGTACCCAGGTAGAAGGTA...TAGGCCGAACAACTGGGATGTCCATCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    679 GATTCAAACTGTAATGGCATTTGG         GGTGTCGATCCAAAAGA
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||
 203345 GATTCAAACTGTAATGGCATTTGGGTA...AAGGGTGTCGATCCAAAAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    720 TGGAGTTCCATATGAGAAGAAATTCTGTGAAG         GTTCACAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||
 205821 TGGAGTTCCATATGAGAAGAAATTCTGTGAAGGTA...TAGGTTCACAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    761 CCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 207684 CCAGGGGAATCATTTTGCTGGGAGACTCAGCTGGGGCTCATTTTCACATC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    811 TCTCCTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTG         AACTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 207734 TCTCCTGAATGGATCACAGCGTCGCAGATGTCTTTGGTA...TAGAACTC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    852 TTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTTGACTGGCCCCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 229724 TTTCATCAATCTACCAACAGCCCTTACCAACGAGCTTGACTGGCCCCAAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    902 TCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGG         AATT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||
 229774 TCTCTGGTGCTACAGGATTTCTGGACTCCACTGTTGGGTA...CAGAATT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    943 AAAGAAAAATCTATTTACCTTCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 247497 AAAGAAAAATCTATTTACCTTCGCTTATGGAAAAGAAACCACTGTAATCA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    993 CAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATG         GTGCATCTTCCC
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 247547 CAGGGACTACCAGAATATTTCAAGAAATGGTA...CAGGTGCATCTTCCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1034 GAAACCTGAAGAAATTTATAGAAAG         CTTGTCTAGAAACAAG
        |||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||
 274686 GAAACCTGAAGAAATTTATAGAAAGGTA...CAGCTTGTCTAGAAACAAG

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1075 GTGTTGGACTATCCCGCCATCGTTATATATGCCATGATTGGAAATGATGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 275479 GTGTTGGACTATCCCGCCATCGTTATATATGCCATGATTGGAAATGATGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1125 CTGCAGTGG         GAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTC
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 275529 CTGCAGTGGGTG...CAGGAAGAGTGACCCAGTCCCAGCCATGACCACTC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1166 CTGAGAAACTCTACTCCAACGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283690 CTGAGAAACTCTACTCCAACGTCATGCAGACTCTGAAGCATCTAAATTCC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1216 CACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAGATGGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 283740 CACCTGCCCAATGGCAGCCATGTTATTTTGTATGGCTTACCAGATGGAAC

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1266 CTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 283790 CTTTCTCTGGGATAATTTGCACAACAGATATCATCCTCTCGGTA...CAG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1307 GCCAGCTAAATAAAGACATGACCTATGCGCAGTTGTACTCCTTCCTGAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 291805 GCCAGCTAAATAAAGACATGACCTATGCGCAGTTGTACTCCTTCCTGAAC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1357 TGCCTCCAG         GTCAGCCCCTGCCACGGCTGGATGTCTTCCAA
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 291855 TGCCTCCAGGTG...CAGGTCAGCCCCTGCCACGGCTGGATGTCTTCCAA

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1398 CAAGACGTTGCGGACTCTCACTTCAGAG         AGAGCAGAGCAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 291975 CAAGACGTTGCGGACTCTCACTTCAGAGGTA...CAGAGAGCAGAGCAAC

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1439 TCTCCAACACACTGAAAAAAATTGCAGCCAGTGAGAAATTTACAAACTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 293648 TCTCCAACACACTGAAAAAAATTGCAGCCAGTGAGAAATTTACAAACTTC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1489 AATCTTTTCTACATGGATTTTGCCTTCCATGAAA         TCATACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 293698 AATCTTTTCTACATGGATTTTGCCTTCCATGAAAGTA...CAGTCATACA

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1530 GGAGTGGCAGAAGAGAGGCGGACAGCCCTGGCAGCTCATCGAGCCCGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 302041 GGAGTGGCAGAAGAGAGGCGGACAGCCCTGGCAGCTCATCGAGCCCGTGG

   1750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1580 ATGGATTCCACCCCAACGAG         GTGGCTTTGCTGTTGTTGGCG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 302091 ATGGATTCCACCCCAACGAGGTA...CAGGTGGCTTTGCTGTTGTTGGCG

   1800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1621 GATCATTTCTGGAAAAAGGTGCAGCTCCAGTGGCCCCAAATCCTGGGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 310790 GATCATTTCTGGAAAAAGGTGCAGCTCCAGTGGCCCCAAATCCTGGGAAA

   1850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1671 GGAGAATCCGTTCAACCCCCAGATTAAACAGGTGTTTGGAGACCAAGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 310840 GGAGAATCCGTTCAACCCCCAGATTAAACAGGTGTTTGGAGACCAAGGCG

   1900     .
   1721 GGCAC
        |||||
 310890 GGCAC