seq1 = pF1KE6439.tfa, 1428 bp
seq2 = pF1KE6439/gi568815591r_28895775.tfa (gi568815591r:28895775_29221061), 325287 bp

>pF1KE6439 1428
>gi568815591r:28895775_29221061 (Chr7)

(complement)

1-169  (100001-100169)   100% ->
170-288  (108240-108358)   100% ->
289-403  (124845-124959)   100% ->
404-462  (125920-125978)   100% ->
463-542  (128360-128439)   100% ->
543-609  (134512-134578)   100% ->
610-732  (148639-148761)   100% ->
733-864  (149158-149289)   100% ->
865-963  (154941-155039)   100% ->
964-1137  (156828-157001)   100% ->
1138-1320  (190303-190485)   99% ->
1321-1428  (225180-225287)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGTTGGTGCCATGTGGAAGGTGATTGTTTCGCTGGTCCTGTTGATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGTTGGTGCCATGTGGAAGGTGATTGTTTCGCTGGTCCTGTTGATGCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 TGGCCCCTGTGATGGGCTGTTTCGCTCCCTATACAGAAGTGTTTCCATGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 TGGCCCCTGTGATGGGCTGTTTCGCTCCCTATACAGAAGTGTTTCCATGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CACCTAAGGGAGACTCAGGACAGCCATTATTTCTCACCCCTTACATTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CACCTAAGGGAGACTCAGGACAGCCATTATTTCTCACCCCTTACATTGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GCTGGGAAGATCCAAAAAG         GAAGAGAATTGAGTTTGGTCGG
        |||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||
 100151 GCTGGGAAGATCCAAAAAGGTA...TAGGAAGAGAATTGAGTTTGGTCGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CCCTTTCCCAGGACTGAACATGAAGAGTTATGCCGGCTTCCTCACCGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108262 CCCTTTCCCAGGACTGAACATGAAGAGTTATGCCGGCTTCCTCACCGTGA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATAAGACTTACAACAGCAACCTCTTCTTCTGGTTCTTCCCAGCTCAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 108312 ATAAGACTTACAACAGCAACCTCTTCTTCTGGTTCTTCCCAGCTCAGGTA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    289       ATACAGCCAGAAGATGCCCCAGTAGTTCTCTGGCTACAGGGTGG
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108362 ...TAGATACAGCCAGAAGATGCCCCAGTAGTTCTCTGGCTACAGGGTGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 GCCGGGAGGTTCATCCATGTTTGGACTCTTTGTGGAACATGGGCCTTATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124889 GCCGGGAGGTTCATCCATGTTTGGACTCTTTGTGGAACATGGGCCTTATG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 TTGTCACAAGTAACATGACCT         TGCGTGACAGAGACTTCCCC
        |||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||
 124939 TTGTCACAAGTAACATGACCTGTA...CAGTGCGTGACAGAGACTTCCCC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TGGACCACAACGCTCTCCATGCTTTACATTGACAATCCA         GT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||
 125940 TGGACCACAACGCTCTCCATGCTTTACATTGACAATCCAGTA...CAGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 GGGCACAGGCTTCAGTTTTACTGATGATACCCACGGATATGCAGTCAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 128362 GGGCACAGGCTTCAGTTTTACTGATGATACCCACGGATATGCAGTCAATG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 AGGACGATGTAGCACGGGATTTATACAG         TGCACTAATTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 128412 AGGACGATGTAGCACGGGATTTATACAGGTA...CAGTGCACTAATTCAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TTTTTCCAGATATTTCCTGAATATAAAAATAATGACTTTTATGTCACTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134525 TTTTTCCAGATATTTCCTGAATATAAAAATAATGACTTTTATGTCACTGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 GGAG         TCTTATGCAGGGAAATATGTGCCAGCCATTGCACACC
        ||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 134575 GGAGGTA...CAGTCTTATGCAGGGAAATATGTGCCAGCCATTGCACACC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 TCATCCATTCCCTCAACCCTGTGAGAGAGGTGAAGATCAACCTGAACGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 148676 TCATCCATTCCCTCAACCCTGTGAGAGAGGTGAAGATCAACCTGAACGGA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATTGCTATTGGAGATGGATATTCTGATCCCGAATCA         ATTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 148726 ATTGCTATTGGAGATGGATATTCTGATCCCGAATCAGTA...CAGATTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 AGGGGGCTATGCAGAATTCCTGTACCAAATTGGCTTGTTGGATGAGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149163 AGGGGGCTATGCAGAATTCCTGTACCAAATTGGCTTGTTGGATGAGAAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 AAAAAAAGTACTTCCAGAAGCAGTGCCATGAATGCATAGAACACATCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 149213 AAAAAAAGTACTTCCAGAAGCAGTGCCATGAATGCATAGAACACATCAGG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 AAGCAGAACTGGTTTGAGGCCTTTGAA         ATACTGGATAAACT
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 149263 AAGCAGAACTGGTTTGAGGCCTTTGAAGTG...TAGATACTGGATAAACT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 ACTAGATGGCGACTTAACAAGTGATCCTTCTTACTTCCAGAATGTTACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154955 ACTAGATGGCGACTTAACAAGTGATCCTTCTTACTTCCAGAATGTTACAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 GATGTAGTAATTACTATAACTTTTTGCGGTGCACG         GAACCT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 155005 GATGTAGTAATTACTATAACTTTTTGCGGTGCACGGTA...CAGGAACCT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    970 GAGGATCAGCTTTACTATGTGAAATTTTTGTCACTCCCAGAGGTGAGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156834 GAGGATCAGCTTTACTATGTGAAATTTTTGTCACTCCCAGAGGTGAGACA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 AGCCATCCACGTGGGGAATCAGACTTTTAATGATGGAACTATAGTTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156884 AGCCATCCACGTGGGGAATCAGACTTTTAATGATGGAACTATAGTTGAAA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AGTACTTGCGAGAAGATACAGTACAGTCAGTTAAGCCATGGTTAACTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 156934 AGTACTTGCGAGAAGATACAGTACAGTCAGTTAAGCCATGGTTAACTGAA

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1120 ATCATGAATAATTATAAG         GTTCTGATCTACAATGGCCAACT
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 156984 ATCATGAATAATTATAAGGTA...CAGGTTCTGATCTACAATGGCCAACT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1161 GGACATCATCGTGGCAGCTGCCCTGACAGAGCGCTCCTTGATGGGCATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190326 GGACATCATCGTGGCAGCTGCCCTGACAGAGCGCTCCTTGATGGGCATGG

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1211 ACTGGAAAGGATCCCAGGAATACAAGAAGGCAGAAAAAAAAGTTTGGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 190376 ACTGGAAAGGATCCCAGGAATACAAGAAGGCAGAAAAAAAAGTTTGGAAG

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1261 ATCTTTAAATCTGACAGTGAAGTGGCTGGTTACATCCGGCAAGTGGGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
 190426 ATCTTTAAATCTGACAGTGAAGTGGCTGGTTACATCCGGCAAGCGGGTGA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 CTTCCATCAG         GTAATTATTCGAGGTGGAGGACATATTTTAC
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 190476 CTTCCATCAGGTA...AAGGTAATTATTCGAGGTGGAGGACATATTTTAC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1352 CCTATGACCAGCCTCTGAGAGCTTTTGACATGATTAATCGATTCATTTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 225211 CCTATGACCAGCCTCTGAGAGCTTTTGACATGATTAATCGATTCATTTAT

   1500     .    :    .    :    .
   1402 GGAAAAGGATGGGATCCTTATGTTGGA
        |||||||||||||||||||||||||||
 225261 GGAAAAGGATGGGATCCTTATGTTGGA