seq1 = pF1KE6433.tfa, 1341 bp
seq2 = pF1KE6433/gi568815584f_49521269.tfa (gi568815584f:49521269_49722609), 201341 bp

>pF1KE6433 1341
>gi568815584f:49521269_49722609 (Chr14)

1-1341  (100001-101341)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAGGTTCCGCATCTACAAACGGAAGGTGCTAATCCTGACGCTCGTGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAGGTTCCGCATCTACAAACGGAAGGTGCTAATCCTGACGCTCGTGGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GGCCGCCTGCGGCTTCGTCCTCTGGAGCAGCAATGGGCGACAAAGGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GGCCGCCTGCGGCTTCGTCCTCTGGAGCAGCAATGGGCGACAAAGGAAGA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 ACGAGGCCCTCGCCCCACCGTTGCTGGACGCCGAACCCGCGCGGGGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 ACGAGGCCCTCGCCCCACCGTTGCTGGACGCCGAACCCGCGCGGGGTGCC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GGCGGCCGCGGTGGGGACCACCCCTCTGTGGCTGTGGGCATCCGCAGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GGCGGCCGCGGTGGGGACCACCCCTCTGTGGCTGTGGGCATCCGCAGGGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CTCCAACGTGTCGGCGGCTTCCCTGGTCCCGGCGGTCCCCCAGCCCGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CTCCAACGTGTCGGCGGCTTCCCTGGTCCCGGCGGTCCCCCAGCCCGAGG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CGGACAACCTGACGCTGCGGTACCGGTCCCTGGTGTACCAGCTGAACTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 CGGACAACCTGACGCTGCGGTACCGGTCCCTGGTGTACCAGCTGAACTTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 GATCAGACCCTGAGGAATGTAGATAAGGCTGGCACCTGGGCCCCCCGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 GATCAGACCCTGAGGAATGTAGATAAGGCTGGCACCTGGGCCCCCCGGGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCTGGTGCTGGTGGTCCAGGTGCATAACCGGCCCGAATACCTCAGACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCTGGTGCTGGTGGTCCAGGTGCATAACCGGCCCGAATACCTCAGACTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGCTGGACTCACTTCGAAAAGCCCAGGGAATTGACAACGTCCTCGTCATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGCTGGACTCACTTCGAAAAGCCCAGGGAATTGACAACGTCCTCGTCATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TTTAGCCATGACTTCTGGTCGACCGAGATCAATCAGCTGATCGCCGGGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TTTAGCCATGACTTCTGGTCGACCGAGATCAATCAGCTGATCGCCGGGGT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 GAATTTCTGTCCGGTTCTGCAGGTGTTCTTTCCTTTCAGCATTCAGTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 GAATTTCTGTCCGGTTCTGCAGGTGTTCTTTCCTTTCAGCATTCAGTTGT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 ACCCTAACGAGTTTCCAGGTAGTGACCCTAGAGATTGTCCCAGAGACCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 ACCCTAACGAGTTTCCAGGTAGTGACCCTAGAGATTGTCCCAGAGACCTG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CCGAAGAATGCCGCTTTGAAATTGGGGTGCATCAATGCTGAGTATCCCGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CCGAAGAATGCCGCTTTGAAATTGGGGTGCATCAATGCTGAGTATCCCGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCCTTCGGCCATTATAGAGAGGCCAAATTCTCCCAGACCAAACATCACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCCTTCGGCCATTATAGAGAGGCCAAATTCTCCCAGACCAAACATCACT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 GGTGGTGGAAGCTGCATTTTGTGTGGGAAAGAGTGAAAATTCTTCGAGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 GGTGGTGGAAGCTGCATTTTGTGTGGGAAAGAGTGAAAATTCTTCGAGAT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TATGCTGGCCTTATACTTTTCCTAGAAGAGGATCACTACTTAGCCCCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TATGCTGGCCTTATACTTTTCCTAGAAGAGGATCACTACTTAGCCCCAGA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CTTTTACCATGTCTTCAAAAAGATGTGGAAACTGAAGCAGCAAGAGTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CTTTTACCATGTCTTCAAAAAGATGTGGAAACTGAAGCAGCAAGAGTGCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CTGAATGTGATGTTCTCTCCCTGGGGACCTATAGTGCCAGTCGCAGTTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CTGAATGTGATGTTCTCTCCCTGGGGACCTATAGTGCCAGTCGCAGTTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TATGGCATGGCTGACAAGGTAGATGTGAAAACTTGGAAATCCACAGAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TATGGCATGGCTGACAAGGTAGATGTGAAAACTTGGAAATCCACAGAGCA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 CAATATGGGTCTAGCCTTGACCCGGAATGCCTATCAGAAGCTGATCGAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 CAATATGGGTCTAGCCTTGACCCGGAATGCCTATCAGAAGCTGATCGAGT

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 GCACAGACACTTTCTGTACTTATGATGATTATAACTGGGACTGGACTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 GCACAGACACTTTCTGTACTTATGATGATTATAACTGGGACTGGACTCTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 CAATACTTGACTGTATCTTGTCTTCCAAAATTCTGGAAAGTGCTGGTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 CAATACTTGACTGTATCTTGTCTTCCAAAATTCTGGAAAGTGCTGGTTCC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TCAAATTCCTAGGATCTTTCATGCTGGAGACTGTGGTATGCATCACAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TCAAATTCCTAGGATCTTTCATGCTGGAGACTGTGGTATGCATCACAAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 AAACCTGTAGACCATCCACTCAGAGTGCCCAAATTGAGTCACTCTTAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 AAACCTGTAGACCATCCACTCAGAGTGCCCAAATTGAGTCACTCTTAAAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 AATAACAAACAATACATGTTTCCAGAAACTCTAACTATCAGTGAAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 AATAACAAACAATACATGTTTCCAGAAACTCTAACTATCAGTGAAAAGTT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TACTGTGGTAGCCATTTCCCCACCTAGAAAAAATGGAGGGTGGGGAGATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TACTGTGGTAGCCATTTCCCCACCTAGAAAAAATGGAGGGTGGGGAGATA

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :
   1301 TTAGGGACCATGAACTCTGTAAAAGTTATAGAAGACTGCAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101301 TTAGGGACCATGAACTCTGTAAAAGTTATAGAAGACTGCAG