seq1 = pF1KE6421.tfa, 1674 bp
seq2 = pF1KE6421/gi568815579r_18334916.tfa (gi568815579r:18334916_18537979), 203064 bp

>pF1KE6421 1674
>gi568815579r:18334916_18537979 (Chr19)

(complement)

1-120  (100001-100120)   100% ->
121-282  (100220-100381)   100% ->
283-415  (100875-101007)   100% ->
416-609  (101103-101296)   100% ->
610-759  (101501-101650)   100% ->
760-975  (101733-101948)   100% ->
976-1140  (102059-102223)   100% ->
1141-1254  (102304-102417)   100% ->
1255-1472  (102497-102714)   100% ->
1473-1674  (102863-103064)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAGGCCGCCGCCCAGTTCTTCGTCGAGAGCCCGGACGTGGTCTACGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAGGCCGCCGCCCAGTTCTTCGTCGAGAGCCCGGACGTGGTCTACGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CCCCGAGGCCATCGAGGCGCAATACGAGTACCGGACGACGCGCGTCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CCCCGAGGCCATCGAGGCGCAATACGAGTACCGGACGACGCGCGTCAGCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 GCGAGGGTGGCGTTCTCAAG         GTGCACCCCACGTCCACGCGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 100101 GCGAGGGTGGCGTTCTCAAGGTG...CAGGTGCACCCCACGTCCACGCGC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 TTCACCTTCCGGACCGCCCGGCAGGTGCCCCGGCTCGGGGTCATGCTTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100241 TTCACCTTCCGGACCGCCCGGCAGGTGCCCCGGCTCGGGGTCATGCTTGT

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CGGCTGGGGCGGGAACAACGGCTCCACACTCACCGCCGCGGTGCTGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100291 CGGCTGGGGCGGGAACAACGGCTCCACACTCACCGCCGCGGTGCTGGCCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 ATCGACTGCGTTTGTCCTGGCCCACGCGCAGCGGCCGCAAG         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 100341 ATCGACTGCGTTTGTCCTGGCCCACGCGCAGCGGCCGCAAGGTG...CAG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 GAGGCCAACTACTACGGCTCGCTGACTCAGGCGGGCACCGTGAGCCTGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100875 GAGGCCAACTACTACGGCTCGCTGACTCAGGCGGGCACCGTGAGCCTGGG

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CCTGGACGCCGAGGGCCAGGAGGTGTTCGTACCCTTCAGCGCGGTGCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100925 CCTGGACGCCGAGGGCCAGGAGGTGTTCGTACCCTTCAGCGCGGTGCTGC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    383 CCATGGTGGCGCCCAACGACCTCGTGTTCGATG         GCTGGGAC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 100975 CCATGGTGGCGCCCAACGACCTCGTGTTCGATGGTG...CAGGCTGGGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 ATCTCGTCGCTGAACCTGGCCGAGGCGATGCGGCGCGCGAAGGTGCTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101111 ATCTCGTCGCTGAACCTGGCCGAGGCGATGCGGCGCGCGAAGGTGCTGGA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 CTGGGGGCTGCAGGAGCAACTGTGGCCGCACATGGAGGCCCTGCGGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101161 CTGGGGGCTGCAGGAGCAACTGTGGCCGCACATGGAGGCCCTGCGGCCCC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    524 GGCCTTCTGTTTACATCCCCGAATTCATCGCGGCCAACCAGAGCGCGCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101211 GGCCTTCTGTTTACATCCCCGAATTCATCGCGGCCAACCAGAGCGCGCGC

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    574 GCGGACAACCTCATCCCAGGCTCGCGTGCGCAGCAG         CTGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101261 GCGGACAACCTCATCCCAGGCTCGCGTGCGCAGCAGGTG...CAGCTGGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    615 GCAGATCCGCAGGGACATCCGAGACTTCCGGTCTAGCGCGGGGCTGGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101506 GCAGATCCGCAGGGACATCCGAGACTTCCGGTCTAGCGCGGGGCTGGACA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    665 AAGTCATAGTGCTGTGGACGGCGAACACGGAGCGCTTCTGTGAGGTGATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101556 AAGTCATAGTGCTGTGGACGGCGAACACGGAGCGCTTCTGTGAGGTGATT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    715 CCAGGCCTCAACGACACAGCCGAGAACCTGCTGCGCACCATTGAG     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 101606 CCAGGCCTCAACGACACAGCCGAGAACCTGCTGCGCACCATTGAGGTG..

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    760     CTCGGTCTGGAGGTGTCGCCCTCCACGCTCTTCGCCGTGGCCAGCA
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101656 .CAGCTCGGTCTGGAGGTGTCGCCCTCCACGCTCTTCGCCGTGGCCAGCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    806 TCCTGGAGGGCTGTGCCTTCCTCAATGGGTCTCCGCAGAACACCCTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101779 TCCTGGAGGGCTGTGCCTTCCTCAATGGGTCTCCGCAGAACACCCTGGTG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    856 CCCGGAGCTCTTGAGCTCGCGTGGCAGCACCGGGTTTTTGTGGGCGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101829 CCCGGAGCTCTTGAGCTCGCGTGGCAGCACCGGGTTTTTGTGGGCGGAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    906 TGACTTCAAGTCAGGCCAGACCAAAGTCAAGTCCGTGCTTGTGGACTTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101879 TGACTTCAAGTCAGGCCAGACCAAAGTCAAGTCCGTGCTTGTGGACTTCC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 TCATTGGCTCCGGCCTCAAG         ACCATGTCCATCGTGAGTTAC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 101929 TCATTGGCTCCGGCCTCAAGGTG...CAGACCATGTCCATCGTGAGTTAC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    997 AACCACCTGGGCAACAACGATGGGGAGAACCTATCGGCGCCATTGCAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102080 AACCACCTGGGCAACAACGATGGGGAGAACCTATCGGCGCCATTGCAGTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1047 CCGCTCTAAGGAGGTGTCCAAGAGCAACGTGGTGGACGACATGGTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102130 CCGCTCTAAGGAGGTGTCCAAGAGCAACGTGGTGGACGACATGGTGCAGA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1097 GCAACCCAGTGCTCTATACGCCCGGCGAAGAGCCTGACCACTGC      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102180 GCAACCCAGTGCTCTATACGCCCGGCGAAGAGCCTGACCACTGCGTG...

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1141    GTGGTCATCAAGTATGTGCCGTACGTGGGTGACAGCAAGCGCGCGCT
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102301 CAGGTGGTCATCAAGTATGTGCCGTACGTGGGTGACAGCAAGCGCGCGCT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1188 GGATGAGTATACCTCGGAGCTGATGCTGGGCGGAACCAACACACTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102351 GGATGAGTATACCTCGGAGCTGATGCTGGGCGGAACCAACACACTGGTGC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1238 TGCACAACACGTGTGAG         GACTCGCTGCTGGCCGCACCCATC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 102401 TGCACAACACGTGTGAGGTG...CAGGACTCGCTGCTGGCCGCACCCATC

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1279 ATGCTGGACCTAGCGCTGCTGACCGAGCTGTGCCAGCGCGTGAGCTTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102521 ATGCTGGACCTAGCGCTGCTGACCGAGCTGTGCCAGCGCGTGAGCTTCTG

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1329 CACTGACATGGACCCCGAGCCGCAGACCTTCCACCCCGTGCTGTCCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102571 CACTGACATGGACCCCGAGCCGCAGACCTTCCACCCCGTGCTGTCCCTGC

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1379 TCAGCTTCCTCTTCAAGGCGCCACTAGTGCCGCCCGGCAGCCCGGTGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102621 TCAGCTTCCTCTTCAAGGCGCCACTAGTGCCGCCCGGCAGCCCGGTGGTC

   1500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1429 AATGCGCTTTTCCGCCAGCGCAGCTGCATCGAGAACATCCTCAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 102671 AATGCGCTTTTCCGCCAGCGCAGCTGCATCGAGAACATCCTCAGGTG...

   1550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1473    GGCCTGCGTGGGGCTCCCGCCACAGAACCACATGCTCCTGGAACACA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102860 CAGGGCCTGCGTGGGGCTCCCGCCACAGAACCACATGCTCCTGGAACACA

   1600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1520 AAATGGAGCGCCCAGGGCCCAGCCTCAAGCGAGTTGGACCCGTGGCTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102910 AAATGGAGCGCCCAGGGCCCAGCCTCAAGCGAGTTGGACCCGTGGCTGCC

   1650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1570 ACCTACCCTATGTTGAACAAGAAAGGACCGGTACCCGCTGCCACCAATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102960 ACCTACCCTATGTTGAACAAGAAAGGACCGGTACCCGCTGCCACCAATGG

   1700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1620 CTGCACCGGTGATGCCAATGGGCATCTGCAAGAGGAGCCCCCAATGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103010 CTGCACCGGTGATGCCAATGGGCATCTGCAAGAGGAGCCCCCAATGCCCA

   1750     .
   1670 CCACC
        |||||
 103060 CCACC