seq1 = pF1KE6415.tfa, 1440 bp
seq2 = pF1KE6415/gi568815583r_57855200.tfa (gi568815583r:57855200_58165650), 310451 bp

>pF1KE6415 1440
>gi568815583r:57855200_58165650 (Chr15)

(complement)

1-117  (100001-100117)   100% ->
118-222  (151370-151474)   100% ->
223-363  (151653-151793)   100% ->
364-493  (154873-155002)   100% ->
494-555  (170512-170573)   100% ->
556-684  (172578-172706)   100% ->
685-787  (199824-199926)   100% ->
788-972  (201582-201766)   100% ->
973-1137  (203475-203639)   100% ->
1138-1295  (204357-204514)   100% ->
1296-1370  (204807-204881)   100% ->
1371-1440  (210382-210451)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTTCCAGCAAGATAGAGATGCCCGGCGAGGTGAAGGCCGACCCCGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGACTTCCAGCAAGATAGAGATGCCCGGCGAGGTGAAGGCCGACCCCGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGCCCTCATGGCGTCGCTGCACCTCCTGCCGTCGCCCACGCCCAATCTCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CGCCCTCATGGCGTCGCTGCACCTCCTGCCGTCGCCCACGCCCAATCTCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 AAATTAAGTACACCAAG         ATCTTTATAAACAACGAGTGGCAG
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 100101 AAATTAAGTACACCAAGGTA...TAGATCTTTATAAACAACGAGTGGCAG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 AACTCAGAGAGTGGGAGAGTGTTCCCTGTCTATAATCCAGCCACAGGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151394 AACTCAGAGAGTGGGAGAGTGTTCCCTGTCTATAATCCAGCCACAGGAGA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 ACAGGTGTGTGAAGTTCAAGAAGCAGACAAG         GCAGATATAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 151444 ACAGGTGTGTGAAGTTCAAGAAGCAGACAAGGTA...CAGGCAGATATAG

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 ACAAAGCAGTGCAGGCAGCCCGCCTGGCTTTCTCTCTTGGTTCAGTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151663 ACAAAGCAGTGCAGGCAGCCCGCCTGGCTTTCTCTCTTGGTTCAGTGTGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    283 AGAAGGATGGATGCTTCAGAAAGGGGACGTCTGTTGGATAAGCTTGCAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 151713 AGAAGGATGGATGCTTCAGAAAGGGGACGTCTGTTGGATAAGCTTGCAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    333 CTTGGTGGAACGGGACAGGGCAGTTCTTGCA         ACCATGGAAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||
 151763 CTTGGTGGAACGGGACAGGGCAGTTCTTGCAGTA...CAGACCATGGAAT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCCTAAATGGTGGCAAACCATTCCTGCAAGCTTTTTATGTGGATTTGCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154883 CCCTAAATGGTGGCAAACCATTCCTGCAAGCTTTTTATGTGGATTTGCAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 GGCGTCATCAAAACCTTTCGATATTACGCAGGCTGGGCTGATAAAATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 154933 GGCGTCATCAAAACCTTTCGATATTACGCAGGCTGGGCTGATAAAATTCA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    474 TGGGATGACCATTCCTGTAG         ATGGAGACTATTTTACCTTTA
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 154983 TGGGATGACCATTCCTGTAGGTA...CAGATGGAGACTATTTTACCTTTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CAAGACATGAACCCATTGGAGTGTGTGGACAGATCATCCCA         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 170533 CAAGACATGAACCCATTGGAGTGTGTGGACAGATCATCCCAGTG...CAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 TGGAACTTCCCCCTGCTGATGTTTGCCTGGAAAATAGCTCCAGCTTTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172578 TGGAACTTCCCCCTGCTGATGTTTGCCTGGAAAATAGCTCCAGCTTTGTG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CTGTGGCAATACAGTAGTTATTAAGCCAGCAGAGCAAACACCACTCAGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 172628 CTGTGGCAATACAGTAGTTATTAAGCCAGCAGAGCAAACACCACTCAGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 CACTCTACATGGGAGCCCTCATCAAGGAG         GTTGGAAAGCTT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 172678 CACTCTACATGGGAGCCCTCATCAAGGAGGTA...CAGGTTGGAAAGCTT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 ATCCAAGAAGCAGCTGGAAGAAGTAATTTGAAGAGAGTAACTCTGGAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 199836 ATCCAAGAAGCAGCTGGAAGAAGTAATTTGAAGAGAGTAACTCTGGAACT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    747 TGGAGGCAAAAGTCCTAATATTATTTTTGCTGATGCTGACT         
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>
 199886 TGGAGGCAAAAGTCCTAATATTATTTTTGCTGATGCTGACTGTA...TAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 TGGACTATGCTGTGGAGCAGGCCCACCAGGGTGTGTTCTTCAATCAAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201582 TGGACTATGCTGTGGAGCAGGCCCACCAGGGTGTGTTCTTCAATCAAGGT

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    838 CAGTGCTGCACTGCAGGCTCTCGCATCTTCGTGGAGGAGTCCATCTATGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201632 CAGTGCTGCACTGCAGGCTCTCGCATCTTCGTGGAGGAGTCCATCTATGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    888 GGAGTTTGTGAGAAGAAGCGTGGAGCGGGCCAAGAGGCGCGTAGTGGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 201682 GGAGTTTGTGAGAAGAAGCGTGGAGCGGGCCAAGAGGCGCGTAGTGGGGA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GTCCCTTTGACCCCACCACTGAGCAGGGTCCCCAG         ATTGAT
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||
 201732 GTCCCTTTGACCCCACCACTGAGCAGGGTCCCCAGGTA...CAGATTGAT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 AAGAAACAGTACAACAAGATCTTGGAACTCATCCAGAGTGGTGTGGCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203481 AAGAAACAGTACAACAAGATCTTGGAACTCATCCAGAGTGGTGTGGCTGA

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1029 GGGCGCCAAGCTGGAATGTGGAGGCAAAGGACTGGGCCGAAAGGGGTTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203531 GGGCGCCAAGCTGGAATGTGGAGGCAAAGGACTGGGCCGAAAGGGGTTTT

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1079 TCATTGAGCCCACAGTGTTTTCCAACGTCACTGATGATATGCGGATTGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 203581 TCATTGAGCCCACAGTGTTTTCCAACGTCACTGATGATATGCGGATTGCC

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1129 AAGGAGGAG         ATCTTTGGCCCTGTTCAGGAAATTTTGAGATT
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 203631 AAGGAGGAGGTA...CAGATCTTTGGCCCTGTTCAGGAAATTTTGAGATT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1170 TAAGACGATGGATGAAGTTATCGAAAGAGCCAATAACTCAGACTTTGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204389 TAAGACGATGGATGAAGTTATCGAAAGAGCCAATAACTCAGACTTTGGAC

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1220 TCGTAGCAGCTGTCTTTACTAATGACATCAACAAGGCCCTCACAGTGTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204439 TCGTAGCAGCTGTCTTTACTAATGACATCAACAAGGCCCTCACAGTGTCT

   1350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1270 TCTGCAATGCAAGCTGGGACTGTTTG         GATCAATTGTTACAA
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 204489 TCTGCAATGCAAGCTGGGACTGTTTGGTA...CAGGATCAATTGTTACAA

   1400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1311 TGCCTTAAATGCCCAGAGCCCCTTTGGGGGATTCAAGATGTCTGGAAATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 204822 TGCCTTAAATGCCCAGAGCCCCTTTGGGGGATTCAAGATGTCTGGAAATG

   1450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1361 GGAGAGAAAT         GGGAGAATTTGGCTTGCGGGAGTACTCAGAA
        ||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||
 204872 GGAGAGAAATGTA...CAGGGGAGAATTTGGCTTGCGGGAGTACTCAGAA

   1500     .    :    .    :    .    :    .
   1402 GTTAAGACGGTGACAGTAAAGATCCCCCAGAAGAACTCC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 210413 GTTAAGACGGTGACAGTAAAGATCCCCCAGAAGAACTCC