seq1 = pF1KE6413.tfa, 1332 bp
seq2 = pF1KE6413/gi568815584r_94183968.tfa (gi568815584r:94183968_94390593), 206626 bp

>pF1KE6413 1332
>gi568815584r:94183968_94390593 (Chr14)

(complement)

1-718  (100001-100718)   100% ->
719-992  (102035-102308)   100% ->
993-1143  (104336-104486)   100% ->
1144-1332  (106438-106626)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAAGGTGGTGCCAAGTCTCCTGCTCTCCGTCCTCCTGGCACAGGTGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAAGGTGGTGCCAAGTCTCCTGCTCTCCGTCCTCCTGGCACAGGTGTG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GCTGGTACCCGGCTTGGCCCCCAGTCCTCAGTCGCCAGAGACCCCAGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 GCTGGTACCCGGCTTGGCCCCCAGTCCTCAGTCGCCAGAGACCCCAGCCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CTCAGAACCAGACCAGCAGGGTAGTGCAGGCTCCCAAGGAGGAAGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CTCAGAACCAGACCAGCAGGGTAGTGCAGGCTCCCAAGGAGGAAGAGGAA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GATGAGCAGGAGGCCAGCGAGGAGAAGGCCAGTGAGGAAGAGAAAGCCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GATGAGCAGGAGGCCAGCGAGGAGAAGGCCAGTGAGGAAGAGAAAGCCTG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GCTGATGGCCAGCAGGCAGCAGCTTGCCAAGGAGACTTCAAACTTCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GCTGATGGCCAGCAGGCAGCAGCTTGCCAAGGAGACTTCAAACTTCGGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCAGCCTGCTGCGAAAGATCTCCATGAGGCACGATGGCAACATGGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCAGCCTGCTGCGAAAGATCTCCATGAGGCACGATGGCAACATGGTCTTC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TCTCCATTTGGCATGTCCTTGGCCATGACAGGCTTGATGCTGGGGGCCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TCTCCATTTGGCATGTCCTTGGCCATGACAGGCTTGATGCTGGGGGCCAC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AGGGCCGACTGAAACCCAGATCAAGAGAGGGCTCCACTTGCAGGCCCTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AGGGCCGACTGAAACCCAGATCAAGAGAGGGCTCCACTTGCAGGCCCTGA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCCCACCAAGCCCGGGCTCCTGCCTTCCCTCTTTAAGGGACTCAGAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCCCACCAAGCCCGGGCTCCTGCCTTCCCTCTTTAAGGGACTCAGAGAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ACCCTCTCCCGCAACCTGGAACTGGGCCTCACACAGGGGAGTTTTGCCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ACCCTCTCCCGCAACCTGGAACTGGGCCTCACACAGGGGAGTTTTGCCTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CATCCACAAGGATTTTGATGTCAAAGAGACTTTCTTCAATTTATCCAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CATCCACAAGGATTTTGATGTCAAAGAGACTTTCTTCAATTTATCCAAGA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 GGTATTTTGATACAGAGTGCGTGCCTATGAATTTTCGCAATGCCTCACAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 GGTATTTTGATACAGAGTGCGTGCCTATGAATTTTCGCAATGCCTCACAG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 GCCAAAAGGCTCATGAATCATTACATTAACAAAGAGACTCGGGGGAAAAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 GCCAAAAGGCTCATGAATCATTACATTAACAAAGAGACTCGGGGGAAAAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 TCCCAAACTGTTTGATGAGATTAATCCTGAAACCAAATTAATTCTTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 TCCCAAACTGTTTGATGAGATTAATCCTGAAACCAAATTAATTCTTGTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ATTACATCTTGTTCAAAG         GGAAATGGTTGACCCCATTTGAC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 100701 ATTACATCTTGTTCAAAGGTA...CAGGGAAATGGTTGACCCCATTTGAC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 CCTGTCTTCACCGAAGTCGACACTTTCCACCTGGACAAGTACAAGACCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102058 CCTGTCTTCACCGAAGTCGACACTTTCCACCTGGACAAGTACAAGACCAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 TAAGGTGCCCATGATGTACGGTGCAGGCAAGTTTGCCTCCACCTTTGACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102108 TAAGGTGCCCATGATGTACGGTGCAGGCAAGTTTGCCTCCACCTTTGACA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 AGAATTTTCGTTGTCATGTCCTCAAACTGCCCTACCAAGGAAATGCCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102158 AGAATTTTCGTTGTCATGTCCTCAAACTGCCCTACCAAGGAAATGCCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 ATGCTGGTGGTCCTCATGGAGAAAATGGGTGACCACCTCGCCCTTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102208 ATGCTGGTGGTCCTCATGGAGAAAATGGGTGACCACCTCGCCCTTGAAGA

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    942 CTACCTGACCACAGACTTGGTGGAGACATGGCTCAGAAACATGAAAACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102258 CTACCTGACCACAGACTTGGTGGAGACATGGCTCAGAAACATGAAAACCA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    992 G         AAACATGGAAGTTTTCTTTCCGAAGTTCAAGCTAGATCAG
        |>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 102308 GGTA...CAGAAACATGGAAGTTTTCTTTCCGAAGTTCAAGCTAGATCAG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1033 AAGTATGAGATGCATGAGCTGCTTAGGCAGATGGGAATCAGAAGAATCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104376 AAGTATGAGATGCATGAGCTGCTTAGGCAGATGGGAATCAGAAGAATCTT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1083 CTCACCCTTTGCTGACCTTAGTGAACTCTCAGCTACTGGAAGAAATCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104426 CTCACCCTTTGCTGACCTTAGTGAACTCTCAGCTACTGGAAGAAATCTCC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1133 AAGTATCCAGG         GTTTTACAAAGAACAGTGATTGAAGTTGAT
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 104476 AAGTATCCAGGGTA...CAGGTTTTACAAAGAACAGTGATTGAAGTTGAT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1174 GAAAGGGGCACTGAGGCAGTGGCAGGAATCTTGTCAGAAATTACTGCTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106468 GAAAGGGGCACTGAGGCAGTGGCAGGAATCTTGTCAGAAATTACTGCTTA

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1224 TTCCATGCCTCCTGTCATCAAAGTGGACCGGCCATTTCATTTCATGATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106518 TTCCATGCCTCCTGTCATCAAAGTGGACCGGCCATTTCATTTCATGATCT

   1300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1274 ATGAAGAAACCTCTGGAATGCTTCTGTTTCTGGGCAGGGTGGTGAATCCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 106568 ATGAAGAAACCTCTGGAATGCTTCTGTTTCTGGGCAGGGTGGTGAATCCG

   1350     .
   1324 ACTCTCCTA
        |||||||||
 106618 ACTCTCCTA