seq1 = pF1KE6396.tfa, 1314 bp
seq2 = pF1KE6396/gi568815590r_81593659.tfa (gi568815590r:81593659_81794972), 201314 bp

>pF1KE6396 1314
>gi568815590r:81593659_81794972 (Chr8)

(complement)

1-1314  (100001-101314)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGATTAGAAAACTTTTTATTGTTCTACTTTTGTTGCTTGTGACTATAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGATTAGAAAACTTTTTATTGTTCTACTTTTGTTGCTTGTGACTATAGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 AGAAGCAAGGATGTCATCGCTCAGTTTTCTGAATATAGAGAAGACTGAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 AGAAGCAAGGATGTCATCGCTCAGTTTTCTGAATATAGAGAAGACTGAAA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TACTATTTTTCACAAAGACTGAAGAAACCATCCTTGTAAGTTCAAGCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TACTATTTTTCACAAAGACTGAAGAAACCATCCTTGTAAGTTCAAGCTAC

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAAAATAAACGGCCTAATTCCAGCCACCTCTTTGTGAAAATAGAAGATCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAAAATAAACGGCCTAATTCCAGCCACCTCTTTGTGAAAATAGAAGATCC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 TAAAATACTACAAATGGTGAATGTGGCCAAGAAGATCTCATCAGATGCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 TAAAATACTACAAATGGTGAATGTGGCCAAGAAGATCTCATCAGATGCTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 CAAACTTTACCATAAATCTGGTGACCGATGAAGAAGGAGAAACAAATGTG
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100251 CAAACTTTACCATAAATCTGGTGACTGATGAAGAAGGAGAAACAAATGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 ACTATTCAACTCTGGGATTCTGAAGGTAGGCAAGAAAGACTCATTGAAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 ACTATTCAACTCTGGGATTCTGAAGGTAGGCAAGAAAGACTCATTGAAGA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 AATCAAGAATGTGAAAGTCAAAGTGCTCAAACAAAAAGACAGTCTACTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 AATCAAGAATGTGAAAGTCAAAGTGCTCAAACAAAAAGACAGTCTACTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGGCACCAATGCATATTGATAGAAACATCCTAATGCTTATTTTACCACTA
        ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
 100401 AGGCACCAATGCATATTGATAGAAATATCCTAATGCTTATTTTACCACTA

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 ATACTATTGAATAAGTGTGCATTTGGTTGTAAGATTGAATTACAGCTGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 ATACTATTGAATAAGTGTGCATTTGGTTGTAAGATTGAATTACAGCTGTT

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TCAAACAGTATGGAAGAGACCTTTGCCAGTAATTCTTGGGGCAGTTACAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TCAAACAGTATGGAAGAGACCTTTGCCAGTAATTCTTGGGGCAGTTACAC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AGTTTTTTCTGATGCCATTTTGCGGGTTTCTTTTGTCTCAGATTGTGGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AGTTTTTTCTGATGCCATTTTGCGGGTTTCTTTTGTCTCAGATTGTGGCA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 TTGCCTGAGGCGCAAGCTTTTGGAGTTGTAATGACCTGCACGTGCCCAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 TTGCCTGAGGCGCAAGCTTTTGGAGTTGTAATGACCTGCACGTGCCCAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 AGGGGGTGGGGGCTATCTCTTTGCTCTGCTTCTAGATGGAGATTTCACAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 AGGGGGTGGGGGCTATCTCTTTGCTCTGCTTCTAGATGGAGATTTCACAT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 TGGCCATTTTGATGACTTGCACATCAACATTATTGGCTCTGATCATGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 TGGCCATTTTGATGACTTGCACATCAACATTATTGGCTCTGATCATGATG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 CCTGTCAATTCTTATATATACAGTAGGATATTAGGGTTGTCAGGTACATT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 CCTGTCAATTCTTATATATACAGTAGGATATTAGGGTTGTCAGGTACATT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CCATATTCCTGTTTCTAAAATTGTGTCAACACTCCTTTTCATACTTGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CCATATTCCTGTTTCTAAAATTGTGTCAACACTCCTTTTCATACTTGTGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 CAGTATCAATTGGAATAGTCATCAAGCATAGAATACCTGAAAAAGCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 CAGTATCAATTGGAATAGTCATCAAGCATAGAATACCTGAAAAAGCAAGC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 TTCTTAGAGAGAATAATTAGACCTCTGAGTTTTATTTTAATGTTCGTAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 TTCTTAGAGAGAATAATTAGACCTCTGAGTTTTATTTTAATGTTCGTAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 AATTTATTTGACTTTTACAGTGGGATTAGTGTTCTTAAAAACAGATAATC
        ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 AATTTATTTGACTTTCACAGTGGGATTAGTGTTCTTAAAAACAGATAATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TAGAGGTGATTCTGTTGGGTCTCTTAGTTCCTGCTTTGGGTTTGCTGTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TAGAGGTGATTCTGTTGGGTCTCTTAGTTCCTGCTTTGGGTTTGCTGTTT

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 GGGTACTCCTTTGCTAAAGTTTGTACGCTGCCTCTTCCTGTTTGTAAAAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 GGGTACTCCTTTGCTAAAGTTTGTACGCTGCCTCTTCCTGTTTGTAAAAC

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGTTGCTATTGAAAGTGGGATGTTAAATAGTTTCTTAGCTCTTGCCGTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGTTGCTATTGAAAGTGGGATGTTAAATAGTTTCTTAGCTCTTGCCGTTA

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 TTCAGCTGTCTTTTCCACAGTCCAAGGCCAATTTAGCTTCTGTGGCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 TTCAGCTGTCTTTTCCACAGTCCAAGGCCAATTTAGCTTCTGTGGCTCCT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1201 TTTACAGTAGCCATGTGTTCTGGATGTGAAATGTTACTGATCATTCTAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 TTTACAGTAGCCATGTGTTCTGGATGTGAAATGTTACTGATCATTCTAGT

   1250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1251 TTACAAGGCTAAGAAAAGATGTATCTTTTTCTTACAAGATAAAAGGAAAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101251 TTACAAGGCTAAGAAAAGATGTATCTTTTTCTTACAAGATAAAAGGAAAA

   1300     .    :
   1301 GAAATTTCCTAATC
        ||||||||||||||
 101301 GAAATTTCCTAATC