seq1 = pF1KE6395.tfa, 1239 bp
seq2 = pF1KE6395/gi568815592f_83423442.tfa (gi568815592f:83423442_83624680), 201239 bp

>pF1KE6395 1239
>gi568815592f:83423442_83624680 (Chr6)

1-1239  (100001-101239)   99%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGAAAATATGCTGCTTTGGTTGATATTTTTCACCCCTGGGTGGACCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGAAAATATGCTGCTTTGGTTGATATTTTTCACCCCTGGGTGGACCCT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CATTGATGGATCTGAAATGGAATGGGATTTTATGTGGCACTTGAGAAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CATTGATGGATCTGAAATGGAATGGGATTTTATGTGGCACTTGAGAAAGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TACCCCGGATTGTCAGTGAAAGGACTTTCCATCTCACCAGCCCCGCATTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TACCCCGGATTGTCAGTGAAAGGACTTTCCATCTCACCAGCCCCGCATTT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 GAGGCAGATGCTAAGATGATGGTAAATACAGTGTGTGGCATCGAATGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 GAGGCAGATGCTAAGATGATGGTAAATACAGTGTGTGGCATCGAATGCCA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GAAAGAACTCCCAACTCCCAGCCTTTCTGAATTGGAGGATTATCTTTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GAAAGAACTCCCAACTCCCAGCCTTTCTGAATTGGAGGATTATCTTTCCT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 ATGAGACTGTCTTTGAGAATGGCACCCGAACCTTAACCAGGGTGAAAGTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 ATGAGACTGTCTTTGAGAATGGCACCCGAACCTTAACCAGGGTGAAAGTT

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CAAGATTTGGTTCTTGAGCCGACTCAAAATATCACCACAAAGGGAGTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CAAGATTTGGTTCTTGAGCCGACTCAAAATATCACCACAAAGGGAGTATC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TGTTAGGAGAAAGAGACAGGTGTATGGCACCGACAGCAGGTTCAGCATCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 TGTTAGGAGAAAGAGACAGGTGTATGGCACCGACAGCAGGTTCAGCATCT

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 TGGACAAAAGGTTCTTAACCAATTTCCCTTTCAGCACAGCTGTGAAGCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 TGGACAAAAGGTTCTTAACCAATTTCCCTTTCAGCACAGCTGTGAAGCTT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 TCCACGGGCTGTAGTGGCATTCTCATTTCCCCTCAGCATGTTCTAACTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 TCCACGGGCTGTAGTGGCATTCTCATTTCCCCTCAGCATGTTCTAACTGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 TGCCCACTGTGTTCATGATGGAAAGGACTATGTCAAAGGGAGTAAAAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 TGCCCACTGTGTTCATGATGGAAAGGACTATGTCAAAGGGAGTAAAAAGC

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 TAAGGGTAGGGTTGTTGAAGATGAGGAATAAAAGTGGAGGCAAGAAACGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 TAAGGGTAGGGTTGTTGAAGATGAGGAATAAAAGTGGAGGCAAGAAACGT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 CGAGGTTCTAAGAGGAGCAGGAGAGAAGCTAGTGGTGGTGACCAAAGAGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 CGAGGTTCTAAGAGGAGCAGGAGAGAAGCTAGTGGTGGTGACCAAAGAGA

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 GGGTACCAGAGAGCATCTGCAGGAGAGAGCGAAGGGTGGGAGAAGAAGAA
        |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
 100651 GGGTACCAGAGAGCATCTGCGGGAGAGAGCGAAGGGTGGGAGAAGAAGAA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 AAAAATCTGGCCGGGGTCAGAGGATTGCCGAAGGGAGGCCTTCCTTTCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 AAAAATCTGGCCGGGGTCAGAGGATTGCCGAAGGGAGGCCTTCCTTTCAG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 TGGACCCGGGTCAAGAATACCCACATTCCGAAGGGCTGGGCACGAGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 TGGACCCGGGTCAAGAATACCCACATTCCGAAGGGCTGGGCACGAGGAGG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 CATGGGGGACGCTACCTTGGACTATGACTATGCTCTTCTGGAGCTGAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 CATGGGGGACGCTACCTTGGACTATGACTATGCTCTTCTGGAGCTGAAGC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 GTGCTCACAAAAAGAAATACATGGAACTTGGAATCAGCCCAACGATCAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 GTGCTCACAAAAAGAAATACATGGAACTTGGAATCAGCCCAACGATCAAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 AAAATGCCTGGTGGAATGATCCACTTCTCAGGATTTGATAACGATAGGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 AAAATGCCTGGTGGAATGATCCACTTCTCAGGATTTGATAACGATAGGGC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 TGATCAGTTGGTCTATCGGTTTTGCAGTGTGTCCGACGAATCCAATGATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 TGATCAGTTGGTCTATCGGTTTTGCAGTGTGTCCGACGAATCCAATGATC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1001 TCCTTTACCAATACTGCGATGCTGAGTCGGGCTCCACCGGTTCGGGGGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101001 TCCTTTACCAATACTGCGATGCTGAGTCGGGCTCCACCGGTTCGGGGGTC

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1051 TATCTGCGTCTGAAAGATCCAGACAAAAAGAATTGGAAGCGCAAAATCAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101051 TATCTGCGTCTGAAAGATCCAGACAAAAAGAATTGGAAGCGCAAAATCAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1101 TGCGGTCTACTCAGGGCACCAGTGGGTGGATGTCCACGGGGTTCAGAAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101101 TGCGGTCTACTCAGGGCACCAGTGGGTGGATGTCCACGGGGTTCAGAAGG

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1151 ACTACAACGTTGCTGTTCGCATCACTCCCCTAAAATACGCCCAGATTTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101151 ACTACAACGTTGCTGTTCGCATCACTCCCCTAAAATACGCCCAGATTTGC

   1200     .    :    .    :    .    :    .
   1201 CTCTGGATTCACGGGAACGATGCCAATTGTGCTTACGGC
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 101201 CTCTGGATTCACGGGAACGATGCCAATTGTGCTTACGGC