seq1 = pF1KE6394.tfa, 1029 bp
seq2 = pF1KE6394/gi568815596r_69860660.tfa (gi568815596r:69860660_70061688), 201029 bp

>pF1KE6394 1029
>gi568815596r:69860660_70061688 (Chr2)

(complement)

1-1029  (100001-101029)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGAGCCCAGGGGCCAGCCTAGGCATCAAAAAGGCTCTGCAGAGTGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGGGAGCCCAGGGGCCAGCCTAGGCATCAAAAAGGCTCTGCAGAGTGA

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ACAGGCCACAGCACTGCCTGCCTCTGCCCCAGCAGTCAGCCAGCCGACCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ACAGGCCACAGCACTGCCTGCCTCTGCCCCAGCAGTCAGCCAGCCGACCG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CGCCTGCTCCCTCCTGCTTGCCCAAGGCCGGGCAAGTCATCCCCACTCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CGCCTGCTCCCTCCTGCTTGCCCAAGGCCGGGCAAGTCATCCCCACTCTG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 CTTCGAGAGGCCCCGTTTTCCAGCGTGATTGCGCCGACACTGCTCTGTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 CTTCGAGAGGCCCCGTTTTCCAGCGTGATTGCGCCGACACTGCTCTGTGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 GTTTCTCTTCTTGGCGTGGGTTGCTGCTGAGGTTCCAGAGGAGAGCAGCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 GTTTCTCTTCTTGGCGTGGGTTGCTGCTGAGGTTCCAGAGGAGAGCAGCA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 GGATGGCCGGGAGCGGAGCCAGGAGTGAGGAAGGCCGCCGGCAGCATGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 GGATGGCCGGGAGCGGAGCCAGGAGTGAGGAAGGCCGCCGGCAGCATGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 TTCGTCCCGGAACCTTTTGATGGGGCCAATGTCGTCCCAAACCTCTGGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 TTCGTCCCGGAACCTTTTGATGGGGCCAATGTCGTCCCAAACCTCTGGCT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 GCACAGCTTTGAAGTCATCAATGACCTCAACCATTGGGACCATATCACCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100351 GCACAGCTTTGAAGTCATCAATGACCTCAACCATTGGGACCATATCACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    401 AGCTAAGGTTCCTGAAAGAGTCCCTCAGAGGAGAGGCCCTGGGTGTCTAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100401 AGCTAAGGTTCCTGAAAGAGTCCCTCAGAGGAGAGGCCCTGGGTGTCTAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    451 AATAGGCTCAGTCCCCAGGACCAGGGAGACTATGGGACTGTGAAAGAGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100451 AATAGGCTCAGTCCCCAGGACCAGGGAGACTATGGGACTGTGAAAGAGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    501 CCTCCTGAAGGCCTTTGGGGTCCCTGGGGCTGCCCCCAGCCACCTGCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100501 CCTCCTGAAGGCCTTTGGGGTCCCTGGGGCTGCCCCCAGCCACCTGCCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    551 AAGAGATCGTCTTTGCCAACAGCATGGGTAAGGGCTACTATCTCAAGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100551 AAGAGATCGTCTTTGCCAACAGCATGGGTAAGGGCTACTATCTCAAGGGG

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    601 AAGATTGGCAAAGTGCCCGTGAGGTTCCTGGTGGACTCTGGGGCCCAGGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100601 AAGATTGGCAAAGTGCCCGTGAGGTTCCTGGTGGACTCTGGGGCCCAGGT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    651 CTCTGTGGTCCACCCAAACTTGTGGGAGGAGGTCACTGATGGCGATCTGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100651 CTCTGTGGTCCACCCAAACTTGTGGGAGGAGGTCACTGATGGCGATCTGG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    701 ACACCCTGCAGCCCTTTGAGAATGTGGTAAAGGTGGCCAATGGTGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100701 ACACCCTGCAGCCCTTTGAGAATGTGGTAAAGGTGGCCAATGGTGCTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    751 ATGAAGATCCTGGGTGTCTGGGATACAGCGGTGTCCCTAGGCAAGCTGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100751 ATGAAGATCCTGGGTGTCTGGGATACAGCGGTGTCCCTAGGCAAGCTGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    801 GCTGAAGGCACAGTTCCTAGTGGCCAATGCGAGTGCCGAGGAAGCCATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100801 GCTGAAGGCACAGTTCCTAGTGGCCAATGCGAGTGCCGAGGAAGCCATCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    851 TTGGCACTGATGTGCTCCAGGACCACAATGCTATCCTGGACTTTGAGCAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100851 TTGGCACTGATGTGCTCCAGGACCACAATGCTATCCTGGACTTTGAGCAC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    901 CGCACATGCACCCTGAAAGGGAAGAAGTTTCGCCTTCTGCCTGTGGGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100901 CGCACATGCACCCTGAAAGGGAAGAAGTTTCGCCTTCTGCCTGTGGGAGG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    951 GTCCCTGGAAGATGAGTTTGACCTGGAGCTCATAGAGGAGGACCCCTCCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100951 GTCCCTGGAAGATGAGTTTGACCTGGAGCTCATAGAGGAGGACCCCTCCT

   1000     .    :    .    :    .
   1001 CAGAAGAAGGGCGGCAGGAGCTATCCCAC
        |||||||||||||||||||||||||||||
 101001 CAGAAGAAGGGCGGCAGGAGCTATCCCAC