seq1 = pF1KE6378.tfa, 921 bp seq2 = pF1KE6378/gi568815595f_123109218.tfa (gi568815595f:123109218_123371719), 262502 bp >pF1KE6378 921 >gi568815595f:123109218_123371719 (Chr3) 1-182 (100001-100182) 100% -> 183-346 (114342-114505) 100% -> 347-541 (115886-116080) 100% -> 542-657 (136682-136797) 100% -> 658-723 (150307-150372) 100% -> 724-921 (162305-162502) 100% 0 . : . : . : . : . : 1 ATGTCTATGATTTTATCTGCCTCAGTCATTCGTGTCAGAGATGGACTGCC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100001 ATGTCTATGATTTTATCTGCCTCAGTCATTCGTGTCAGAGATGGACTGCC 50 . : . : . : . : . : 51 ACTTTCTGCTTCTACTGATTATGAACAAAGCACAGGAATGCAGGAGTGCA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100051 ACTTTCTGCTTCTACTGATTATGAACAAAGCACAGGAATGCAGGAGTGCA 100 . : . : . : . : . : 101 GAAAGTATTTTAAAATGCTTTCGAGGAAACTTGCTCAACTTCCTGATAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 100101 GAAAGTATTTTAAAATGCTTTCGAGGAAACTTGCTCAACTTCCTGATAGA 150 . : . : . : . : . : 151 TGTACACTGAAAACTGGACATTATAACATTAA TTTTATTAG ||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||| 100151 TGTACACTGAAAACTGGACATTATAACATTAAGTA...TAGTTTTATTAG 200 . : . : . : . : . : 192 CTCTCTGGGAGTGAGCTACATGATGTTGTGCACTGAAAATTACCCAAATG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114351 CTCTCTGGGAGTGAGCTACATGATGTTGTGCACTGAAAATTACCCAAATG 250 . : . : . : . : . : 242 TTCTCGCCTTCTCTTTCCTGGATGAGCTTCAGAAGGAGTTCATTACTACT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114401 TTCTCGCCTTCTCTTTCCTGGATGAGCTTCAGAAGGAGTTCATTACTACT 300 . : . : . : . : . : 292 TATAACATGATGAAGACAAATACTGCTGTCAGACCATACTGTTTCATTGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114451 TATAACATGATGAAGACAAATACTGCTGTCAGACCATACTGTTTCATTGA 350 . : . : . : . : . : 342 ATTTG ATAACTTCATTCAGAGGACCAAGCAGCGATATAATA |||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||| 114501 ATTTGGTA...TAGATAACTTCATTCAGAGGACCAAGCAGCGATATAATA 400 . : . : . : . : . : 383 ATCCCAGGTCTCTTTCAACAAAGATAAATCTTTCTGACATGCAGACGGAA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115922 ATCCCAGGTCTCTTTCAACAAAGATAAATCTTTCTGACATGCAGACGGAA 450 . : . : . : . : . : 433 ATCAAGCTGAGGCCTCCTTATCAAATTTCCATGTGCGAACTGGGGTCAGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 115972 ATCAAGCTGAGGCCTCCTTATCAAATTTCCATGTGCGAACTGGGGTCAGC 500 . : . : . : . : . : 483 CAATGGAGTCACATCAGCATTTTCTGTTGACTGTAAAGGTGCTGGTAAGA |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 116022 CAATGGAGTCACATCAGCATTTTCTGTTGACTGTAAAGGTGCTGGTAAGA 550 . : . : . : . : . : 533 TTTCTTCTG CTCACCAGCGACTGGAACCAGCAACTCTGTCA |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 116072 TTTCTTCTGGTG...CAGCTCACCAGCGACTGGAACCAGCAACTCTGTCA 600 . : . : . : . : . : 574 GGGATTGTAGGATTTATCCTTAGTCTTTTATGTGGAGCTCTGAATTTAAT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 136714 GGGATTGTAGGATTTATCCTTAGTCTTTTATGTGGAGCTCTGAATTTAAT 650 . : . : . : . : . : 624 TCGAGGCTTTCATGCTATAGAAAGTCTCCTGCAG AGTGATG ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||| 136764 TCGAGGCTTTCATGCTATAGAAAGTCTCCTGCAGGTA...CAGAGTGATG 700 . : . : . : . : . : 665 GTGATGATTTTAATTACATCATTGCATTTTTCCTTGGAACAGCAGCCTGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 150314 GTGATGATTTTAATTACATCATTGCATTTTTCCTTGGAACAGCAGCCTGC 750 . : . : . : . : . : 715 CTTTACCAG TGTTATTTACTTGTCTACTACACCGGCTGGCG |||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||| 150364 CTTTACCAGGTA...CAGTGTTATTTACTTGTCTACTACACCGGCTGGCG 800 . : . : . : . : . : 756 GAATGTCAAATCTTTTTTGACTTTTGGCTTAATCTGTCTATGCAACATGT |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 162337 GAATGTCAAATCTTTTTTGACTTTTGGCTTAATCTGTCTATGCAACATGT 850 . : . : . : . : . : 806 ATCTCTATGAACTGCGCAACCTCTGGCAGCTTTTCTTTCATGTGACTGTG |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 162387 ATCTCTATGAACTGCGCAACCTCTGGCAGCTTTTCTTTCATGTGACTGTG 900 . : . : . : . : . : 856 GGAGCATTTGTTACACTACAGATCTGGCTAAGGCAAGCCCAGGGCAAGGC |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 162437 GGAGCATTTGTTACACTACAGATCTGGCTAAGGCAAGCCCAGGGCAAGGC 950 . : . 906 TCCCGATTATGATGTC |||||||||||||||| 162487 TCCCGATTATGATGTC