seq1 = pF1KE6369.tfa, 1044 bp
seq2 = pF1KE6369/gi568815585r_102946136.tfa (gi568815585r:102946136_103166249), 220114 bp

>pF1KE6369 1044
>gi568815585r:102946136_103166249 (Chr13)

(complement)

1-377  (100001-100377)   100% ->
378-496  (107868-107986)   100% ->
497-585  (113542-113630)   98% ->
586-761  (114818-114993)   100% ->
762-919  (116804-116961)   100% ->
920-1044  (119990-120114)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGAATGATCCGAACAGCTGTGTGGACAATGCAACAGTTTGCTCTGGTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGAATGATCCGAACAGCTGTGTGGACAATGCAACAGTTTGCTCTGGTGC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 ATCCTGTGTGGTACCTGAGAGCAATTTCAATAACATCCTAAGTGTGGTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 ATCCTGTGTGGTACCTGAGAGCAATTTCAATAACATCCTAAGTGTGGTCC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 TAAGTACGGTGCTGACCATCCTGTTGGCCTTGGTGATGTTCTCCATGGGA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 TAAGTACGGTGCTGACCATCCTGTTGGCCTTGGTGATGTTCTCCATGGGA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    151 TGCAACGTGGAAATCAAGAAATTTCTAGGGCACATAAAGCGGCCGTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100151 TGCAACGTGGAAATCAAGAAATTTCTAGGGCACATAAAGCGGCCGTGGGG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    201 CATTTGTGTTGGCTTCCTCTGTCAGTTTGGAATCATGCCCCTCACAGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100201 CATTTGTGTTGGCTTCCTCTGTCAGTTTGGAATCATGCCCCTCACAGGAT

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    251 TCATCCTGTCGGTGGCCTTTGACATCCTCCCGCTCCAGGCCGTAGTGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100251 TCATCCTGTCGGTGGCCTTTGACATCCTCCCGCTCCAGGCCGTAGTGGTG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    301 CTCATTATAGGATGCTGCCCTGGAGGAACTGCCTCCAATATCTTGGCCTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100301 CTCATTATAGGATGCTGCCCTGGAGGAACTGCCTCCAATATCTTGGCCTA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    351 TTGGGTCGATGGCGACATGGACCTGAG         CGTCAGCATGACCA
        |||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||
 100351 TTGGGTCGATGGCGACATGGACCTGAGGTA...CAGCGTCAGCATGACCA

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 CATGCTCCACACTGCTTGCCCTCGGAATGATGCCGCTGTGCCTCCTTATC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107882 CATGCTCCACACTGCTTGCCCTCGGAATGATGCCGCTGTGCCTCCTTATC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 TATACCAAAATGTGGGTCGACTCTGGGAGCATCGTAATTCCCTATGATAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107932 TATACCAAAATGTGGGTCGACTCTGGGAGCATCGTAATTCCCTATGATAA

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CATAG         GTACATCTCTGGTTGCTCTCGTTGTTCCTGTTTCCA
        |||||>>>...>>>|||||||||||||| |||||||||||||||||||||
 107982 CATAGGTA...TAGGTACATCTCTGGTTTCTCTCGTTGTTCCTGTTTCCA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    533 TTGGAATGTTTGTTAATCACAAATGGCCCCAAAAAGCAAAGATCATACTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113578 TTGGAATGTTTGTTAATCACAAATGGCCCCAAAAAGCAAAGATCATACTT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    583 AAA         ATTGGGTCCATCGCGGGCGCCATCCTCATTGTGCTCAT
        |||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 113628 AAAGTA...CAGATTGGGTCCATCGCGGGCGCCATCCTCATTGTGCTCAT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    624 AGCTGTGGTTGGAGGAATATTGTACCAAAGCGCCTGGATCATTGCTCCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114856 AGCTGTGGTTGGAGGAATATTGTACCAAAGCGCCTGGATCATTGCTCCCA

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    674 AACTGTGGATTATAGGAACAATATTTCCTGTGGCGGGTTACTCCCTGGGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 114906 AACTGTGGATTATAGGAACAATATTTCCTGTGGCGGGTTACTCCCTGGGG

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    724 TTTCTTCTGGCTAGAATTGCTGGTCTACCCTGGTACAG         GTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||
 114956 TTTCTTCTGGCTAGAATTGCTGGTCTACCCTGGTACAGGTA...TAGGTG

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    765 CCGAACGGTTGCTTTTGAAACGGGGATGCAGAACACGCAGCTATGTTCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116807 CCGAACGGTTGCTTTTGAAACGGGGATGCAGAACACGCAGCTATGTTCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    815 CCATCGTTCAGCTCTCCTTCACTCCTGAGGAGCTCAATGTCGTATTCACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116857 CCATCGTTCAGCTCTCCTTCACTCCTGAGGAGCTCAATGTCGTATTCACC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    865 TTCCCGCTCATCTACAGCATTTTCCAGCTCGCCTTTGCCGCAATATTCTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116907 TTCCCGCTCATCTACAGCATTTTCCAGCTCGCCTTTGCCGCAATATTCTT

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    915 AGGAT         TTTATGTGGCATACAAGAAATGTCATGGAAAAAACA
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 116957 AGGATGTA...TAGTTTATGTGGCATACAAGAAATGTCATGGAAAAAACA

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    956 AGGCAGAAATTCCAGAGAGCAAAGAAAATGGAACGGAGCCAGAGTCATCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120026 AGGCAGAAATTCCAGAGAGCAAAGAAAATGGAACGGAGCCAGAGTCATCG

   1050     .    :    .    :    .    :    .
   1006 TTTTATAAGGCAAATGGAGGATTTCAACCTGACGAAAAG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 120076 TTTTATAAGGCAAATGGAGGATTTCAACCTGACGAAAAG