seq1 = pF1KE6362.tfa, 1011 bp
seq2 = pF1KE6362/gi568815588r_119041245.tfa (gi568815588r:119041245_119265647), 224403 bp

>pF1KE6362 1011
>gi568815588r:119041245_119265647 (Chr10)

(complement)

1-111  (100001-100111)   100% ->
112-177  (101452-101517)   100% ->
178-252  (103234-103308)   100% ->
253-279  (104567-104593)   100% ->
280-334  (104679-104733)   100% ->
335-360  (105895-105920)   96% ->
361-414  (107586-107639)   100% ->
415-471  (107721-107777)   100% ->
472-537  (107915-107980)   100% ->
538-616  (108892-108970)   100% ->
617-732  (110471-110586)   100% ->
733-818  (117788-117873)   100% ->
819-936  (119295-119412)   100% ->
937-1011  (124329-124403)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGTCCCTGGAACAGGAGGAGGAAACGCAACCTGGGCGGCTCCTAGGACG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGTCCCTGGAACAGGAGGAGGAAACGCAACCTGGGCGGCTCCTAGGACG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CAGAGACGCCGTCCCCGCCTTCATTGAGCCCAACGTGCGCTTCTGGATCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100051 CAGAGACGCCGTCCCCGCCTTCATTGAGCCCAACGTGCGCTTCTGGATCA

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    101 CCGAGCGCCAA         TCCTTTATTCGACGATTTCTTCAATGGACA
        |||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||
 100101 CCGAGCGCCAAGTA...AAGTCCTTTATTCGACGATTTCTTCAATGGACA

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GAATTATTAGATCCTACAAATGTGTTCATTTCAGTT         GAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||
 101482 GAATTATTAGATCCTACAAATGTGTTCATTTCAGTTGTA...TAGGAAAG

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TATAGAAAACTCGAGGCAACTATTGTGCACAAATGAAGATGTTTCCAGCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 103239 TATAGAAAACTCGAGGCAACTATTGTGCACAAATGAAGATGTTTCCAGCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGCCTCGGCGGACCAAAGG         ATACAAGAAGCTTGGAAGCGG
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||
 103289 CTGCCTCGGCGGACCAAAGGGTA...AAGATACAAGAAGCTTGGAAGCGG

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 AGTCTT         GCAACAGTGCATCCCGACAGCAGCAACCTGATCCC
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 104588 AGTCTTGTA...AAGGCAACAGTGCATCCCGACAGCAGCAACCTGATCCC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    315 CAAGCTTTTTCGACCTGCAG         CGTTCCTGCCTTTCATGGCGC
        ||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||| |
 104714 CAAGCTTTTTCGACCTGCAGGTG...CAGCGTTCCTGCCTTTCATGGCAC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    356 CCACG         GTATTTTTGTCAATGACGCCACTGAAAGGGATCAAG
        |||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 105916 CCACGGTG...AAGGTATTTTTGTCAATGACGCCACTGAAAGGGATCAAG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    397 TCCGTGATTTTACCTCAG         GTTTTCCTCTGTGCCTACATGGC
        ||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||
 107622 TCCGTGATTTTACCTCAGGTA...CAGGTTTTCCTCTGTGCCTACATGGC

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    438 AGCGTTCAACAGCATCAATGGAAACAGAAGTTAC         ACTTGTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 107744 AGCGTTCAACAGCATCAATGGAAACAGAAGTTACGTG...TAGACTTGTA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    479 AGCCACTAGAAAGATCATTACTAATGGCGGGAGCCGTTGCTTCTTCAACT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 107922 AGCCACTAGAAAGATCATTACTAATGGCGGGAGCCGTTGCTTCTTCAACT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    529 TTCTTAGGA         GTAATCCCTCAGTTTGTCCAGATGAAGTATGG
        |||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||
 107972 TTCTTAGGAGTA...TAGGTAATCCCTCAGTTTGTCCAGATGAAGTATGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    570 CCTGACTGGCCCTTGGATTAAAAGACTCTTACCTGTGATCTTCCTCG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 108924 CCTGACTGGCCCTTGGATTAAAAGACTCTTACCTGTGATCTTCCTCGGTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    617       TGCAAGCCAGTGGAATGAATGTCTACATGTCCCGAAGTCTTGAA
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108974 ...CAGTGCAAGCCAGTGGAATGAATGTCTACATGTCCCGAAGTCTTGAA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    661 TCCATTAAGGGGATTGCGGTCATGGACAAGGAAGGCAATGTCCTGGGTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 110515 TCCATTAAGGGGATTGCGGTCATGGACAAGGAAGGCAATGTCCTGGGTCA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    711 TTCCAGAATTGCTGGGACAAAG         GCTGTTAGAGAAACGCTAG
        ||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||
 110565 TTCCAGAATTGCTGGGACAAAGGTA...TAGGCTGTTAGAGAAACGCTAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    752 CATCCAGAATAGTGCTGTTTGGGACCTCAGCTCTGATTCCTGAAGTCTTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 117807 CATCCAGAATAGTGCTGTTTGGGACCTCAGCTCTGATTCCTGAAGTCTTC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    802 ACCTACTTTTTTAAAAG         GACCCAGTATTTCAGGAAAAACCC
        |||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||
 117857 ACCTACTTTTTTAAAAGGTA...CAGGACCCAGTATTTCAGGAAAAACCC

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    843 AGGGTCATTGTGGATTTTGAAACTGTCTTGTACTGTCCTGGCAATGGGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 119319 AGGGTCATTGTGGATTTTGAAACTGTCTTGTACTGTCCTGGCAATGGGAC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    893 TGATGGTGCCATTTTCTTTTAGTATATTTCCACAGATTGGACAG      
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...
 119369 TGATGGTGCCATTTTCTTTTAGTATATTTCCACAGATTGGACAGGTA...

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    937    ATACAGTACTGTAGTCTTGAAGAGAAAATTCAGTCTCCAACAGAAGA
        >>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 124326 CAGATACAGTACTGTAGTCTTGAAGAGAAAATTCAGTCTCCAACAGAAGA

   1100     .    :    .    :    .
    984 AACAGAAATCTTTTATCACAGAGGGGTG
        ||||||||||||||||||||||||||||
 124376 AACAGAAATCTTTTATCACAGAGGGGTG