seq1 = pF1KE6359.tfa, 1185 bp
seq2 = pF1KE6359/gi568815597r_76992377.tfa (gi568815597r:76992377_77319402), 327026 bp

>pF1KE6359 1185
>gi568815597r:76992377_77319402 (Chr1)

(complement)

1-93  (100001-100093)   100% ->
94-147  (108914-108967)   100% ->
148-239  (112672-112763)   100% ->
240-375  (150008-150143)   99% ->
376-487  (152573-152684)   100% ->
488-584  (155461-155557)   100% ->
585-702  (157692-157809)   100% ->
703-813  (157998-158108)   100% ->
814-986  (164782-164954)   100% ->
987-1071  (197044-197128)   100% ->
1072-1185  (226913-227026)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGCCGTCACCGACAGCCTCAGCCGGGCTGCGACTGTCTTGGCAACTGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100001 ATGGCCGTCACCGACAGCCTCAGCCGGGCTGCGACTGTCTTGGCAACTGT

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 GTTGCTCTTGTCCTTCGGCAGCGTGGCCGCTAGTCATATCGAG       
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>
 100051 GTTGCTCTTGTCCTTCGGCAGCGTGGCCGCTAGTCATATCGAGGTA...T

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     94   GATCAAGCAGAACAATTCTTTAGAAGTGGCCATACAAACAACTGGGCT
        >>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108912 AGGATCAAGCAGAACAATTCTTTAGAAGTGGCCATACAAACAACTGGGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GTTCTG         GTGTGTACATCCCGATTCTGGTTTAATTATCGACA
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 108962 GTTCTGGTA...CAGGTGTGTACATCCCGATTCTGGTTTAATTATCGACA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 TGTTGCAAATACCCTTTCTGTTTATAGAAGTGTCAAGAGGCTAGGTATTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112707 TGTTGCAAATACCCTTTCTGTTTATAGAAGTGTCAAGAGGCTAGGTATTC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 CTGACAG         TCACATTGTCCTAATGCTTGCAGATGATATGGCC
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 112757 CTGACAGGTA...TAGTCACATTGTCCTAATGCTTGCAGATGATATGGCC

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 TGTAATCCTAGAAATCCCAAACCAGCTACAGTGTTTAGTCACAAGAATAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150042 TGTAATCCTAGAAATCCCAAACCAGCTACAGTGTTTAGTCACAAGAATAT

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 GGAACTAAATGTGTATGGAGATGATGTGGAAGTGGATTATAGAAGTTATG
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
 150092 GGAACTAAATGTGTATGGAGATGATGTGGAAGTGGATTATAGAAGTTACG

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 AG         GTAACTGTGGAGAATTTTTTACGGGTATTAACTGGGAGG
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 150142 AGGTA...TAGGTAACTGTGGAGAATTTTTTACGGGTATTAACTGGGAGG

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    415 ATCCCACCTAGTACTCCTCGGTCAAAACGTCTTCTTTCTGATGACAGAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 152612 ATCCCACCTAGTACTCCTCGGTCAAAACGTCTTCTTTCTGATGACAGAAG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    465 CAATATTCTAATTTATATGACAG         GGCATGGTGGAAATGGTT
        |||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||||||||
 152662 CAATATTCTAATTTATATGACAGGTA...AAGGGCATGGTGGAAATGGTT

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    506 TCTTAAAATTTCAAGATTCTGAAGAAATTACCAACATAGAACTCGCGGAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 155479 TCTTAAAATTTCAAGATTCTGAAGAAATTACCAACATAGAACTCGCGGAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    556 GCTTTTGAACAAATGTGGCAGAAAAGACG         CTACAATGAGCT
        |||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||||||
 155529 GCTTTTGAACAAATGTGGCAGAAAAGACGGTA...CAGCTACAATGAGCT

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    597 ACTGTTTATTATTGATACTTGCCAAGGAGCATCCATGTATGAACGATTTT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157704 ACTGTTTATTATTGATACTTGCCAAGGAGCATCCATGTATGAACGATTTT

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    647 ATTCTCCTAACATAATGGCTCTAGCTAGTAGTCAAGTGGGAGAAGATTCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157754 ATTCTCCTAACATAATGGCTCTAGCTAGTAGTCAAGTGGGAGAAGATTCA

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    697 CTCTCG         CATCAACCTGATCCTGCAATTGGAGTCCATCTTAT
        ||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||
 157804 CTCTCGGTA...TAGCATCAACCTGATCCTGCAATTGGAGTCCATCTTAT

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    738 GGATAGATACACATTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAACCCAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 158033 GGATAGATACACATTTTATGTCTTGGAATTTTTGGAAGAAATTAACCCAG

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    788 CTAGCCAAACTAATATGAATGACCTT         TTTCAGGTATGTCCC
        ||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||
 158083 CTAGCCAAACTAATATGAATGACCTTGTA...CAGTTTCAGGTATGTCCC

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    829 AAAAGTCTGTGTGTGTCTACTCCTGGACATCGCACTGATCTTTTTCAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164797 AAAAGTCTGTGTGTGTCTACTCCTGGACATCGCACTGATCTTTTTCAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    879 GGATCCTAAAAATGTACTGATAACTGATTTCTTTGGAAGTGTACGGAAAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164847 GGATCCTAAAAATGTACTGATAACTGATTTCTTTGGAAGTGTACGGAAAG

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    929 TGGAAATTACAACAGAGACTATTAAATTGCAACAGGATTCAGAAATCATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 164897 TGGAAATTACAACAGAGACTATTAAATTGCAACAGGATTCAGAAATCATG

   1050     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    979 GAAAGCAG         CTATAAGGAAGACCAGATGGATGAGAAACTAAT
        ||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||
 164947 GAAAGCAGGTA...CAGCTATAAGGAAGACCAGATGGATGAGAAACTAAT

   1100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1020 GGAACCTCTGAAATATGCTGAACAACTTCCTGTAGCTCAGATAATACACC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197077 GGAACCTCTGAAATATGCTGAACAACTTCCTGTAGCTCAGATAATACACC

   1150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1070 AG         AAACCGAAGCTGAAAGACTGGCATCCTCCTGGGGGCTTT
        ||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 197127 AGGTT...CAGAAACCGAAGCTGAAAGACTGGCATCCTCCTGGGGGCTTT

   1200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
   1111 ATTCTGGGATTATGGGCACTTATTATCATGGTTTTCTTCAAAACTTATGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 226952 ATTCTGGGATTATGGGCACTTATTATCATGGTTTTCTTCAAAACTTATGG

   1250     .    :    .    :    .
   1161 AATTAAGCATATGAAGTTCATTTTT
        |||||||||||||||||||||||||
 227002 AATTAAGCATATGAAGTTCATTTTT