seq1 = pF1KE6358.tfa, 978 bp
seq2 = pF1KE6358/gi568815586r_56261228.tfa (gi568815586r:56261228_56462190), 200963 bp

>pF1KE6358 978
>gi568815586r:56261228_56462190 (Chr12)

(complement)

1-16  (99446-99461)   100% ->
17-978  (100002-100963)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGACTGGACTGTGTG         GGTACTCTGCTCCAGACATGCGTGG
        ||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||||||||||||||
  99446 ATGACTGGACTGTGTGGTA...TAGGGTACTCTGCTCCAGACATGCGTGG

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     42 CCTCAGACTCATCATGATACCAGTTGAGCTGCTACTTTGCTACCTCCTGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100027 CCTCAGACTCATCATGATACCAGTTGAGCTGCTACTTTGCTACCTCCTGC

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 TGCACCCTGTGGATGCCACTTCATATGGAAAGCAGACAAATGTCTTGATG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100077 TGCACCCTGTGGATGCCACTTCATATGGAAAGCAGACAAATGTCTTGATG

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 CACTTTCCCTTGTCCTTGGAATCCCAGACACCCTCCTCAGACCCCTTGTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100127 CACTTTCCCTTGTCCTTGGAATCCCAGACACCCTCCTCAGACCCCTTGTC

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    192 CTGCCAATTTCTGCACCCAAAGTCACTGCCTGGTTTCAGCCACATGGCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100177 CTGCCAATTTCTGCACCCAAAGTCACTGCCTGGTTTCAGCCACATGGCCC

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    242 CTCTACCCAAGTTCTTGGTAAGCCTGGCTCTAAGGAATGCCCTGGAGGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100227 CTCTACCCAAGTTCTTGGTAAGCCTGGCTCTAAGGAATGCCCTGGAGGAA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    292 GCTGGTTGTCAGGCTGATGTTTGGGCTCTACAGCTACAGCTCTACCGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100277 GCTGGTTGTCAGGCTGATGTTTGGGCTCTACAGCTACAGCTCTACCGCCA

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    342 GGGTGGTGTGAATGCTACACAGGTCCTCATCCAGCATCTTCGAGGGCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100327 GGGTGGTGTGAATGCTACACAGGTCCTCATCCAGCATCTTCGAGGGCTCC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    392 AGAAAGGCAGAAGCACAGAGAGGAACGTGTCAGTGGAAGCCCTGGCCTCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100377 AGAAAGGCAGAAGCACAGAGAGGAACGTGTCAGTGGAAGCCCTGGCCTCT

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    442 GCTCTGCAGCTGTTAGCCAGGGAGCAGCAAAGCACAGGAAGGGTCGGGCG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100427 GCTCTGCAGCTGTTAGCCAGGGAGCAGCAAAGCACAGGAAGGGTCGGGCG

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    492 CTCCCTCCCGACAGAGGACTGTGAGAATGAGAAGGAGCAAGCTGTGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100477 CTCCCTCCCGACAGAGGACTGTGAGAATGAGAAGGAGCAAGCTGTGCACA

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    542 ATGTAGTCCAGCTGCTGCCAGGAGTGGGAACCTTCTACAACCTGGGCACA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100527 ATGTAGTCCAGCTGCTGCCAGGAGTGGGAACCTTCTACAACCTGGGCACA

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    592 GCTTTGTATTATGCTACTCAAAACTGCCTGGGCAAGGCCAGGGAACGAGG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100577 GCTTTGTATTATGCTACTCAAAACTGCCTGGGCAAGGCCAGGGAACGAGG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    642 CCGAGATGGGGCCATAGATCTGGGATATGACCTTCTGATGACCATGGCTG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100627 CCGAGATGGGGCCATAGATCTGGGATATGACCTTCTGATGACCATGGCTG

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    692 GGATGTCAGGGGGGCCTATGGGTCTAGCGATCAGTGCTGCACTTAAACCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100677 GGATGTCAGGGGGGCCTATGGGTCTAGCGATCAGTGCTGCACTTAAACCT

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    742 GCATTAAGGTCTGGGGTTCAGCAGTTGATCCAGTATTACCAAGATCAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100727 GCATTAAGGTCTGGGGTTCAGCAGTTGATCCAGTATTACCAAGATCAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    792 AGACGCAAACATCTCTCAGCCGGAGACCACCAAGGAGGGTTTGAGGGCCA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100777 AGACGCAAACATCTCTCAGCCGGAGACCACCAAGGAGGGTTTGAGGGCCA

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    842 TCTCAGATGTGAGTGACTTGGAAGAAACAACTACTCTGGCTTCTTTCATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100827 TCTCAGATGTGAGTGACTTGGAAGAAACAACTACTCTGGCTTCTTTCATA

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    892 TCAGAAGTAGTAAGTTCAGCTCCCTACTGGGGGTGGGCCATAATCAAGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100877 TCAGAAGTAGTAAGTTCAGCTCCCTACTGGGGGTGGGCCATAATCAAGAG

    950     .    :    .    :    .    :    .
    942 CTATGACTTAGATCCTGGGGCTGGGAGTCTTGAGATA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 100927 CTATGACTTAGATCCTGGGGCTGGGAGTCTTGAGATA