seq1 = pF1KE6347.tfa, 981 bp
seq2 = pF1KE6347/gi568815591f_72869814.tfa (gi568815591f:72869814_73442894), 573081 bp

>pF1KE6347 981
>gi568815591f:72869814_73442894 (Chr7)

1-57  (458616-458672)   100% ->
58-175  (458762-458879)   100% ->
176-265  (459547-459636)   100% ->
266-468  (460337-460539)   100% ->
469-588  (461844-461963)   100% ->
589-783  (470825-471019)   99% ->
784-893  (471460-471569)   100% ->
894-981  (472994-473081)   100%

      0     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
      1 ATGGGGGGAAGCGCGTTAAACCAGGGAGTCCTGGAAGGGGACGACGCCCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 458616 ATGGGGGGAAGCGCGTTAAACCAGGGAGTCCTGGAAGGGGACGACGCCCC

     50     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     51 CGGCCAG         TCCCTGTACGAGCGGTTAAGTCAGAGGATGCTGG
        |||||||>>>...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||
 458666 CGGCCAGGTG...CAGTCCCTGTACGAGCGGTTAAGTCAGAGGATGCTGG

    100     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
     92 ACATCTCGGGGGACCGGGGCGTGCTGAAGGACGTCATCCGAGAAGGAGCT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 458796 ACATCTCGGGGGACCGGGGCGTGCTGAAGGACGTCATCCGAGAAGGAGCT

    150     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    142 GGAGACCTAGTGGCGCCTGATGCTTCGGTGCTAG         TGAAATA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||
 458846 GGAGACCTAGTGGCGCCTGATGCTTCGGTGCTAGGTA...TAGTGAAATA

    200     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    183 CTCGGGATACCTGGAACACATGGACAGACCCTTCGATTCTAATTACTTTA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 459554 CTCGGGATACCTGGAACACATGGACAGACCCTTCGATTCTAATTACTTTA

    250     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    233 GGAAAACTCCTCGGCTAATGAAACTTGGAGAGG         ATATTACA
        |||||||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||||||
 459604 GGAAAACTCCTCGGCTAATGAAACTTGGAGAGGGTA...CAGATATTACA

    300     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    274 CTGTGGGGCATGGAGCTGGGCCTTCTGAGCATGCGGAGAGGAGAGCTGGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460345 CTGTGGGGCATGGAGCTGGGCCTTCTGAGCATGCGGAGAGGAGAGCTGGC

    350     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    324 CAGGTTTCTGTTCAAACCGAACTACGCCTATGGAACGCTGGGCTGCCCTC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460395 CAGGTTTCTGTTCAAACCGAACTACGCCTATGGAACGCTGGGCTGCCCTC

    400     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    374 CCTTGATCCCCCCAAACACCACTGTCCTGTTTGAGATTGAGCTGCTTGAC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460445 CCTTGATCCCCCCAAACACCACTGTCCTGTTTGAGATTGAGCTGCTTGAC

    450     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    424 TTCCTGGACTGTGCTGAGTCAGACAAGTTTTGTGCTCTCTCAGCT     
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>..
 460495 TTCCTGGACTGTGCTGAGTCAGACAAGTTTTGTGCTCTCTCAGCTGTA..

    500     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    469     GAGCAGCAAGACCAATTTCCACTTCAGAAGGTCCTGAAAGTGGCAG
        .>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 460545 .CAGGAGCAGCAAGACCAATTTCCACTTCAGAAGGTCCTGAAAGTGGCAG

    550     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    515 CTACGGAACGGGAGTTTGGCAACTACCTTTTCCGCCAGAATCGTTTCTAT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 461890 CTACGGAACGGGAGTTTGGCAACTACCTTTTCCGCCAGAATCGTTTCTAT

    600     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    565 GATGCCAAAGTGAGATATAAAAGG         GCCCTGTTGCTTCTGCG
        ||||||||||||||||||||||||>>>...>>>||||| |||||||||||
 461940 GATGCCAAAGTGAGATATAAAAGGGTG...CAGGCCCTATTGCTTCTGCG

    650     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    606 CCGGCGATCAGCACCCCCTGAAGAGCAGCACCTGGTGGAGGCCGCCAAGC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 470842 CCGGCGATCAGCACCCCCTGAAGAGCAGCACCTGGTGGAGGCCGCCAAGC

    700     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    656 TTCCTGTTCTCCTGAACCTGTCCTTTACATACCTGAAGCTAGACCGACCC
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 470892 TTCCTGTTCTCCTGAACCTGTCCTTTACATACCTGAAGCTAGACCGACCC

    750     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    706 ACCATAGCCCTGTGCTATGGAGAGCAGGCTTTGATCATTGACCAAAAGAA
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 470942 ACCATAGCCCTGTGCTATGGAGAGCAGGCTTTGATCATTGACCAAAAGAA

    800     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    756 TGCCAAGGCCCTCTTCAGGTGTGGACAG         GCTTGTCTTCTCC
        ||||||||||||||||||||||||||||>>>...>>>|||||||||||||
 470992 TGCCAAGGCCCTCTTCAGGTGTGGACAGGTG...CAGGCTTGTCTTCTCC

    850     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    797 TGACTGAGTATCAAAAGGCCCGGGATTTTCTAGTTCGAGCCCAGAAGGAG
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 471473 TGACTGAGTATCAAAAGGCCCGGGATTTTCTAGTTCGAGCCCAGAAGGAG

    900     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    847 CAACCCTTCAATCATGACATCAATAATGAGCTGAAGAAACTGGCTAG   
        |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||>>>
 471523 CAACCCTTCAATCATGACATCAATAATGAGCTGAAGAAACTGGCTAGGTG

    950     .    :    .    :    .    :    .    :    .    :
    894       CTGTTACAGGGACTATGTGGATAAAGAGAAAGAAATGTGGCACC
        ...>>>||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 471573 ...CAGCTGTTACAGGGACTATGTGGATAAAGAGAAAGAAATGTGGCACC

   1000     .    :    .    :    .    :    .    :
    938 GCATGTTCGCGCCCTGTGGCGATGGTTCTACAGCAGGAGAAAGT
        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 473038 GCATGTTCGCGCCCTGTGGCGATGGTTCTACAGCAGGAGAAAGT